第1章 基因定位 1
单元1.1 连锁研究所需临床和流行病学资料的收集 3
单元1.2 家系选择和信息含量 11
单元1.3 单精子分型 17
单元1.4 采用LINKAGE软件包进行连锁分析 25
单元1.5 非模式依赖的遗传连锁检验 50
单元1.6 利用DNA池技术进行纯合子定位 65
单元1.7 疾病关联和基于家系的检验 69
单元1.8 基因-基因相互作用的分析 81
第2章 基因分型 88
单元2.1 基于PCR的基因分型方法 88
单元2.2 基于连接分析的分型方法 99
单元2.3 自动荧光的分型方法 103
单元2.4 用微阵列的方法分型单核苷酸多态 109
单元2.5 使用TAQMAN分析法的高通量基因分型 119
单元2.6 使用引物延伸荧光偏振探测法的高通量基因分型 121
第3章 体细胞杂交简介 127
单元3.1 体细胞杂交的构建 127
第4章 细胞遗传学 139
单元4.1 经培养外周血细胞的染色体制备 140
单元4.2 小鼠细胞染色体制备及核型分析 144
单元4.3 染色体显带技术 151
单元4.4 中期染色体和间期核的原位杂交 159
单元4.5 高分辨率FISH分析 167
单元4.6 多色荧光原位杂交（FISH）方法分析人类完全基因组 176
单元4.7 应用形态学抗体染色体技术确定细胞的表型与基因型 181
单元4.8 比较基因组杂交 196
第5章 大片段的克隆和分析 202
单元5.1 大范围限制性图谱：脉冲电场电泳 203
单元5.2 用杂交的方法筛选大片段插入的文库 209
单元5.3 胚胎将大片段插入DNA导人哺乳动物细胞和胚胎 219
单元5.4 BAC/PAC文库的构建 232
第6章 确定基因组DNA候选基因 246
单元6.1 基因鉴定：方法和注意事项 246
单元6.2 序列数据库：整体信息的检索和数据的提交 257
单元6.3 使用BLAST程序家族查找序列相似性 265
单元6.4 人类基因组的获取 280
单元6.5 使用Entrez来检索NCBI数据库 303
第7章 搜寻候选基因突变的方法 316
单元7.1 患病个体的序列扩增 317
单元7.2 通过单链构象多态性分析检测基因突变 321
单元7.3 毛细管电泳法分析单链构象多态性 323
单元7.4 应用基于荧光的自动化测序进行杂合体检测 328
单元7.5 用循环测序法检测突变 333
单元7.6 人类突变数据库 337
第8章 临床细胞遗传学 345
单元8.1 绒毛标本分裂中期染色体涂片制备 346
单元8.2 羊水标本的制备、培养和分析 349
单元8.3 用于染色体分析的妊娠产物及其他固体组织来源样本的培养及制备 357
单元8.4 姐妹染色单体互换（SCE）分析 361
单元8.5 利用石蜡包埋组织鉴定染色体非整倍体 365
单元8.6 羊水细胞用于间期核FISH分析的制备方法 369
单元8.7 范可尼贫血（先天性骨髓发育不全）的诊断——二氧桥丁烷（双环氧丁烷）检测 374
第9章 临床分子遗传学 380
单元9.1 运用多重PCR检测营养不良基因缺失 381
单元9.2 利用等位基因特异性寡聚核苷酸（Allelespecific oligonucleotide，ASO）同时检测多点突变 391
单元9.3 脆性X综合征的分子分析 394
单元9.4 肌强直性肌营养不良（myotonic dystrophin，DM）的三核苷酸重复的分析 399
单元9.5 非随机X染色体失活的检测 404
单元9.6 父子关系的分子分析 406
单元9.7 点突变不易扩增突变系统（简称ARMS）分析 415
单元9.8 线粒体DNA突变缺失氧化磷酸化疾病的分子分析 421
单元9.9 单细胞DNA和FISH分析应用于植入前基因诊断 434
单元9.10 蛋白质截短试验 447
单元9.11 载脂蛋白E（apolipoprotein E，APOE）基因型分析：不同方法间比较 456
第10章 癌基因组学 462
单元10.1 收获分裂中期的细胞对恶性肿瘤患者的血液标本进行细胞遗传学分析 463
单元10.2 实体瘤培养分裂中期细胞的收获和细胞遗传学分析 467
单元10.3 分子生物学方法分析白血病和非霍奇金氏淋巴瘤的DNA重组 470
单元10.4 肿瘤中基因扩增的分子分析 483
单元10.5 甲基化特异性PCR 490
第11章 转录谱 494
单元11.1 用于表达监测的寡核苷酸分析 494
单元11.2 用cDNA芯片分析人类基因表达 504
单元11.3 表达数据分析概述 514
第12章 基因治疗载体 519
单元12.1 基因转移载体的生物安全性问题 520
单元12.2 腺病毒载体 523
单元12.3 重组腺相关病毒载体的生产 538
单元12.4 反转录病毒载体的制备 546
单元12.5 假包膜型反转录病毒载体的制备 555
单元12.6 高滴定度慢病毒载体产物 558
单元12.7 构建复制缺陷型疱疹单纯病毒载体 564
单元12.8 应用辅助病毒缺陷HSV-1扩增载体进行基因传递 579
单元12.9 脂质体载体用于直接体内基因转染 587
第13章 基因治疗的转移系统 589
单元13.1 动脉的基因转移 590
单元13.2 基因传递到肌肉 598
单元13.3 脑的基因转移：间接体内法和直接体内法 606
单元13.4 人造血干细胞的培养、转导和分析 614
单元13.5 呼吸道基因给药 627
单元13.6 基因传递到肝脏 641
参考文献 826
附录1 试剂与溶液 644
附录2 有用的信息和数据 718
附录2A 人类重复DNA序列概述 718
附录2B ISCN标准核型模式图 720
附录2C 遗传连锁参考图谱：基于互联网资源的入口 737
附录2D 放射性同位素数据 738
附录2E 离心机和转子 739
附录3 常用技术 744
附录3A 从哺乳动物细胞中提取基因组DNA 744
附录3B DNA的抽提和沉淀 747
附录3C 从固定的石蜡包埋组织切片中制备DNA 749
附录3D 使用分光光度计和荧光分光光度计测定DNA和RNA的含量 751
附录3E DNA酶标记法 754
附录3F 变性聚丙烯酰胺凝胶电泳 757
附录3G Southern杂交法分析DNA 760
附录3H Northern杂交分析RNA 764
附录3I 哺乳动物细胞组织培养技术 767
附录3J 通过EB病毒转化建立恒定的细胞系 774
附录3K 核型分析 777
附录4 一些试剂和仪器提供商 779
索引 837