第一章 高通量测序的概念和发展 1
第一节 NGS的发展 2
第二节 长读长的NGS测序 5
第三节 NGS测序在临床和科研中的应用 9
小结 14
参考文献 14
第二章 肺癌流行病学和靶向治疗 19
第一节 肺癌的诊断 20
第二节 肺癌的常见靶向治疗 21
第三节 其他靶向治疗 29
小结 31
参考文献 32
第三章 NGS在肺癌分子病理及其诊断决策中的应用 35
第一节 NGS对肺癌分子病理学及诊断的检测分析 36
第二节 临床应用对NGS检测的要求 40
参考文献 43
第四章 NGS研究肺癌异质性和肿瘤进化 45
第一节 肿瘤异质性和肿瘤进化 46
第二节 研究肺癌异质性及进化的意义 51
参考文献 53
第五章 NGS发现罕见突变基因 55
第一节 肺腺癌罕见突变基因 56
第二节 肺鳞癌罕见突变基因 59
第三节 小细胞癌罕见突变基因 60
第四节 香烟暴露与肺癌基因组改变 61
参考文献 62
第六章 NGS发现肺癌基因表达异常 65
第一节 肺鳞癌基因表达异常 66
第二节 肺腺癌基因表达异常 69
第三节 小细胞肺癌基因表达异常 69
参考文献 70
第七章 NGS指导治疗决策和鉴定肿瘤耐药机制 73
第一节 肺癌基因组学研究的主要内容及其临床意义 75
第二节 NGS鉴定肺癌耐药机制 78
第三节 NGS促进肺癌的研究和治疗 87
附：NCCN关于NSCLC指导用药的参考 91
参考文献 94
第八章 NGS指导肺癌免疫治疗 99
第一节 免疫治疗概述 100
第二节 过继性T细胞治疗和CAR-T 101
第三节 使用NGS助力肿瘤反应性T细胞鉴定肿瘤特异性抗原 104
第四节 NGS指导免疫治疗 109
小结 111
参考文献 112
第九章 NGS和cfDNA辅助肺癌诊断和治疗 115
第一节 cfDNA的基本概念和特性 116
第二节 cfDNA的NGS测序方法 118
第三节 cfDNA突变检测技术 123
第四节 cfDNA在肺癌领域的最新进展 124
参考文献 129
第十章 肺癌单细胞NGS测序的意义和进展 133
第一节 单细胞测序方法 134
第二节 单细胞测序的临床研究 139
小结 140
参考文献 140
第十一章 人体微生物测序在肺癌诊疗中的研究和发展 143
第一节 NGS和微生物研究 144
第二节 肠道微生物、口腔微生物和肺部微生物 146
第三节 微生物对肺癌发生和治疗的影响 148
参考文献 149
附录 经典病例 151
关键词索引 169