第一章 传染病监测与检测研究概述 1
第二章 传染病症候群病原体分型变异研究概述 3
第三章 单个病毒病原体分型变异操作规程 10
第一节 流行性感冒病毒分型变异操作规程 10
第二节 呼吸道合胞病毒分型变异操作规程 16
第三节 副流感病毒分型变异操作规程 22
第四节 人冠状病毒分型变异操作规程 27
第五节 轮状病毒基因分型变异操作规程 32
第六节 乙型脑炎病毒分型变异操作规程 42
第七节 汉坦病毒分型变异操作规程 46
第八节 登革病毒分型变异操作规程 48
第九节 麻疹病毒分型变异操作规程 50
第十节 手足口病相关肠道病毒分型变异操作规程 54
第十一节 鼻病毒分型与测序操作规程 63
第十二节 病毒分型通用实验操作规程 70
第四章 单个细菌病原体分型变异操作规程 79
第一节 A族链球菌分型变异操作规程 79
第二节 沙门菌分型变异操作规程 81
第三节 志贺菌分型变异操作规程 94
第四节 肠出血性大肠杆菌O157：H7（EHEC O157：H7）分型变异操作规程 110
第五节 霍乱弧菌分型变异操作规程 117
第六节 副溶血弧菌分型变异操作规程 126
第七节 金黄色葡萄球菌分型变异操作规程 134
第八节 小肠结肠炎耶尔森菌分型变异操作规程 144
第九节 奈瑟氏菌分型变异操作规程 158
第十节 空肠弯曲菌分型变异操作规程 168
第十一节 肺炎克雷伯菌分型变异操作规程 174
第十二节 猪链球菌分型变异操作规程 179
第十三节 鲍曼不动杆菌分型变异操作规程 188
第十四节 气单胞菌分型变异操作规程 198
第十五节 常见病原细菌脉冲场凝胶电泳一般操作规程 207
第五章 单个寄生虫病原体分型变异操作规程 219
第一节 隐孢子虫基因分型变异操作规程 219
第二节 疟原虫耐药性相关基因检测操作规程 223
第六章 单个螺旋体病原体分型变异操作规程 227
伯氏疏螺旋体分型变异操作规程 227
第七章 未知病原体高通量筛查分型变异操作规程 234
第一节 病原体核酸的液态芯片高通量筛查检测操作规程 234
第二节 病原体核酸的二代测序鉴定操作规程 238
第八章 病原体耐药检测操作规程 247
第一节 产NDM-1泛耐药肠杆科细菌耐药检测操作规程 249
第二节 产KPC酶肠杆科细菌耐药检测操作规程 256
第三节 耐万古霉素肠球菌耐药检测操作规程 261
第四节 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌耐药检测操作规程 265
第五节 流感病毒耐药检测操作规程 267
第九章 分型变异录入信息登记表 271
细菌变异分型结果登记表 271
病毒变异分型结果登记表 275
寄生虫变异分型结果登记表 277
螺旋体变异分型结果登记表 278