《G蛋白信号途径相关蛋白生物信息学 以禾谷炭疽菌为例》PDF下载

  • 购买积分:9 如何计算积分?
  • 作  者:韩长志,杨斌编著
  • 出 版 社:北京:科学出版社
  • 出版年份:2016
  • ISBN:9787030470980
  • 页数:167 页
图书介绍:炭疽菌属真菌包括约600个种,可以侵染3200多种单子叶植物和双子叶植物。作为该属中重要的病原菌之一,禾谷炭疽菌(Colletotrichumgraminicola(Cesati)Wilson)引起的玉米炭疽病在美国、印度等国家就非常普遍,该菌还可以侵染小麦、高粱等禾本科作物引起炭疽病,给各国农业生产造成巨大的经济损失。植物与病原菌互作过程中,众多细胞信号转导途径参与其中,现已明确G蛋白(Guaninenucleotidebindingprotein,鸟嘌呤核苷酸结合蛋白)信号途径是真核生物中最保守的信号传导机制之一。G蛋白信号调控因子(RGS)、磷酸肌醇特异磷脂酶C(PI-PLC)、腺苷酸环化酶(AC)作为Gα-GTP的效应分子,将信号进一步向下游传递,从而发挥着重要作用。GPCR作为G蛋白信号转导途径上接收外源信号、传递信号重要的表面受体,在植物与病原菌互作过程中发挥着诸多重要的作用。目前学术界尚缺乏对禾谷炭疽菌G蛋白信号途径较为系统性的论述,特别是在林下经济背景条件下,经济林木、花卉以及中药材等诸多植物炭疽病发生逐年增加,本研究工作为进一步开展同属于炭疽菌属但其基因组序列尚未公布

第一章 禾谷炭疽菌的研究进展 1

一、经济危害 1

(一)侵染植物种类多 1

(二)经济损失非常重 1

二、形态特征及分类地位 2

(一)形态特征 2

(二)分类地位 3

三、生活史及侵染过程 3

四、遗传关系 5

五、防治措施 9

(一)农业防治措施 9

(二)化学防治 9

第二章 G蛋白信号途径相关蛋白概述 10

一、GPCR 11

二、Gα、Gβ、Gγ及PhLP 13

(一)Gα、Gβ、Gγ 13

(二)PhLP 15

三、调控蛋白RGS 15

四、G蛋白信号途径下游效应分子 16

(一)cAMP-PKA途径 16

(二)MAPK途径 18

(三)IP3-Ca2+/DAG-PKC途径 20

第三章 禾谷炭疽菌G蛋白信号途径图绘制 23

一、G蛋白信号途径图绘制 23

(一)G蛋白信号途径相关蛋白获取 23

(二)G蛋白信号途径绘制 32

二、问题 35

三、展望 36

第四章 禾谷炭疽菌GPCR生物信息学分析 38

一、GPCR保守结构域分析 38

二、GPCR理化性质分析 39

三、GPCR疏水性分析 41

四、GPCR信号肽、转运肽分析 43

五、GPCR亚细胞定位分析 44

六、GPCR二级结构分析 44

七、GPCR遗传关系分析 45

第五章 禾谷炭疽菌Gα、Gβ、Gγ生物信息学分析 47

一、Gα、Gβ、Gγ保守结构域分析 47

二、Gα、Gβ、Gγ理化性质分析 47

三、Gα、Gβ、Gγ疏水性分析 50

四、Gα、Gβ、Gγ信号肽、转运肽分析 50

五、Gα、Gβ、Gγ亚细胞定位分析 53

六、Gα、Gβ、Gγ二级结构分析 53

七、Gα、Gβ、Gγ遗传关系分析 54

第六章 禾谷炭疽菌PhLP生物信息学分析 59

一、PhLP保守结构域分析 59

二、PhLP理化性质分析 59

三、PhLP疏水性分析 60

四、PhLP信号肽、转运肽分析 62

五、PhLP亚细胞定位分析 62

六、PhLP二级结构分析 63

七、PhLP遗传关系分析 63

第七章 禾谷炭疽菌RGS生物信息学分析 65

一、RGS保守结构域分析 65

二、RGS理化性质分析 65

三、RGS疏水性分析 66

四、RGS信号肽、转运肽分析 69

五、RGS亚细胞定位分析 71

六、RGS二级结构分析 71

七、RGS遗传关系分析 75

第八章 禾谷炭疽菌AC生物信息学分析 77

一、AC保守结构域分析 77

二、AC理化性质分析 77

三、AC疏水性分析 79

四、AC信号肽、转运肽分析 80

五、AC亚细胞定位分析 81

六、AC二级结构分析 81

七、AC遗传关系分析 82

第九章 禾谷炭疽菌PKA-R及PKA-C生物信息学分析 83

一、PKA-R及PKA-C保守结构域分析 83

二、PKA-R及PKA-C理化性质分析 84

三、PKA-R及PKA-C疏水性分析 88

四、PKA-R及PKA-C信号肽、转运肽分析 88

五、PKA-R及PKA-C亚细胞定位分析 92

六、PKA-R及PKA-C二级结构分析 92

七、PKA-R及PKA-C遗传关系分析 94

第十章 禾谷炭疽菌Pde生物信息学分析 99

一、Pde保守结构域分析 99

二、Pde理化性质分析 99

三、Pde疏水性分析 101

四、Pde信号肽、转运肽分析 102

五、Pde亚细胞定位分析 104

六、Pde二级结构分析 104

七、Pde遗传关系分析 105

第十一章 禾谷炭疽菌MAPK信号途径上蛋白质生物信息学分析 107

一、MAPK信号途径上蛋白质保守结构域分析 107

二、MAPK信号途径上蛋白质理化性质分析 107

三、MAPK信号途径上蛋白质疏水性分析 108

四、MAPK信号途径上蛋白质信号肽、转运肽分析 112

五、MAPK信号途径上蛋白质亚细胞定位分析 114

六、MAPK信号途径上蛋白质二级结构分析 114

七、MAPK信号途径上蛋白质遗传关系分析 116

第十二章 禾谷炭疽菌PI-PLC生物信息学分析 123

一、PI-PLC保守结构域分析 123

二、PI-PLC理化性质分析 126

三、PI-PLC疏水性分析 126

四、PI-PLC信号肽、转运肽分析 127

五、PI-PLC亚细胞定位分析 129

六、PI-PLC二级结构分析 130

七、PI-PLC遗传关系分析 131

第十三章 禾谷炭疽菌PKC生物信息学分析 132

一、PKC保守结构域分析 132

二、PKC理化性质分析 132

三、PKC疏水性分析 134

四、PKC信号肽、转运肽分析 135

五、PKC亚细胞定位分析 136

六、PKC二级结构分析 136

七、PKC遗传关系分析 137

参考文献 141

附录 147

致谢 167