第一章 绪论 1
第一节 微生物 1
一、微生物的概念 1
二、微生物的认识和利用 2
第二节 微生物学 3
一、微生物学及其分支学科 3
二、微生物学主要分支学科简介 3
第三节 微生物学发展简史 5
一、微生物学的早期发展 5
二、近代微生物学的发展 7
三、分子遗传学的发展 8
第四节 微生物学展望 9
第二章 原核微生物 11
第一节 细菌 12
一、细菌的菌体形态 12
二、细菌的大小 15
三、细菌细胞结构 16
四、细菌的群体（菌落）形态 42
五、细菌的繁殖 43
六、细菌与疾病 44
第二节 放线菌 46
一、放线菌的形态结构 46
二、放线菌的菌落特征 47
三、放线菌的繁殖 48
第三节 蓝细菌 49
一、蓝细菌的形态和结构 49
二、蓝细菌的繁殖 51
第四节 其他原核微生物 51
一、立克次氏体 51
二、支原体 52
三、衣原体 54
四、螺旋体 56
五、粘细菌 57
第五节 古菌 58
一、古菌的细胞结构 58
二、古菌的主要类群 60
第三章 真核微生物 65
第一节 真菌 65
一、真菌的形态及细胞结构 65
二、真菌的繁殖 76
第二节 粘菌 88
一、粘菌的形态 88
二、粘菌的生活周期 90
三、粘菌的培养 91
第三节 原生动物和藻类 92
一、原生动物 92
二、藻类 97
第四章 病毒 101
第一节 病毒的形态结构 103
一、病毒的形态 103
二、病毒的结构 104
三、病毒的化学组成 110
四、病毒的包含体 113
五、病毒的分类 113
第二节 原核生物病毒—噬菌体 114
一、噬菌体的形态结构 114
二、噬菌体的生活周期 115
第三节 真核生物病毒 124
一、脊椎动物病毒 124
二、植物病毒 131
第四节 亚病毒 135
一、类病毒 136
二、卫星因子 136
三、朊病毒 137
第五章 微生物的营养 138
第一节 微生物细胞的化学成分和营养要素 138
一、微生物细胞的化学组成 138
二、营养物质及其功能 141
第二节 微生物的营养类型 145
一、光能无机自养型 146
二、光能有机异养型 146
三、化能无机自养型 147
四、化能有机异养型 147
第三节 营养物质的吸收 149
一、吸收营养的机制 149
二、吸收营养的方式 150
第四节 培养基 154
一、培养基的类型 154
二、培养基的配制原则 158
第六章 微生物的代谢 161
第一节 微生物的能量代谢 161
一、ATP的结构及其生成 162
二、微生物的氧化方式 165
三、能量的利用 169
第二节 微生物的分解代谢 169
一、己糖的分解 169
二、丙酮酸代谢的多样性 176
第三节 微生物的合成代谢 180
一、无机养分的同化 180
二、细胞结构大分子物质的合成 184
三、微生物的次生代谢 188
第七章 生长与环境条件 195
第一节 生长的定义和测定方法 195
一、细菌生长的定义和测定方法 196
二、细菌的群体生长及生长曲线 201
三、二次生长、同步生长和连续培养 204
四、真菌的生长 204
第二节 环境条件对微生物生长的影响 209
一、温度（包括灭菌） 209
二、水分和渗透压 217
三、酸碱度 219
四、氧和氧化还原电位 220
五、辐射 223
六、化学杀菌剂和抑菌剂 224
第八章 微生物遗传 232
第一节 遗传的物质基础 232
一、DNA的结构 233
二、DNA的复制 237
三、转录 237
四、翻译 241
第二节 原核生物的基因重组 242
一、转化 242
二、转导 246
三、接合作用 249
四、染色体外遗传物质的转移 254
第三节 真菌的基因重组 257
一、有性生殖 258
二、准性生殖 259
三、线粒体遗传 261
第四节 重组DNA技术 262
一、目的基因的克隆 262
二、重组体的筛选 265
三、DNA的人工合成和扩增 266
四、基因的定位诱变 267
第九章 微生物的突变和诱变育种 271
第一节 微生物的突变 271
一、基因突变 271
二、基因突变的机制 274
三、DNA损伤的修复 277
第二节 诱发突变及诱变剂 279
一、化学诱变剂 279
二、物理诱变剂 281
三、生物诱变剂 281
第三节 突变体的选择和检出 282
一、基因的突变延迟 282
二、突变体的筛选 283
第四节 微生物诱变育种 289
一、自发突变育种 290
二、诱变育种 291
三、原生质体融合 295
第五节 菌种的退化、复壮和保藏 297
一、菌种退化的观察 297
二、菌种的复壮 298
三、菌种的保藏 299
第十章 微生物生态学 303
第一节 生态系统 303
一、生物圈和生态系统 303
二、生态系统的维持—物质流和能量流 304
三、微生物生态系统及其特点 305
第二节 微生物在自然界中的分布 306
一、土壤圈及其微生物 306
二、水圈中的微生物 310
三、大气中的微生物 311
四、极端环境中的微生物 312
五、动物体中的微生物 314
六、植物体中的微生物 315
第三节 微生物与生物环境之间的关系 321
一、中立关系 321
二、互生关系 321
三、共生关系 322
四、对抗关系 322
第四节 微生物生态学研究方法 323
一、土壤中微生物生物量的测定 323
二、微生物多样性研究技术 323
三、土壤微生物的原位研究 324
第十一章 微生物在自然界物质循环中的作用 325
第一节 碳素循环 326
一、碳素循环的途径 326
二、微生物在碳水化合物分解中的作用 327
第二节 氮素循环 329
一、氮素循环的途径 329
二、含氮化合物的分解 331
三、生物固氮作用 333
第三节 硫、磷等元素的循环 335
一、硫素循环 335
二、磷素循环 338
三、其他元素的循环 339
第四节 微生物在生物成矿中的作用 339
第十二章 微生物在农业中的应用 341
第一节 微生物肥料 341
一、根瘤菌肥料 341
二、固氮菌肥料 344
三、菌根菌制剂 346
四、植物根际促生细菌肥 347
第二节 微生物农药 348
一、微生物杀虫剂 349
二、微生物杀菌剂 353
三、微生物除草剂 355
第三节 有机废物处理和土壤净化 356
一、堆肥 356
二、沼气发酵 360
三、污水处理 362
四、土壤净化 368
第四节 微生物在发酵工业中的应用 372
一、在酿酒生产中的应用 374
二、在醇类、溶剂类生产中的应用 376
三、在有机酸生产中的应用 376
四、在氨基酸生产中的应用 377
五、在酶制剂生产中的应用 378
六、在维生素生产中的应用 379
七、在抗生素生产中的应用 380
第五节 微生物在食品加工中的应用 381
一、微生物在食品生产中的应用 381
二、微生物与食品保藏 385
第六节 食用菌 388
一、食用菌促进农业生态系统的良性循环 388
二、食用菌的营养价值与药用价值 389
三、常见食用菌简介 390
第十三章 微生物的系统发育及分类 394
第一节 微生物的分类单元和命名 395
一、微生物的多层次分类单元 395
二、双名法和命名原则 397
第二节 细菌的分类方法 398
一、传统分类法 399
二、化学分类法 399
三、数值分类法 401
四、遗传分类法 402
第三节 细菌的分类系统和常见细菌类群 409
一、细菌的分类系统 409
二、常见细菌类群 410
第四节 真菌分类系统及常见真菌类群 416
一、真菌分类方法及分类系统 416
二、常见真菌类群的代表 419
第十四章 农业微生物学实验指导 437
实验一 显微镜的使用及微生物的检测 438
实验二 细菌的简单染色和革兰氏染色 441
实验三 细菌的芽孢染色和荚膜染色 443
实验四 细菌的运动观察及鞭毛染色 445
实验五 培养基的制备及灭菌方法 447
实验六 细菌及放线菌培养特征观察 450
实验七 丝状真菌形态及其菌落形态观察 453
实验八 酵母菌形态观察及大小的测量 455
实验九 显微镜直接计量微生物细胞的数量 457
实验十 营养元素对微生物生长的影响 459
实验十一 微生物细胞数量的平板培养计数法 460
实验十二 自生固氮菌的分离 465
实验十三 从豆科植物根瘤中分离根瘤菌 466
实验十四 酒精发酵作用 468
附录Ⅰ 教学常用培养基 470
附录Ⅱ 教学常用染色剂和封片剂 475
附录Ⅲ 教学常用消毒剂 475
附录Ⅳ 教学常用菌种 479
参考文献 481