第一章 现场流行病学基本方法 1
一、现场流行病学的主要工作内容 1
二、公共卫生监测 2
三、病例定义 3
四、症状监测：早期发现的基本原理 5
五、流行病学推论 6
六、疾病发生的描述及常用指标 9
七、小结 15
第二章 微生物威胁的预防和控制原理 17
一、概述 17
二、传染病链状模型 18
三、传染和传染性的自然过程 22
四、人—微生物相互作用的收敛模型 24
五、传播动态 25
六、传播动态和控制点 31
七、控制措施（策略＋干预） 32
八、小结 34
第三章 暴发现场调查概述 36
一、暴发调查的主要目的和方法 36
二、暴发调查的步骤 37
三、小结 40
第四章 现场暴发调查队伍成员组成和专业要求 42
一、调查前准备 42
二、队员的角色 42
三、装备 44
四、通讯 44
五、小结 44
第五章 假设的形成 46
一、假设形成的策略 46
二、案例简介 49
三、小结 50
第六章 编制调查表 52
一、编制调查表的步骤 52
二、流行病学调查表中信息的分类 52
三、问题的类型 54
四、调查表的设计 56
五、小结 58
第七章 展开现场暴发调查 59
一、简介 59
二、暴发调查的主要内容 60
三、寻找病例和编写病例列表 67
四、形成假设的随访 73
五、小结 77
第八章 随访技巧 78
一、概述 78
二、调查的问题 79
三、提示 80
四、澄清 80
五、结尾 81
六、面对面访问 81
七、疑问、问题和解决方案 82
八、其他问题 82
九、小结 83
第九章 选择研究设计 85
一、概述 85
二、队列研究 85
三、病例对照研究 86
四、病例对照或队列研究的选择 87
五、举例 90
六、小结 91
第十章 现场调查中的数据分析 92
一、概述 92
二、制定分析计划 93
三、暴发调查的基本步骤 94
四、描述流行病学 94
五、分析流行病学 110
六、计划和开展进一步研究 115
七、小结 116
第十一章 撰写调查报告 118
一、概述 118
二、报告的基本结构 121
三、案例介绍 124
四、小结 131
第十二章 R在现场流行病学分析中的应用及举例 134
一、R资源概述 134
二、R在流行病学中应用简介 163
三、R在描述流行病学中的应用举例 184
四、R在分析流行病学中应用举例 190
第十三章 案例研究及参考答案 231
一、奥斯威戈一次礼拜晚餐导致胃肠疾病暴发 231
二、参考答案 235
附录一 现场流行病学速查手册 257
一、现场流行病学的主要内容 257
二、传染病控制的原则 258
三、实施暴发调查的7个主要步骤 261
四、现场流行病学工作的组织管理 269
五、主要指标的基本计算公式 273
六、调查问题的类型 276
七、R分析模板 281
附录二 本书中所使用的数据 288