第1章 海洋微生物学概论 1
1.1 海洋微生物及其研究意义 1
1.2 海洋微生物学的发展历程 2
1.3 海洋微生物的主要类群 7
1.4 海洋微生物的主要特征 10
1.5 海洋微生物的栖息环境 18
主要参考文献 27
复习思考题 27
第2章 海洋原核生物的结构及特性 29
2.1 海洋原核细胞的形态结构 29
2.2 海洋原核生物的营养及生长 47
2.3 海洋原核生物的能量产生过程 51
2.4 海洋细菌的密度感应和生物被膜 58
2.5 海洋原核生物的基因组学 63
主要参考文献 64
复习思考题 64
第3章 海洋细菌 65
3.1 细菌分类系统 65
3.2 海洋细菌的主要类群 67
3.3 产液菌门、热袍菌门和异常球菌-栖热菌门 70
3.4 绿弯菌门、硝化螺菌门和铁还原杆菌门 72
3.5 蓝细菌门和绿菌门 74
3.6 变形菌门 78
3.7 厚壁菌门和放线菌门 97
3.8 浮霉菌门、螺旋体门和酸杆菌门 100
3.9 拟杆菌门、疣微菌门、芽单胞菌门和黏胶球形菌门 102
主要参考文献 105
复习思考题 106
第4章 海洋古菌 108
4.1 古菌的分类系统 108
4.2 广域古菌门 110
4.3 泉生古菌门 117
4.4 奇古菌门 119
4.5 初生古菌门 121
4.6 纳米古菌门 122
4.7 其他古菌门类 123
4.8 古菌细胞膜脂及应用 123
主要参考文献 125
复习思考题 126
第5章 海洋真核微生物 128
5.1 真核微生物概述 128
5.2 原生动物 130
5.3 真核微藻 133
5.4 海洋真菌 138
主要参考文献 142
复习思考题 143
第6章 海洋病毒 144
6.1 海洋病毒的计数及形态观察 145
6.2 海洋病毒的产生和消亡 149
6.3 海洋病毒的多样性 151
6.4 海洋病毒对生物地球化学循环的影响 153
6.5 感染海洋生物的病毒 154
主要参考文献 161
复习思考题 162
第7章 深海和极地海洋微生物 163
7.1 深海微生物 163
7.2 极地微生物 182
7.3 海洋微生物的环境适应机制 185
主要参考文献 192
复习思考题 193
第8章 海洋微生物在生态系统中的作用 194
8.1 海洋食物网中的微食物环 194
8.2 海洋微生物在生物地球化学循环国中的作用 203
8.3 海洋中微生物动态变化的控制因素 221
8.4 海洋微生物与环境变化 224
主要参考文献 226
复习思考题 227
第9章 海洋环境中活的非可培养（VBNC）状态细菌 228
9.1 VBNC状态细菌的发现及主要细菌类群 228
9.2 诱导细菌进入VBNC状态的环境因素 232
9.3 VBNC状态细菌的检测方法 235
9.4 VBNC状态细菌的生物学特性 238
9.5 细菌进入VBNC状态的内在机制 241
9.6 VBNC状态细菌的复苏研究 242
9.7 对细菌VBNC状态概念的争议 248
9.8 细菌VBNC状态的理论及实际意义 248
主要参考文献 252
复习思考题 252
第10章 鱼类的微生物病害 254
10.1 病害诊断 255
10.2 细菌性传染病 255
10.3 鱼类传染性病害的控制 269
主要参考文献 285
复习思考题 286
第11章 海洋微生物的开发利用 287
11.1 有益菌在海水养殖中的应用 288
11.2 海洋微生物产生的活性物质 301
11.3 海洋微生物的环境修复 312
11.4 海洋微生物与生物附着 315
11.5 海洋微生物的污损和防护 318
11.6 金属的微生物腐蚀及防护 321
11.7 微生物对木材的腐损及防护 324
11.8 海洋微生物的其他应用 324
主要参考文献 325
复习思考题 326
第12章 海洋微生物的采样技术 327
12.1 水样的采集 327
12.2 泥样的采集 333
12.3 检样的储存 337
12.4 海洋调查船 338
主要参考文献 340
复习思考题 340
第13章 海洋微生物的多样性研究技术 341
13.1 显微镜镜检计数法 341
13.2 培养计数法 347
13.3 流式细胞术 350
13.4 免疫学检测法 352
13.5 基于PCR的分子生态技术 354
13.6 荧光原位杂交技术 362
13.7 环境微生物组学技术 363
13.8 其他分子生物学技术 365
主要参考文献 366
复习思考题 367
第14章 海洋微生物的分离与培养技术 368
14.1 海洋异养细菌分离与培养的基础方法 368
14.2 特殊海洋异养细菌的分离培养 373
14.3 海洋化能自养菌的分离与培养 381
14.4 海洋光能营养菌的分离与培养 385
14.5 海洋古菌的分离与培养 388
14.6 海洋真菌的分离与培养 392
14.7 其他常见海洋微生物培养基配方 393
14.8 海洋微生物培养新技术 396
14.9 海洋微生物的保存方法 400
主要参考文献 403
复习思考题 404
第15章 海洋细菌的分类与鉴定技术 405
15.1 海洋细菌分类与鉴定的基本流程 405
15.2 形态特征分析方法 406
15.3 生理生化特征分析方法 408
15.4 化学特征分析方法 417
15.5 海洋细菌基因特征分析方法 418
15.6 细菌快速鉴定系统 423
15.7 海洋细菌新分类单元的命名及发表 424
15.8 展望 425
主要参考文献 425
复习思考题 426
第16章 现代生物技术在海洋微生物研究中的应用 427
16.1 转录组学技术及其应用 427
16.2 蛋白质组学技术及其应用 429
16.3 代谢组学技术及其应用 430
16.4 基因工程技术及应用 431
16.5 基因芯片技术及应用 432
16.6 基因敲除技术及应用 434
16.7 合成生物学技术及应用 435
16.8 基因调控技术及应用 439
16.9 蛋白质定向进化技术及应用 442
主要参考文献 444
复习思考题 445
名词索引 447
微生物中文名索引 454
微生物拉丁名索引 460