第一章 网络生物医学信息资源概论 1
第一节 网络生物医学资源的类别、特点和评价 1
一、网络生物医学信息资源的类别 1
二、网络生物医学信息资源的特点 5
三、网络生物医学信息资源的评价 7
第二节 文献信息检索语言 11
一、文献检索语言的涵义、组成和类型 12
二、检索语言在网络信息组织与检索中的应用 16
第三节 一般检索技术与策略 18
一、一般检索技术 18
第二章 搜索引擎 23
第一节 搜索引擎概述 23
一、收索引擎的概念和发展现状 23
二、收索引擎的原理及分类 25
第二节 普通搜索引擎 27
一、中文普通搜索引擎 27
二、英文普通搜索引擎 31
第三节 生物医学专业搜索引擎 35
一、中国生物医学专业搜索引擎 35
二、国外生物医学专业搜索引擎 37
第四节 搜索引擎使用的方法和技巧 41
一、简单查询 41
二、双引号使用 41
三、搜索逻辑命令 42
第三章 网络文献类型 44
第一节 网络电子图书 44
一、网络电子图书出版 44
二、网络电子图书资源与数字图书馆 44
第二节 网络学术期刊 45
一、国外生物信息学术期刊 45
二、网络外文生物信息全文期刊 46
第三节 专利信息资源 49
一、中国专利 49
二、日本专利 50
三、美国专利 50
四、欧洲专利 51
第四节 网络学术会议与学位论文资源 51
一、网络学术会议 51
二、学位论文资源 53
第五节 网络医学多媒体资源 54
一、解剖图谱资源——VHDS 54
二、医学影像资源 55
三、心胸部影像数据库 55
四、生物医学图像处理精品课程 55
五、医学多媒体资源网 55
第四章 著名外文生物医学文献信息资源与检索系统 57
第一节 MEDLINE/PubMed 57
一、MEDLINE文献收录和评价原则 57
二、MEDLINE数据库特点 58
三、MEDLINE的检索途径 58
四、Pubmed检索方法与技巧 60
第二节 MEDLINEplus 63
一、MedlinePlus特点 64
二、MedlinePlus资源 64
三、MedlinePlus与Medline/PebMed的比较 67
第三节 荷兰《医学文摘》(EMBASE) 67
一、EMBASE.com及其功能 67
二、EMBASE主题词表 68
三、EMBASE.com检索途径 68
四、检索结果处理 72
五、EMBASE与MEDLINE的区别 73
第四节 BIOSIS Previews网络数据库 74
一、BIOSIS Previews数据库概况 74
二、BIOSIS Previews数据库检索与链接 74
三、Biosis Previews与MEDLINE、EMBASE比较 79
第五节 化学文摘网络版SciFinder Scholar 79
一、CA网络版SciFinder Scholar的特点 80
二、CA网络版SciFinder Scholar的特色服务 82
三、CA网络版SciFinder Scholar检索方法和使用技巧 82
第六节 OVID数据库系统 88
一、Ovid医学信息平台的特点 89
二、OvidSP检索途径及方法 89
第七节 ISI Web of Knowledge平台数据库 93
一、ISI Web of Knowledge平台概述 93
二、ISI Web of Knowledge平台检索技术和方式 95
三、Web of Science 97
第八节 TOXNET毒理学数据库 101
一、TOXNET数据库概况 101
二、TOXNET数据库检索 103
第九节 国际药学文摘数据库 106
一、美国《国际药学文摘》简介 106
二、国际药学文摘数据库的检索 107
三、IPA数据库与Medline的比较 107
第十节 Elsevier电子期刊全文数据库 108
一、Science Direct数据库简介 109
二、检索运算符 110
三、检索方法及检索结果的显示 110
四、检索结果解读与保存 115
第五章 中文生物医学文献信息资源与检索系统 116
第一节 中国生物医学文献数据库 116
一、数据库简介 116
二、数据库使用方法 117
三、检索结果的处理 119
第二节 CNKI系列数据库 120
一、CNKI系列数据库介绍 120
二、CNKI系列数据库检索指南 121
第三节 全国报刊索引 127
一、简介 127
二、检索指南 128
第四节 国家科技图书文献中心 133
一、简介 133
二、NSTL的资源与服务 134
第五节 中国高等教育文献保障系统 140
一、简介 140
二、使用方法 141
第六节 万方数据资源系统 142
一、简介 142
二、检索指南 142
三、数字化期刊资源的浏览和下载(举例) 144
第七节 中国中医药期刊文献数据库 146
一、简介 146
二、使用方法 147
第八节 中国药学文献数据库 148
一、简介 148
二、使用方法 148
第六章 引文信息资源及检索 149
第一节 科学引文索引 149
一、科学引文索引概况 149
二、引文索引的作用和意义 150
三、科学引文索引使用方法 150
四、科学引文索引的其它数据库 152
第二节 中国科学引文数据库 153
一、概况 153
二、中国科学引文数据库期刊来源 154
三、中国科学引文数据库使用 155
第三节 中国生物医学期刊引文数据库 157
一、概况 157
二、使用方法 158
第七章 美国国立医学图书馆生物信息中心主要信息资源与利用 160
第一节 Entrez系统检索方法与技巧 160
一、Entrez检索系统的简介 160
二、Entrez系统的检索 161
第二节 PubMed Central 162
第三节 Genbank(Nucteotide-核苷酸序列数据库) 163
一、Genbank简介 163
二、Genbank检索 163
第四节 Genome(基因组数据库) 170
一、Genome基因组数据库的数据收录范围 171
二、Genome基因组数据库的主要功能 171
三、Genome基因组数据库的检索特点 171
四、Genoma基因组数据库检索结果 172
五、相关数据链接 173
第五节 dbSNP数据库 173
一、dbSNP数据库简介 173
二、SNP数据库的建立和现状 174
三、dbSNP检索 174
四、SNP数据库的应用和存在的问题 176
五、中国建立特有SNP数据库的必要性 177
第六节 Protein 177
第七节 在线人类孟德尔遗传(OMIM) 180
一、OMIM数据库的功能 180
二、OMIM数据库的特点 180
三、OMIM数据库的查询方法 182
四、OMIM数据库的缺陷 184
第八章 重要生物医学网站选介 185
第一节 综合性生物医学网站 185
一、国内综合性生物医学网站 185
二、国外综合性生物医学网站 193
三、综合性医学学(协)会 196
四、综合性生物医学期刊 200
第二节 预防医学网站 202
一、美国疾病控制与预防中心 202
二、美国预防医学会 206
三、泛美卫生组织 207
四、美国卫生和人类服务部 208
第三节 基础医学网站 209
一、欧洲分子生物学实验室 209
二、SWISS-PORT/TrEMBL 209
三、神经科学在线 211
四、微生物学网络 213
五、美国生理学会 214
第四节 临床医学网站 216
一、美国传染病学会 216
二、Jeslin Diabetes Center 217
三、美国心脏协会 219
四、国际AIDS保健医师协会 221
五、美国外科医生协会 222
六、癌症预防在研项目目录 224
第九章 网络生物学常用软件工具选介 225
第一节 PCR引物设计软件 225
一、PCR引物设计简介 225
二、引物设计软件Primer Premier 5.0 228
三、在线引物设计软件3.0 249
四、primer blast 253
第二节 在线序列比对软件—NCBI-BLAST 254
一、NCBI Blast简介 254
二、NCBI Blast的应用 256
第三节 DNA序列分析软件 258
一、DNA序列分析软件——DNAstar安装 259
二、DNA序列分析软件GeneQuest 259
三、DNA序列引物设计软件PrimerSelect 265
四、DNA序列酶切图软件MapDraw 273