1.概述 1
1.1.基本概念 1
1.2.历史沿革 2
1.3.样品预处理的现状 3
1.4.DNA芯片的类型和制作 4
1.5.芯片的杂交和反应 6
1.6.芯片的检测和结果运算 10
1.7.生物芯片的应用 12
参考文献 15
2.DNA芯片或基因芯片 16
2.1.生物芯片的制作方法 16
2.1.1.对载体的要求 16
2.1.3.载体的活化 17
2.1.2.载体材料 17
2.1.4.生物芯片的制作方法 19
2.1.5.制作生物芯片常用的工具 19
2.1.6.DNA样品的来源 21
2.1.7.点点法制作低密度DNA芯片 29
2.1.8.分子印章法高密度DNA原位合成法 30
2.1.9.光导向空间定位的化学合成法 31
2.1.10.用半导体光刻法合成高密度寡核苷酸芯片 33
参考文献 36
2.2.微流路生物分析仪 36
2.2.1.硅片的微加工技术 37
2.2.2.纳升级DNA分析芯片 40
2.2.3.PCR芯片 42
2.2.4.蛋白质分析芯片 43
2.2.5.样品处理芯片 45
2.2.6.电寻址导向式DNA芯片 46
2.2.7.血气检测芯片 47
参考文献 48
2.3.探针的革新和发展 49
2.3.1.分枝探针技术 49
2.3.2.分子信标 64
2.3.3.肽核酸 73
参考文献 80
2.4.目标基因片段体外扩增方法的进展 84
2.4.1.PCR技术的有关进展 84
2.4.2.PCR以外的扩增技术 90
参考文献 92
2.5.生物芯片的扫读 92
2.5.1.芯片扫描仪的测定原理与特性 93
2.5.2.自己组装搭建芯片扫描装置(DIY) 99
2.5.3.芯片扫描测定中应注意的几个问题 100
参考文献 101
2.6.生物芯片的数据处理 102
2.6.1.图像分析和数据提取 103
2.6.2.芯片数据信息的管理 108
2.6.3.芯片数据的分析 109
参考文献 114
3.其他生物芯片 116
3.1.蛋白质的芯片分析 116
3.1.1.蛋白质组研究 116
3.1.2.蛋白质芯片作表达物的筛选 117
3.1.3.双链DNA芯片与相关蛋白质的作用 117
3.2.1.表面等离子体共振原理 118
3.2.Biacore技术 118
参考文献 118
3.1.4.芯片微流路蛋白质分析 118
3.2.2.Biacore技术分析生物分子的相互作用原理 120
3.2.3.Biacore产品及应用 122
参考文献 124
3.3.丝网印刷技术 125
3.3.1.原理及工艺 125
3.3.2.应用 126
参考文献 129
4.应用 130
4.1.芯片测序及基因图绘制 130
4.1.1.DNA序列测定 131
4.1.2.基因图的绘制 133
4.1.3.基因多态性检测 134
4.1.4.SBH存在问题 136
参考文献 137
4.2.基因表达分析 138
4.2.1.cDNA微阵列芯片定量研究芥菜(Arabidopsis thaliana)的基因表达方式 139
4.2.2.平行的人基因分析 142
4.2.3.DNA微阵列芯片 145
4.2.4.用全基因组寡核苷酸阵列平行分析基因的选择 146
4.2.5.酵母微阵列芯片用于全基因平行分析 150
4.2.6.微阵列芯片表观差异分析 154
参考文献 156
4.3.克隆选择及文库筛选 157
4.3.1.对cDNA文库进行分类 157
4.3.2.对噬菌体文库进行分析 161
4.3.3.对其他文库进行分析 163
参考文献 163
4.4.生物芯片在基因突变检测及在遗传病和肿瘤诊断中的应用 164
4.4.1.基因突变 165
4.4.2.基因突变检测技术 166
4.4.3.DNA芯片在检测突变中的应用 170
4.4.4.突变检测在遗传病诊断中的应用 172
4.4.5.突变检测在肿瘤诊断中的应用 176
参考文献 181
4.5.基因芯片在微生物菌种鉴定及致病机制中的应用 184
4.5.1.利用基因芯片技术研究感染病毒基因组 185
4.5.2.监测感染宿主细胞基因表达改变、研究病毒致病机制 186
4.5.3.利用基因芯片杂交图像进行细菌基因分型与菌种鉴定，筛选监测细菌抗药性基因 187
4.5.4.前景与展望 190
参考文献 190
4.6.生物芯片在其他医学方面的应用 191
4.6.1.炎症相关基因的观察 191
4.6.2.双链DNA芯片用于研究DNA-蛋白相互作用 192
4.6.3.生物芯片在水质控制方面的应用 193
参考文献 193
4.7.生物芯片在药物研究中的应用 194
4.7.1.药物筛选 194
4.7.2.遗传药理学与合理用药 197
4.7.3.毒理学研究 198
参考文献 198
4.8.生物芯片在农林业中的应用 199
参考文献 201
4.9.1.概述 202
4.9.2.研究进展 206
4.9.生物芯片和生物传感器在军事医学中的应用 210
5.发展和展望 217
6.生产生物芯片及相关设备的厂商，服务及供应内容 219