第一部分 基础理论 3
第一章 概述 3
第一节 基因组研究简介 3
第二节 蛋白质组 5
第三节 蛋白质组学的分类 7
第四节 蛋白质组学研究的用途 11
第二章 功能基因组学与蛋白质组学 18
第一节 人类基因组计划及功能基因组学 20
第二节 蛋白质组研究的开端及含义 35
第三章 双向凝胶电泳 41
第一节 概述 41
第二节 试剂、设备和溶液配制 51
第三节 实验操作 53
第四章 生物质谱 72
第一节 质谱的基本原理 73
第二节 生物质谱的软电离方式 75
第三节 常用质谱质量分析器 79
第四节 质谱法在蛋白质和多肽分析中的应用 82
第五节 质谱法对蛋白质和多肽一级结构的分析和鉴定 86
第五章 蛋白质芯片 93
第一节 概述 93
第二节 蛋白质芯片分析 98
第三节 蛋白质芯片的优缺点及展望 109
第六章 酵母双杂交系统 111
第一节 双杂交和其他双成分系统 111
第二节 酵母双杂交的原理及方法 117
第三节 酵母双杂交系统的发展 120
第四节 酵母双杂交系统的应用 126
第七章 非胶蛋白质组学 136
第一节 一维色谱与质谱联用 136
第二节 多维色谱分离技术 137
第三节 毛细管电泳-质谱联用 140
第八章 亚细胞蛋白质组学 143
第一节 概述 143
第二节 亚细胞结构的分离 146
第九章 生物信息学在蛋白质组研究中的应用 155
第一节 生物信息学简介 155
第二节 常见蛋白质数据库 159
第三节 生物信息学在蛋白质研究中的应用 161
第十章 蛋白质组学在医学中的应用 185
第一节 蛋白质组学在消化系统疾病方面的应用 186
第二节 蛋白质组学在生殖系统方面的应用 189
第三节 泌尿系肿瘤的蛋白质组研究 192
第四节 蛋白质组学在眼科方面的应用 193
第五节 血液系统疾病蛋白质组学研究进展 195
第六节 蛋白质组学在耳鼻咽喉科疾病机理研究中的应用 197
第七节 蛋白质组学在呼吸系统中的应用 199
第八节 医学检验方面的应用 200
第九节 蛋白质组学在其他方面的应用 203
第十节 总结与展望 204
第十一章 蛋白质组学在药学研究中的应用 207
第一节 蛋白质组学在药物作用靶点研究中的应用 207
第二节 药物作用机制研究及新药筛选 218
第三节 蛋白质组学在药物毒理学中的应用 226
第四节 蛋白质组学在中药现代化中的应用 230
第二部分 实际操作步骤 237
步骤1 样品的制备 237
步骤2 等电聚焦 247
步骤3 聚丙烯酰胺凝胶电泳 254
步骤4 凝胶染色 269
步骤5 凝胶的扫描和图像分析 273
步骤6 荧光差异凝胶电泳 278
步骤7 斑点切除 281
步骤8 样品褪色 283
步骤9 凝胶内消化 284
步骤10 微量脱盐和样品浓缩 284
步骤11 多肽消化物的化学衍生化 285
步骤12 质谱分析 286
步骤13 MALDI-TOF MS的标定 288
步骤14 数据库分析的准备 290
步骤15 PMF肽指纹图谱数据库检测 291
附录 故障排除 293