第1部分 简介 3
第1章 定义生物信息学与结构生物信息学 3
第2章 蛋白质结构基础原理 11
第3章 DNA和RNA结构基础原理 29
第4章 高通量结晶技术与高分子结构解析中的计算技术 53
第5章 生物大分子结构解析与NMR波谱技术 63
第6章 电镜 84
第7章 分子图形学 99
第2部分 数据描述和数据库 115
第8章 PDB、 mmCIF及其他数据格式 115
第9章 PROTEIN DATA BANK 130
第10章 核酸数据库 144
第11章 其他基于结构的数据库 158
第3部分 比较特征 175
第12章 蛋白质结构进化和SCOP数据库 175
第13章 CATH数据库 183
第14章 结构质量验证 198
第15章 全原子接触：一个确认结构的新方法 221
第16章 结构比较与比对 232
第4部分 结构和功能测定 247
第17章 二级结构测定 247
第18章 识别蛋白质中的结构域 265
第19章 从蛋白质结构推测其功能 281
第5部分 蛋白质相互作用 299
第20章 从进化信息预测蛋白质-蛋白质相互作用 299
第21章 静电相互作用 311
第6部分 作为药物靶标的蛋白质 323
第22章 对接的原理、方法及配体设计 323
第23章 结构信息学与药物发现 350
第7部分 结构预测 369
第24章 CASP和CAFASP实验及其发现 369
第25章 同源建模 374
第26章 折叠类型识别方法 385
第27章 从头预测方法 401
第28章 一维预测：二级结构、跨膜螺旋以及溶剂可及性 410
第8部分 未来 437
第29章 结构基因组 437