真菌门［Fungi］ 1
藻菌纲［Phycomycetes］ 2
前毛菌目［Hyphochytriales］ 3
前毛油壶菌科［Anisolpidiaceae］ 3
内根壶菌科［Rhizidiomycetaceae］ 3
丝壶菌科［Hyphochytriaceae］ 3
壶菌目［Chytridiales］ 3
油壶菌科［Olpidiaceae］ 5
邻绵霉科［Achlyogetonaceae］ 7
集壶菌科［Synchytriaceae］ 7
根壶菌科［Rhizidiaceae］ 8
内囊壶菌科［Entophlyctaceae］ 10
节壶菌科［Physodermataceae］ 11
歧壶菌科［Cladochytriaceae］ 11
芽枝菌目［Blastocladiales］ 13
链囊芽枝菌科［Catenariaceae］ 14
雕蚀菌科［Coelomomycetaceae］ 15
芽枝菌科［Blastocladiaceae］ 15
单毛菌目［Monoblepharidales］ 15
单毛菌科［Monoblepharidaceae］ 16
根肿菌目［Plasmodiophorales］ 16
根肿菌科［Plasmodiophoraceae］ 16
水霉目［Saprolegniales］ 20
硅藻壶菌科［Ectrogellaceae］ 20
破囊壶菌科［Thraustochytriaceae］ 20
水霉科［Saprolegniaceae］ 20
水节霉科［Leptomitaceae］ 25
水节霉目［Leptomitales］ 25
囊轴霉科［Rhipidiaceae］ 26
链壶菌目［Lagenidiales］ 26
伏鲁宁菌科［Woroninaceae］ 27
拟油壶菌科［Olpidiopsidaceae］ 27
链油壶菌科［Sirolpidiaceae］ 27
根生链壶菌科［Lagenidiaceae］ 27
霜霉目［Peronosporales］ 28
腐霉科［Pythiaceae］ 29
霜霉科［Peronosporaceae］ 44
白锈菌科［Albuginaceae］ 57
毛霉目［Mucorales］ 58
内囊霉科［Endogonaceae］ 59
毛霉科［Mucoraceae］ 60
水玉霉科［Pilobolaceae］ 75
枝霉科［Thamnidiaceae］ 77
头珠霉科［Piptoeephalidaceae］ 79
梳霉科［Kickxellaceae］ 81
被孢霉科［Mortierellaceae］ 84
小克银汉霉科［Cunninghamellaceae］ 89
笄霉科［Choanephoraceae］ 90
虫霉目［Entomophthorales］ 92
捕虫霉科［Zoopagaceae］ 92
蛙粪霉科［Basidiobolaceae］ 93
虫霉科［Entomophthoraceae］ 93
地位未定的目 98
原子囊菌目［Protomycetales］ 98
原子囊菌科［Protomycetaceae］ 98
钩孢毛菌科［Harpellaceae］ 99
钩孢毛菌目［Harpellales］ 99
毛菌亚纲［Trichomycetidae］ 99
地位未定的藻菌亚纲 99
内孢毛菌目［Asellariales］ 100
内孢毛菌科［Asellariaceae］ 100
侧孢毛菌目［Genistellales］ 100
侧孢毛菌科［Genistellaceae］ 100
变形虫毛菌目［Amoebidiales］ 100
变形虫毛菌科［Amoebidiaceae］ 100
副变形虫毛菌科［Paramoebidiaceae］ 100
外毛菌目［Eccrinales］ 100
外毛菌科［Eccrinaceae］ 100
裂丝外毛菌科［Palavasciaceae］ 100
子囊菌纲［Ascomycetes］ 101
酵母目［Endomycetales］ 102
半子囊菌亚纲［Hemiascomycetes］ 102
酵母科［Saccharomycetaceae］ 103
鞭子菌亚科［Nematosporioideae］ 103
脂肪酵母亚科［Lipomycetoideae］ 103
酵母亚科［Saccharomycetoideae］ 105
酱霉科［Ascoideaceae］ 111
内孢霉科［Endomycetaceae］ 111
蚀精霉科［Spermophthoraceae］ 112
隐球酵母科［Cryptococcaceae］ 114
红酵母亚科［Rhodotoruloideae］ 114
隐球酵母亚科［Cryptococcoideae］ 114
毛孢酵母亚科［Trichosporoideae］ 117
掷孢酵母科［Sporobolomycetaceae］ 117
外囊菌目［Taphrinales］ 118
外囊菌科［Taphrinaceae］ 118
多腔菌目［Myriangiales］ 121
真子囊菌亚纲［Euascomycetes］ 121
沙卡氏菌科［Saccardiaceae］ 122
胶囊腔菌科［Atichiaceae］ 122
痂囊腔菌科［Elsinoaceae］ 122
多腔菌科［Myriangiaceae］ 127
曲霉目［Eurotiales］ 129
裸囊菌科［Gymnoascaceae］ 129
球囊菌科［Ascosphaeriaceae］ 131
头囊菌科［Cephalothecaceae］ 132
曲霉科［Eurotiaceae］ 132
甲爪团囊菌科［Onygenaceae］ 135
大团囊菌科［Elaphomycetaceae］ 135
微囊菌目［Microascales］ 136
长喙霉科［Ceratocystaceae］ 136
座囊菌目［Dothideales］ 139
隐囊菌科［Dothioraceae］ 140
多胞菌科［Pleosporaceae＝假球壳菌科（Pseudosphaeriaceae)］ 141
煤炱菌科［Capnodiaceae］ 161
座囊菌科［Dothideaceae］ 162
小盾座菌目［Microthyriales］ 180
点盾座菌科［Stigmateaceae］ 180
多口座菌科［Polystomellaceae］ 181
拟小盾座菌科［Micropeltaceae＝半球壳菌科（Hemisphaeriaceae)］ 181
拟毛盾座菌科［Trichopeltaceae］ 182
小盾座菌科［Microthyriaceae］ 182
毛盾座菌科［Trichothyriaceae］ 182
纵裂壳菌目［Hysteriales］ 182
纵裂壳菌科［Hysteriaceae］ 182
胶壳菌科［Englerulaceae］ 183
白粉菌科［Erysiphaceae］ 183
白粉菌目［Erysiphales］ 183
拟粉孢霉亚科［Oidiopsideae］ 184
球针白粉菌亚科［Phyllactineae］ 184
白粉菌亚科［Erysipheae］ 184
小煤炱菌科［Meliolaceae］ 191
小虫囊菌目［Laboulbeniales］ 193
角虫囊菌科［Ceratomycetaceae］ 194
小虫囊菌科［Laboulbeniaceae］ 194
多精虫囊菌科［Peyritschiellaceae］ 194
鹿角菌目［Xylariales＝球壳菌目（Sphaeriales)］ 194
长喙壳菌科［Ceratostomataceae］ 195
毛壳菌科［Chaetomiaceae］ 196
粪壳菌科［Sordariaceae］ 197
圆孔壳菌科［Amphisphaeriaceae］ 199
扁孔黑壳菌科［Lophiostomataceae］ 201
日规壳菌科［Gnomoniaceae］ 202
黑痣菌科［Phyllachoraceae］ 206
穿皮壳菌科［Diatrypaceae＝蕉孢球壳菌科（Allantosphaeriaceae)］ 208
冠囊菌科［Coronophoraceae］ 209
棒囊菌科［Coryneliaceae］ 210
腐皮壳菌科［Diaporthaceae］ 210
麦角菌科［Clavicipitaceae］ 217
鹿角菌科［Xylariaceae］ 221
肉座菌目［Hypocreales］ 226
肉座菌科［Hypocreaceae］ 227
线孢盘菌目［Ostropales］ 238
线孢盘菌科［Ostropaceae］ 238
柔膜菌目［Helotiales］ 239
地舌菌科［Geoglossaceae］ 240
星裂盘菌科［Phacidiaceae］ 241
皮盘菌科［Dermateaceae］ 244
圆盘菌科［Orbiliaceae］ 250
明盘菌科［Hyaloscypbaceae］ 250
柔膜菌科［Helotiaceae］ 251
核盘菌科［Sclerotiniaceae］ 254
盘菌目［Pezizales］ 267
盘菌科［Pezizaceae］ 267
马鞍菌科［Helvellaceae=Elvellaceae］ 272
块菌目［Tuberales］ 273
块菌科［Tuberaceae］ 274
担子菌纲［Basidiomycetes］ 277
蕉孢亚纲［Teliosporae］ 278
锈菌目［Uredinales］ 278
无柄锈菌科［Melampsoraceae］ 278
柄锈菌科［Pucciniaceae］ 294
半知锈菌［UredinalesImperfocti］ 331
黑粉菌目［Ustilaginales］ 334
黑粉菌科［Ustilaginaceae］ 334
杯黑粉菌科［Graphiolaceae］ 346
异担子菌亚纲［Heterobasidiae］ 347
木耳目［Auriculariales］ 347
隔担子耳科［Septobasidiaceae］ 347
木耳科［Auriculariaceae］ 349
皮生耳科［Phleogenaceae=Pilacraceae］ 351
银耳目［Tremellales］ 352
链担子菌科［Sirobasidiaceae］ 352
银耳科［Tremellaceae］ 353
被担子菌科［Hyaloriaceae］ 353
花耳科［Dacryomycetaceae］ 354
花耳目［Dacryomycetales］ 354
杜氏耳目［Tulasnellales］ 356
同担子菌亚纲［Homobasidiae］ 356
外担子菌目［Exobasidiales］ 356
外担子菌科［Exobasidiaceae］ 356
多孔菌目［Polyporales］ 359
革菌科［Thelephoraceae］ 359
珊瑚菌科［Clavariaceae］ 362
鸡油菌科［Cantharellaceae］ 365
齿菌科［Hydnaceae］ 365
多孔菌科［Polyporaceae］ 367
伞菌目［Agaricales］ 378
牛肝菌亚目［Boletineae］ 378
松塔牛肝菌科［Strobilomycetaceae］ 379
牛肝菌科［Boletaceae］ 381
伞菌亚目［Agaricineae］ 382
伞菌科［Agaricaceae,］ 383
伞菌亚目分科［Agaricineae］ 385
腹菌目［Hymenogastrales］ 393
原腹菌科［Protogastraceae］ 394
半腹菌科［Hemigastraceae］ 394
轴腹菌科［Hydnangiaceae］ 395
灰包菇科［Secotiaceae］ 395
黑腹菌科［Melanogastraceae］ 395
腹菌科［Hymenogastraceae］ 395
纵裂腹菌科［Hysterangiaceae］ 396
鬼笔菌目［Phallales］ 397
笼头菌科［Clathraceae］ 398
鬼笔菌科［Phallaceae］ 398
灰包菌目［Lycoperdales］ 399
灰包菌科［Lycoperdaceae］ 400
地星菌科［Geastraceae］ 401
灰锤菌科［Tulostomataceae］ 402
轴灰包菌科［Podaxaceae］ 402
硬皮马勃菌目［Selerodermatales］ 403
硬皮马勃菌科［Sclerodermataceae］ 403
鸟巢菌目［Nidulariales］ 403
砂包菌科［Arachniaceae］ 403
鸟巢菌科［Nidulariaceae］ 404
弹球菌科［Sphaerobolaceae］ 404
半知菌类（不完全菌）［FungiImperfecti］ 405
球壳孢目［Sphaeropsidales=Phomales=Phyllostictales］ 406
球壳孢科［Sphaeropsidaceae］ 406
类肉座菌科［Nectrioidaceae］ 454
半壳孢科［Leptostromataceae］ 456
裂壳孢科［Excipulaceae］ 460
黑盘孢目［Melanconiales］ 463
黑盘孢科［Melanconiaceae］ 463
丛梗孢目［Moniliales］ 487
丛梗孢科［Moniliaceae］ 487
暗梗孢科［Dematiaceae］ 534
束梗孢科［Stilbaceae］ 598
瘤座孢科［Tuberculariaceae］ 602
螺旋孢霉科［Helicosporaceae］ 642
无孢菌群［MyceliaSterilia］ 645
参考文献 650
真菌中名索引 664
真菌学名索引 721
寄主中名索引 772