综合情况 3
中国科学院领导集体 3
中国科学院院设委员会 4
中国科学院院部机关机构 5
中国科学院院属机构变更 9
综述 10
规划与战略 20
科研管理 26
重大科技成果 33
队伍建设与人才培养 62
基础设施与支撑条件 66
科技成果转移转化与对外合作 82
国际合作 89
基本建设 97
党群工作与创新文化 99
科学传播 103
中国科学院2016年大事记 106
学部与院士工作 131
中国科学院学部领导机构 131
2016年中国科学院院士名单 135
2016年中国科学院外籍院士名单 139
2016年逝世的中国科学院院士名单 142
2016年逝世的中国科学院外籍院士名单 143
中国科学院第十八次院士大会情况 144
咨询评议工作 145
科学道德建设 146
学术与出版工作 147
科学普及与教育工作 148
陈嘉庚科学奖基金会工作 149
院直属单位情况 153
分院机构 153
北京分院（筹） 153
沈阳分院 156
长春分院 158
上海分院 160
南京分院 163
武汉分院 165
广州分院 167
成都分院 169
昆明分院 171
西安分院 173
兰州分院 176
新疆分院 178
科研机构 181
数学与系统科学研究院 181
物理研究所 183
理论物理研究所 185
高能物理研究所 187
力学研究所 189
声学研究所 190
理化技术研究所 192
化学研究所 194
国家纳米科学中心 196
生态环境研究中心 197
过程工程研究所 200
地理科学与资源研究所 202
国家天文台 204
遥感与数字地球研究所 207
地质与地球物理研究所 208
青藏高原研究所 210
古脊椎动物与古人类研究所 212
大气物理研究所 214
植物研究所 216
动物研究所 217
心理研究所 220
微生物研究所 221
生物物理研究所 223
遗传与发育生物学研究所 225
北京基因组研究所 226
计算技术研究所 228
软件研究所 230
半导体研究所 232
微电子研究所 234
电子学研究所 236
自动化研究所 237
电工研究所 239
工程热物理研究所 241
国家空间科学中心 242
光电研究院 244
自然科学史研究所 246
科技战略咨询研究院 248
信息工程研究所 250
空间应用工程与技术中心 251
北京综合研究中心 252
天津工业生物技术研究所 254
山西煤炭化学研究所 256
大连化学物理研究所 257
金属研究所 259
沈阳应用生态研究所 261
沈阳自动化研究所 262
海洋研究所 264
青岛生物能源与过程研究所 266
烟台海岸带研究所 268
长春光学精密机械与物理研究所 269
长春应用化学研究所 271
东北地理与农业生态研究所 273
上海微系统与信息技术研究所 275
上海技术物理研究所 277
上海光学精密机械研究所 279
上海硅酸盐研究所 281
上海有机化学研究所 283
上海应用物理研究所 284
上海天文台 286
上海生命科学研究院 288
上海药物研究所 291
上海高等研究院 293
宁波材料技术与工程研究所 295
福建物质结构研究所（海西研究院） 297
城市环境研究所 299
南京地质古生物研究所 300
南京土壤研究所 302
南京地理与湖泊研究所 304
紫金山天文台 305
苏州纳米技术与纳米仿生研究所 308
苏州生物医学工程技术研究所 310
合肥物质科学研究院 312
武汉岩土力学研究所 314
武汉物理与数学研究所 316
武汉病毒研究所 318
测量与地球物理研究所 319
水生生物研究所 321
武汉植物园 323
南海海洋研究所 324
华南植物园 327
广州能源研究所 329
广州地球化学研究所 330
广州生物医药与健康研究院 332
深圳先进技术研究院 334
亚热带农业生态研究所 336
成都生物研究所 337
成都山地灾害与环境研究所 339
光电技术研究所 341
重庆绿色智能技术研究院 343
昆明动物研究所 345
昆明植物研究所 347
西双版纳热带植物园 349
地球化学研究所 350
西安光学精密机械研究所 352
国家授时中心 354
地球环境研究所 355
近代物理研究所 357
兰州化学物理研究所 359
寒区旱区环境与工程研究所（西北生态环境资源研究院） 360
青海盐湖研究所 363
西北高原生物研究所 364
新疆理化技术研究所 366
新疆生态与地理研究所 368
学校及公共支撑单位 370
中国科学院大学 370
中国科学技术大学 372
计算机网络信息中心 375
文献情报中心 376
其他机构 380
中国科学报社 380
行政管理局 381
青岛疗养院 384
庐山疗养院 385
院直接投资的全资及控股企业 387
中国科学院国有资产经营有限责任公司 387
联想控股股份有限公司 391
中科实业集团（控股）有限公司 391
东方科仪控股集团有限公司 393
中国科技出版传媒集团有限公司 395
中国科技产业投资管理有限公司 397
北京中科科仪股份有限公司 397
北京中科院软件中心有限公司 399
中科院建筑设计研究院有限公司 401
北京中科资源有限公司 402
中国科学院沈阳计算技术研究所有限公司 404
中国科学院沈阳科学仪器股份有限公司 405
中科院南京天文仪器有限公司 407
中科院广州化学有限公司 408
中科院广州电子技术有限公司 409
中国科学院成都有机化学有限公司 410
中科院成都信息技术股份有限公司 411
成都中科唯实仪器有限责任公司 412
中科院科技服务有限公司 413
上海碧科清洁能源技术有限公司 414
深圳中科院知识产权投资有限公司 415
国科嘉和（北京）投资管理有限公司 416
截至2016年底院设非法人单元列表 418