第1章 简介 1
第2章 系统生物学中的基本概念 14
第一部分 生物网络的重建 31
第3章 代谢网络 31
第4章 转录调控网络 56
第5章 信号传导网络 77
第二部分 重建网络的数学表达式 95
第6章 化学计量矩阵的基本特性 95
第7章 拓扑性质 115
第8章 化学计量矩阵的基本子空间 127
第9章 化学计量矩阵的右零空间 147
第10章 化学计量矩阵的左零空间 167
第11章 化学计量矩阵的行列空间 184
第三部分 重构网络的能力 193
第12章 双重因果关系 193
第13章 解空间的属性 217
第14章 采样解空间 247
第15章 发现功能状态 265
第16章 参数灵敏度 287
第17章 结语 306
附录一 术语和缩写 312
附录二 大肠杆菌核心代谢网络 321
参考文献 327
索引 353
译后记 363