第一章 有机质谱在蛋白质组学中的应用 1
第一节 蛋白质组学的类型 2
一、表达蛋白质组学 2
二、功能蛋白质组学 3
三、结构蛋白质组学 3
第二节 蛋白质组学中的研究技术 3
一、样品的制备 3
二、蛋白质的分离 4
三、蛋白质的质谱鉴定 7
四、定量蛋白质组学 12
五、蛋白质组学的研究策略 17
第三节 蛋白质组学的主要应用 23
一、蛋白质表达谱的研究 23
二、蛋白质翻译后修饰的研究 23
三、蛋白质-蛋白质相互作用的研究 25
四、生物标志物的检测和分析 27
第四节 小结 32
参考文献 32
第二章 生物质谱在生物分子间非共价相互作用研究中的应用 37
第一节 概述 37
一、生物质谱的概况 37
二、生物分子间非共价相互作用研究手段的比较 39
三、生物质谱研究生物分子间非共价复合物的概况和进展 41
四、电喷雾质谱研究生物分子间非共价复合物的重要实验参数 43
第二节 蛋白质和其他生物分子的非共价相互作用的研究 44
一、蛋白质-蛋白质（多肽）的非共价相互作用的研究 44
二、蛋白质／多肽-小分子非共价相互作用的研究 45
三、多肽-金属离子复合物的研究 47
四、蛋白质的其他复合物 48
第三节 核酸和其他生物分子的非共价相互作用的研究 48
一、DNA和蛋白质的非共价相互作用研究 49
二、RNA和蛋白质非共价复合物的研究 50
三、DNA和小分子的非共价复合物研究 51
四、DNA-金属离子复合物的研究 52
参考文献 54
第三章 糖基化蛋白质的生物质谱分析 60
第一节 糖蛋白的特点 61
第二节 糖蛋白的生物质谱分析 63
一、质谱技术 63
二、糖蛋白的质谱分析 65
第三节 小结 71
参考文献 71
第四章 质谱技术在天然药物研究中的应用 73
第一节 分子量的确定 74
一、EI-MS及 CI-MS的应用 74
二、FAB-MS和ESI-MS的应用 75
第二节 串联质谱方法在天然产物结构分析中的应用 79
第三节 天然产物混合物的成分分析 90
一、天然产物混合物中已知成分的结构分析 91
二、在天然产物未知成分结构分析中的应用 91
三、在天然产物成分定量分析中的应用 96
第四节 小结 97
参考文献 97
第五章 质谱在组合化学研究中的应用 100
第一节 前言 100
一、组合化学基础 100
二、组合化学中的质谱分析法 100
第二节 质谱在组合化学库识别及反应跟踪中的应用 101
一、质谱在组合化合物库中的应用 102
二、MALDI-MS在组合化学反应跟踪中的应用 105
三、ESI-MS在组合化学反应跟踪中的应用 105
第三节 质谱在纯化组合化学库中的应用 107
第四节 质谱在化学库生物活性成分筛选中的应用 109
一、生物亲和筛选 110
二、筛选修饰过的蛋白质 112
三、催化剂的筛选 113
第五节 小结 114
参考文献 115
第六章 串联质谱技术与药代动力学和药物代谢研究 117
第一节 串联质谱技术的基本原理 117
第二节 串联质谱与色谱联用技术 121
一、LC-MS／MS联用系统的整合：API接口技术实现了液-质真正意义上的联用 122
二、LC-MS／MS接口技术的新进展 123
三、LC-MS／ MS与药物研究 124
第三节 串联质谱技术与药代动力学研究 124
一、新药研究与药代动力学 124
二、串联质谱技术在现代药代动力学研究中的作用 126
三、LC-MS／ MS在药代动力学研究中的定量策略 129
第四节 串联质谱技术在药物代谢研究中的应用 144
一、串联质谱技术确证代谢物结构的基本步骤 144
二、串联质谱技术在药物代谢产物结构确证中的应用 145
参考文献 149
附录 152
Ⅰ.缩写符号表 152
Ⅱ.有机质谱中常用同位素的精确质量和丰度 154