导论 1
一 明清之际的中西会通 1
二 吴渔山研究的学术史 4
三 本书立论依据和资料基础 7
上编 吴渔山生平及其时代 17
第一章 家世及早年经历 17
一 名贤后裔 17
二儒学之师承 22
三 诗画琴书之师承 29
四 潦倒生涯 39
五 北京之行 46
第二章 遗民身世 52
一 新一代遗民 52
二 遗民志节 62
三 遗民心声 68
四 与南明的关系 76
五 体恤民艰 85
第三章 人生信仰的转折 90
一 师友与佛道 90
二 游于佛道 95
三 专注天学 104
四 学道三巴 114
五 天君泰然 124
第四章 天学之师 133
一 晋铎金陵 133
二 十年海上 141
三 秉铎疁城上 147
四 秉铎疁城下 158
五 最后岁月 167
下编 吴渔山的华化天学 183
第五章 天学与儒学 183
一 伦理之间 185
二 概念之间 199
三 词义之间 216
第六章 天学与佛道 225
一 天学与佛教 226
二 天学与道教 235
三 天学与民间宗教 246
第七章 天学与中国文学 253
一 天学诗 254
二 天学散曲 268
三 天学文 280
第八章 天学与中国书画 289
一 扎根于中国文化的土壤 290
二 载道与传道 299
三 中西画比较研究 306
第九章 对天主教义的表述 314
一 三位一体与基督论 314
二 圣事与七克 322
三 救世论与末世论 339
第十章 中西文化交流的其他方面 348
一 自然科学与仪器 348
二 语言与音乐 354
三 风俗与物品 364
结论 369
参考文献 373
图版 395
图版一《练川名人画像》卷下吴渔山像 395
图版二 吴渔山《湖天春色图》 396
图版三 吴渔山《墨井草堂消夏图》（局部） 397
图版四 墨井道人《三巴集》第三页 398
图版五 墨井道人《三馀集》第九页 399
图版六 吴历《写忧集》首页 400
图版七 吴渔山《墨井诗钞》首页 400
图版八 吴渔山《岑蔚居产芝图》题跋及题咏 401
图版九 吴渔山《除夕二首》、《元旦二首》书影 402
图版十 吴渔山《致王石谷尺牍》 403
图版十一 吴渔山墓碑拓片 404
后记 405