1 基因组 1
1.1 遗传的分子基础 2
1.2 基因组顺序复杂性 12
1.3 基因与基因家族 15
1.4 染色体 17
1.5 基因组 19
2 遗传图绘制 21
2.1 遗传图与物理图 22
2.2 遗传作图标记 23
2.3 遗传作图的方法 25
2.4 人类遗传图 35
3 物理图绘制 37
3.1 限制性作图 38
3.2 基于克隆的基因组作图 42
3.3 荧光标记原位杂交 46
3.4 顺序标签位点(STS)作图 48
3.5 人类基因组物理图 52
4 基因组测序与序列组装 55
4.1 DNA测序的方法学 56
4.2 DNA顺序的组装 62
4.3 基因组测序的其他路线 68
4.4 人类基因组的测序与组装 69
5 基因组序列诠释 74
5.1 搜寻基因 75
5.2 基因功能预测 78
5.3 从基因组到细胞 88
6 基因组解剖 95
6.1 真核生物基因组解剖 96
6.2 原核生物基因组解剖 103
6.3 转座因子与分散重复顺序 106
6.4 串接重复顺序及其分布 111
6.5 人类基因组草图顺序中的编码基因 111
6.6 拟南芥基因组编码基因 114
7 基因的转录调控 118
7.1 原核生物基因的转录 119
7.2 真核生物基因的转录 124
7.4 DNA结合黄蛋白在基因转录调控中的作用 136
7.3 古细菌基因的表达调控 136
8 RNA的修饰与加工 145
8.1 细胞中的RNA组分 146
8.2 mRNA的加工 147
8.3 非编码RNA的加工 160
8.4 RNA前体内部的化学修饰与加工 163
8.5 RNA干涉 167
9 蛋白质组 170
9.1 tRNA在蛋白质合成中的作用 171
9.2 蛋白质合成中核糖体的作用 175
9.3 蛋白质翻译后加工 181
9.4 蛋白质周转 186
10 染色质结构与基因表达 191
10.1 核小体的结构与基因表达 192
10.2 位置效应 196
10.3 后生遗传与基因表达 200
10.4 基因表达与染色质重建 206
11 基因组的复制 214
11.1 DNA复制的问题 215
11.2 原核生物基因组的复制 217
11.3 真核生物核基因组的复制 222
11.4 细胞器基因组的复制 231
11.5 基因组复制的调控 234
12 基因组进化的分子基础 240
12.1 突变 241
12.2 重组 253
12.3 转座 260
13 基因组进化的模式 265
13.1 遗传系统的起源 266
13.2 新基因的产生 270
13.3 非编码顺序的扩张 280
13.4 比较基因组学 285
14 基因组与生物进化 291
14.1 分子系统发生学 292
14.2 分子系统发生学与生物进化 295
14.3 生物新特征的产生 305
名词解释 311