序&许宁生 1
上编 3
要做时间的主人 3
第一次…… 7
引用率低说明了什么？ 10
道德底线干细胞研究试探中 12
我国生物信息学教育的发展与挑战 14
宏观生物学与交叉学科人才培养的理念与实践 20
生命的节拍 25
倘若生命失去节律 31
从战争中学习战争 33
美丽实用的分子进化 35
人类与病毒共舞 39
分子进化 41
番木瓜的故事 53
学会“与流感共舞” 57
西藏，已不再遥远 62
进化论与进化生物学的发展 64
达尔文进化论的科学本质与贡献 71
进化论的分子时代 76
世界之巅上的断思 84
生物信息学专业规划的理念与实践 87
从艰苦中提取欢乐——访植物学家钟扬教授 95
生命之树常青 103
“影响因子”与科研创新无关 107
生命的高度 110
中国适应性生存与可持续发展 112
获得，还是失去，这是个进化问题 121
播种未来（钟扬院长文字配音稿） 125
创新文化是一种“试错”文化 127
怎样真正提升研究生的能力 130
原创的，就是世界的——钟扬教授专访 137
在我失联的日子里 144
复旦博学文库（第一辑）总序 150
研究生培养质量提升的解决之道 152
弘扬劳模精神 培育创新人才 158
一个招办主任儿子的高考 161
复旦博学文库（第二辑）总序 166
钟扬老师给家长的一封信 168
达尔文进化论过时了吗？ 170
基因密码——生命与哲学 175
教育最重要的是释放学生的学习力 183
我和科学队长 190
世界屋脊上的种子收集者 192
下编 201
钟扬教授各学术领域代表性论文 201
Ⅰ．生物数据模型与信息系统 201
荷花品种的数量分类研究 203
Data model and comparison and query methods for interacting classifications in a taxonomic database 217
HICLAS：a taxonomic database system for displaying and comparing biological classification and phylogenetic trees（摘要） 244
PlantQTL-GE：a database system for identifying candidate genes in rice and Arabidopsis by gene expression and QTL information（摘要） 245
PBmice：an integrated database system of piggyBac（PB）insertional mutations and their characterizations in mice（摘要） 246
MPSS：an integrated database system for surveying a set of proteins（摘要） 247
Ⅱ．分子进化分析方法及应用 248
Testing hybridization hypotheses based on incongruent gene trees 250
Detecting evolutionary rate heterogeneity among mangroves and their close terrestrial relatives 278
The Schistosoma japonicum genome reveals features of host-parasite interplay（摘要） 293
Solution structure of Urm1 and its implications for the origin of protein modifiers（摘要） 294
Molecular evolution of the SARS coronavirus during the course of the SARS epidemic in China（摘要） 295
Photosynthetic metabolism of C-3 plants shows highly cooperative regulation under changing environments：A systems biological analysis（摘要） 296
Ⅲ．生物多样性与植物基因组分析 297
Discovery of a high-altitude ecotype and ancient lineage of Arabidopsis thaliana from Tibet 299
The genome and transcriptome of Trichormus sp.NMC-1：insights into adaptation to extreme environments on the Qinghai-Tibet Plateau 308
Testing the effect of the Himalayan mountains as a physical barrier to gene flow in Hippophae tibetana Schlect.（Elaeagnaceae）（摘要） 336
Genetic diversity and population structure of Lamiophlomis rotata（Lamiaceae），an endemic species of Qinghai-Tibet Plateau（摘要） 337
Fine- and landscape-scale spatial genetic structure of cushion rockjasmine，Androsace tapete（Primulaceae），across southern Qinghai-Tibetan Plateau（摘要） 338
Genetic diversity in Primula obconica from Central and South-west China as revealed by ISSR markers（摘要） 339
附：钟扬教授学术论文总目 340
钟扬教授著作选摘 372
Ⅰ．专业著作 372
《数量分类的方法与程序》前言 372
《分支分类的理论与方法》前言 374
《简明生物信息学》前言 376
Ⅱ．专业译著 378
《水生植被研究的理论与方法》编译前言 378
《延续生命》译者的话 380
Ⅲ．科普著作 382
《基因计算》后记 382
Ⅳ．科普译著 386
《林肯的DNA》译后记 386
《大流感》译后记 388
《DNA博士》译后记 391
Ⅴ．科普译著审校 395
《造就适者》导读：证据的力量 395
附：钟扬教授著作总目 398