第一篇 概论 3
第1章 海洋微型生物生态学导论 3
1.1 什么是海洋微型生物 3
1.2 为什么要研究海洋微型生物生态学 4
参考文献 7
第2章 海洋微型生物研究历程 9
2.1 海洋微型生物研究三步曲 9
2.2 海洋微型生物研究的里程碑 14
参考文献 26
第3章 我国的海洋微型生物研究 32
3.1 我国海洋微型生物生态学研究简要历程 32
3.2 我国海洋微型生物生态学研究的重要认识 38
参考文献 57
第二篇 典型微型生物类群的生态学第4章 原绿球藻（Prochlorococcus） 69
4.1 原绿球藻的发现与分离培养 69
4.2 原绿球藻的细胞结构与生理特征 71
4.3 原绿球藻的自然生态学 77
4.4 原绿球藻的分子生态学 81
4.5 中国海的原绿球藻生态学 88
参考文献 95
第5章 聚球藻（Synechococcus） 101
5.1 聚球藻的细胞生理学 101
5.2 聚球藻的自然生态学 105
5.3 聚球藻的分子生态学 108
5.4 中国海的聚球藻生态学 119
参考文献 125
第6章 超微型真核生物（Pico-eukaryotes） 129
6.1 概述 129
6.2 最小的真核生物（Ostreococcus tauri） 131
6.3 球石藻（Coccolithophorid） 133
6.4 棕囊藻（Phaeocysits） 143
6.5 中国海的超微型真核自养生物生态学 148
参考文献 156
第7章 海洋异养细菌（Heterotrophic Bacteria） 163
7.1 概述 163
7.2 海洋异养细菌的主要类群 164
7.3 异养细菌在海洋生态系统中的作用与功能 168
7.4 中国海的异养细菌生态学 176
参考文献 190
第8章 海洋古菌（Marine Archaea） 194
8.1 概述 194
8.2 海洋古菌的生境及主要类群 200
8.3 中国海的浮游古菌生态学 208
参考文献 212
第9章 好氧不产氧光合异养菌（AAPB） 217
9.1 概述 217
9.2 海洋AAPB的生理特性与分子生物学特征 218
9.3 AAPB在海洋生态系统中的作用 229
9.4 中国海的AAPB生态学 231
参考文献 242
第10章 含视紫质浮游细菌 249
10.1 变形细菌视紫质的发现和功能特点 249
10.2 PR多样性 256
10.3 中国海的PR细菌研究 263
参考文献 269
第11章 浮游病毒（Planktonic Viruses/Phages） 272
11.1 概述 272
11.2 浮游病毒的基本结构及其主要类群 272
11.3 海洋浮游病毒的生态学研究 276
11.4 海洋浮游病毒的多样性 281
11.5 海洋浮游病毒的生态功能 286
11.6 中国海的浮游病毒生态学 291
参考文献 299
第12章 中国海微型生物的动态变化及其调控机制 304
12.1 边缘海的生态环境特征 305
12.2 微型生物的季节变动规律与影响因素 307
12.3 超微型生物的空间变动规律与环境调控机制 316
12.4 边缘海超微型生物类群间的关系与相互作用 326
12.5 边缘海超微型生物类群对人为活动的响应 330
参考文献 335
第三篇 微型生物的研究方法与技术第13章 海洋微型生物分离培养技术 341
13.1 海洋细菌的分离培养 341
13.2 超微型藻类的分离培养 345
13.3 微型生物种群生长与连续培养 349
13.4 海洋细菌的极限稀释培养及高通量筛选 353
参考文献 358
第14章 微型生物的生理生态学新技术 360
14.1 微型生物的流式细胞检测、分析、分选技术 360
14.2 微型生物粒径谱与流式细胞检测 370
14.3 海洋微型生物流式图像技术 371
14.4 海洋浮游细菌生物量的流式细胞测定技术 378
14.5 海洋浮游细菌细胞膜电位测定技术 386
14.6 时序红外显微数字化（TIREM）技术 397
14.7 微型生物的细胞活性测定技术 409
14.8 原子力显微镜技术在海洋微型生物研究中的应用 417
14.9 酶联放大-荧光原位杂交技术（CARD-FISH） 425
14.10 荧光原位杂交-微放射自显影技术（Micro-FISH） 430
14.11 海洋微型生物碳源利用分析技术 434
参考文献 439
第15章 海洋微型生物生态研究主要分子生物学技术 449
15.1 核糖体16S rRNA基因序列的扩增分析 449
15.2 变性梯度凝胶电泳（DGGE）和温度梯度凝胶电泳（TGGE） 454
15.3 末端限制性片段长度多态性分析（T-RFLP） 458
15.4 实时定量PCR技术 462
15.5 环境基因组学技术 466
15.6 原位PCR技术 470
15.7 分子系统发育分析 474
15.8 海洋微型生物群落蛋白质组学 478
参考文献 485
附录 489
第一部分 微型生物海上采样常规操作规程 489
第二部分 分子生态学操作规程 492
第三部分 海洋细菌常用的培养基配方 511
缩略语 519