第一篇 台湾的史前时代 3
第一章 从地质看台湾和大陆的关系 3
第二章 长滨文化的发现 6
第三章 台湾山胞的由来 8
第四章 从史前遗物看台湾和大陆的关系 13
第二篇 存疑的文献 19
第一章 夷洲和澶洲是台湾吗？ 19
第二章 三国孙权海军到过台湾吗？ 25
第三篇 隋唐时代的记述 31
第一章 隋炀帝两次派朱宽等探访流求 31
第二章 隋炀帝对流求的一次用兵 33
第三章 《隋书》流求国的描述 36
第四章 唐诗人施肩吾是否到过台湾？ 39
第四篇 宋代澎湖的开辟和中国主权的建立 45
第一章 《舆地纪胜》的记述 45
第二章 李复、陆游、梁克家、真德秀等人笔下的流求 47
第三章 汪大猷在澎湖的遣将屯军 51
第四章 澎湖始隶福建泉州晋江县管辖 53
第五章 台湾出土的宋代器物 56
第五篇 元代瑠求（台湾）、澎湖与中国大陆的交往 61
第一章 《文献通考》对台澎认识的退步 61
第二章 元代对瑠求的招谕 67
第三章 《岛夷志略》有关澎湖和巡检司的记述 73
第四章 彭湖巡检陈信惠 77
第五章 明初澎湖居民的撤移和巡检司的裁废 79
第六篇 明代中国航海图籍上所见台澎诸岛屿与针路 83
第一章 出现于《郑和航海图》上的平湖屿 83
第二章 《顺风相送》抄本中有关台澎的针路 90
（附）郑和或其他同时代出使人员来台澎的可能性 94
第三章 《郑开阳杂著》所记台澎附近各岛屿和针路 102
第四章 陈侃《使琉球录》记钓鱼屿等不属琉球 108
第五章 郑舜功《日本一鉴》确定钓鱼屿属于台湾 111
第六章 萧祟业、夏子阳两《使琉球录》附台湾附近各岛图及到琉球针路比较表 132
第七章 张燮《东西洋考》所记台澎针路 135
第七篇 明代倭寇在台湾及附近的侵扰和中国的防剿 141
第一章 总论明初以后倭寇在台湾海上的出没 141
第二章 林道乾、林凤等海上英豪的出现 144
第三章 钓鱼屿划入中国领海和防倭区域以内 153
第四章 “彭湖游”的设立和它的规模 159
第五章 日本对台湾的野心 163
第八篇 沈有容在台澎及附近的功绩 169
第一章 明末来台汉人与高山族人对倭寇的愤恨 169
第二章 沈有容歼灭侵台倭贼 175
第三章 沈有容谕退侵澎荷兰人 181
第四章 沈有容在白犬俘获倭奴 186
第五章 万历四十四年日本再谋取台湾 192
第六章 陈第所作最古的台湾实地考察报告 199
第九篇 明天启、崇祯间台澎海上风云 211
第一章 颜思齐（振泉）的开拓台湾 211
第二章 郑芝龙的兴起 219
第三章 明天启四年澎湖的收复 228
第十篇 荷兰人的侵占台湾 237
第一章 葡、西、荷、英人的海上竞逐 237
第二章 荷兰人所传授的“红毛字” 240
第三章 荷兰人的传教与教育事业 244
第四章 荷兰人的通商事业 250
第五章 荷兰人的农产事业 252
第六章 荷兰人的军事设施 261
第七章 荷据时代的寓贤沈光文 273
第八章 郭怀一的抗荷事件 280
第九章 明末清初台湾与咬？吧间针路 285
第十一篇 西班牙人的占据台湾北部 295
第一章 西班牙人来台的动机与计划 295
第二章 西班牙在鸡笼的传教工作与荷人初攻淡水 298
第三章 淡水山胞抗西运动与传教工作的扩展 303
第四章 西班牙人向宜兰推进 306
第五章 西班牙教士的淡水土著语著作 310
第六章 西班牙人被逐与教士的撤退 315
方杰人教授对台湾史研究的贡献&许雪姬 319