第一章 绪论 1
第二章 微生物基因组结构与特征 5
第一节 核酸的结构与功能 5
第二节 原核生物基因组 12
第三节 病毒基因组 16
第四节 真核微生物基因组 20
第三章 微生物核酸样品制备 28
第一节 微生物DNA样品的制备 28
第二节 微生物RNA样品的制备 32
第四章 基于体外核酸扩增的快速检测技术 35
第一节 PCR技术 35
第二节 定量PCR技术 44
第三节 PCR技术的应用与实践 51
第四节 环介导恒温扩增技术 57
第五章 基因分型、多态性分析与溯源技术 63
第一节 核酸序列分析技术 64
第二节 细菌脉冲场凝胶电泳指纹图谱分型技术 84
第三节 单链构象多态性检测技术 96
第四节 限制性片段长度多态性分析技术 102
第五节 扩增片段长度多态性技术 107
第六节 随机扩增多态性DNA分析技术 114
第七节 细菌基因组重复序列PCR技术 119
第六章 核酸分子杂交技术 127
第一节 核酸探针 127
第二节 核酸分子杂交的类型 131
第三节 核酸分子杂交技术的应用 142
第七章 基因芯片技术 145
第一节 基因芯片技术的基本原理 146
第二节 基因芯片技术的分类 149
第三节 基因芯片技术的技术路线 151
第四节 基因芯片技术的应用 152
第八章 流式荧光技术 157
第一节 流式细胞术的基本原理 157
第二节 流式细胞术液相芯片技术 166
第三节 流式细胞术的应用 168
第九章 微生物群落结构分析技术 174
第一节 FISH技术 174
第二节 变性凝胶电泳技术 180
第三节 T-RFLP技术 186
第十章 生物信息学技术 191
第一节 微生物基因组学 191
第二节 生物信息数据库 193
第三节 数据库检索与查询 200
第四节 核酸数据分析 201
第五节 蛋白质数据分析 206
第十一章 实验指导 210
实验一核酸提取 210
实验二PCR 216
实验三细菌基因分型 223
实验四微生物群落结构分析 230
参考文献 238
中英文名词对照索引 244
专业重要学术网站 255
专业重要学术期刊 257