第一部分 基因克隆和DNA分析的基本原理 1
第1章 为什么说基因克隆与DNA分析非常重要 2
1.1 遗传学的早期发展 2
1.2 基因克隆和聚合酶链反应（PCR）的出现 2
1.3 什么是基因克隆 3
1.4 什么是PCR 3
1.5 为什么基因克隆和PCR如此重要 6
1.6 如何使用这本书 9
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第2章 基因克隆的载体——质粒和噬菌体 11
2.1 质粒 11
2.2 噬菌体 15
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第3章 从活细胞中纯化DNA 23
3.1 全细胞DNA的制备 23
3.2 质粒DNA的制备 32
3.3 噬菌体DNA的制备 38
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第4章 DNA纯化后的利用 44
4.1 DNA操作酶的范围 44
4.2 切割DNA的酶——限制性内切酶 49
4.3 连接——将DNA分子连接到一起 61
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第5章 将DNA引入活细胞 72
5.1 转化——使细菌细胞获取DNA 74
5.2 重组体的鉴定 76
5.3 将噬菌体DNA引入细菌细胞 80
5.4 重组噬菌体的鉴别 84
5.5 将DNA引入非细菌细胞 84
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第6章 大肠杆菌的克隆载体 89
6.1 基于大肠杆菌质粒的克隆载体 89
6.2 基于λ噬菌体的克隆载体 94
6.3 用于合成单链DNA的克隆载体 101
6.4 其他细菌的克隆载体 103
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第7章 真核生物的克隆载体 105
7.1 酵母和其他真菌的载体 105
7.2 高等植物的克隆载体 111
7.3 动物的克隆载体 120
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第8章 怎样获得特定基因的克隆 125
8.1 筛选的难题 125
8.2 直接筛选目的基因 127
8.3 从基因文库中鉴定克隆 129
8.4 鉴定克隆的方法 131
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第9章 聚合酶链反应（PCR） 145
9.1 PCR简介 145
9.2 PCR的更多细节 147
9.3 PCR之后的工作——研究PCR产物 151
9.4 实时定量PCR可对起始原料的数量进行量化 155
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第二部分 基因克隆和DNA分析在研究中的应用 159
第10章 基因和基因组的测序 160
10.1 链终止DNA测序 160
10.2 第二代测序法 166
10.3 如何进行基因组测序 172
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第11章 基因表达和功能的研究 180
11.1 基因的RNA转录产物的研究 180
11.2 基因表达调控的研究 186
11.3 鉴定和研究克隆基因的翻译产物 193
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第12章 基因组研究 201
12.1 基因组注释 201
12.2 转录物组和蛋白质组的研究 209
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第三部分 基因克隆和DNA分析在生物技术中的应用 219
第13章 克隆基因的表达 220
13.1 在大肠杆菌中的外源基因表达载体 222
13.2 在大肠杆菌中表达重组蛋白存在的问题 228
13.3 真核细胞中重组蛋白的表达 231
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第14章 基因克隆和DNA分析在医学中的应用 238
14.1 重组药物的生产 238
14.2 人类疾病相关基因的识别和鉴定 249
14.3 基因治疗 254
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第15章 基因克隆和DNA分析在农业中的应用 258
15.1 植物基因工程中的基因添加 258
15.2 基因消减 268
15.3 转基因植物的问题 270
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第16章 基因克隆和DNA分析在法医学和考古学中的应用 275
16.1 利用DNA分析鉴定犯罪嫌疑人 275
16.2 利用DNA指纹图谱分析血缘关系 278
16.3 通过DNA分析进行性别鉴定 281
16.4 古遗传学——利用DNA研究人类进化 283
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术语表 290