卷一 清代前期台湾历史 3
论施琅《台湾弃留利弊疏》的背景与动机——兼谈清初台湾的官庄及武职占垦问题 3
论雍正年间台湾“番”地开垦和移民渡台政策的变化——以《巡台录》为中心 26
分巡台湾道“兼督船政”考——兼答林文龙先生 44
冒籍：清代台湾的科举移民 56
迁台移民与福建祖籍原乡、原族之关系 69
卷二 晚清台湾历史 85
同治初年戴潮春的八卦会起义 85
“牡丹社事件”——1874年日本出兵侵台始末 106
丁日昌的治台政绩——兼论光绪初年闽抚“冬春驻台”之例 145
晚清台湾电报的创办及割台后中日间之交涉 166
卷三 光复后台湾历史 181
台湾光复初期的经济问题——兼论“二·二八”事件之起因 181
若使甲兵真可洗，与君同上决天河——记“二·二八”前后的闽台建设协进会 197
卷四 台湾民间信仰 211
季麒光与清初台湾的妈祖信仰 211
早期台湾移垦之环境与保生大帝信仰 219
乾隆二年妈祖加封“天后”辨误 227
卷五 台湾地方文献 237
大陆馆藏台湾早期方志的发掘与整理——以蒋毓英《台湾府志》和尹士俍《台湾志略》为例 237
《清威略将军吴英事略》研究——版本、内容与问题 245
吴英《行间纪遇》研究——版本与内容 259
卷六 附录 275
论《三国演义》与关帝信仰的形成 275
论闽南地区的重商倾向与海外贸易——一个区域文化历史的考察 282
大陆台湾史研究30年的回顾与感想 292
参考文献 302