工业蛋白质组学 在生物技术和制药中的应用 典藏版PDF电子书下载

第一章 蛋白质组学的基本概念 1

前言 2

经典和功能蛋白质组学中的蛋白质组操作方法 5

蛋白质纯化 5

二维电泳的蛋白质分离 11

蛋白质加工 15

蛋白质鉴定 16

蛋白质组学当前面临的挑战 38

参考文献 43

第二章 蛋白质 蛋白质相互作用绘图 51

前言 51

方法说明 52

实验设计 62

结论 65

参考文献 66

第三章 蛋白质翻译后修饰：质谱分析磷酸化位点 69

前言 69

实验 70

结果 72

结论 82

致谢 82

参考文献 83

第四章 高通量晶体学方法与计算机方法用于基于结构的药物设计 87

引言 87

高通量构建体的选择、克隆和微量筛选 89

蛋白质表达 89

高通量机器人纳量体积的结晶和成像 90

高通量X射线数据收集 92

结构测定和优化 94

数据追踪 95

结构分析 95

对接 97

药物设计 100

结构预测 101

组织蛋白酶B（cathepsin B）抑制剂的设计 102

参考文献 103

第五章 氢/氘交换质谱在高通量蛋白质结构分析中的应用 107

前言 108

蛋白质结构和动力学分析中的氢/氘交换理论 108

氢/氘交换技术综述 110

氢/氘交换结合裂解分析方法的应用 119

结论 125

参考文献 126

第六章 蛋白质组学技术用于蛋白质药靶的识别与鉴定 130

引言 130

用于药靶发现的工具 131

验证 137

信息学 139

结论 141

参考文献 141

第七章 应用蛋白质组学方法发掘生物标志物 147

前言 147

基于质谱的蛋白质组学方法 149

磷酸化蛋白质组分析 152

蛋白质复合体和信号通路 153

基于亲和标记的质谱方法 155

定量蛋白质组学 160

疾病机制与疾病诊断学 164

生物标志物在新药研发中的应用 165

总结 168

参考文献 169

第八章 工业化规模人血浆的蛋白质组学分析 175

前言 175

工业化规模的定义 176

样本的选择、收集和随机混合 177

高丰度蛋白质的去除 178

低分子质量蛋白质和高分子质量蛋白质 178

基于凝胶的蛋白质分离 179

整体蛋白和肽段的分离 179

质谱 181

生物信息学 182

结论 183

致谢 183

参考文献 183

第九章 化学基因组学：靶标展示 185

简介：化学遗传学和化学基因组学 185

化学基因组学技术 186

讨论和结论 194

参考文献 195

第十章 蛋白质组生物信息学 198

引言 198

从基因组到蛋白质组——数据复杂性增加所引发的挑战 200

复杂混合物和质谱分析——数据 201

自动化和高通量 204

蛋白质序列数据库：全面性和冗余性 205

减少样品和数据复杂性的策略 207

促进大规模功能蛋白质组学分析的数据仓库整合策略 209

架起实验结果和生物信息学之间的桥梁 210

蛋白质组学数据的交换 213

总结和展望 213

致谢 214

参考文献 214

第十一章 蛋白质芯片 217

引言 217

芯片的配置 218

固相芯片与液相芯片 218

蛋白质固定表面的优化 221

点样技术 222

检测技术 223

内容物 224

表达谱 226

总结和展望 229

参考文献 230

索引 234