第一章 进化生态学的定义与范畴 1
第一节 学科起源和学术思想背景 1
一、进化生态学的产生 1
二、学术思想背景 3
第二节 有关学科的发展 5
一、国外的发展 5
二、国内的发展 7
第三节 进化生态学的基本问题 8
一、种群问题 8
二、进化的（终极的）因子与生态的（近期的）因子 12
三、适应问题 13
四、种内变异问题 14
五、进化的理解和进化动力 17
第四节 进化生态学的定义与研究范畴 21
一、进化生态学的定义 21
二、进化生态学的方法论 22
三、进化生态学与现代生态学的理论构建 22
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基本概念 25
思考题 25
第二章 Castle-Hardy-Weinberg定理 26
第一节 种群遗传统计 26
一、基因、基因型和表现型 26
二、基因型频率和等位基因频率 27
第二节 Castle-Hardy-Weinberg定理 30
一、改变基因频率的因素 30
二、Castle-Hardy-Weinberg定理 31
三、χ2检验（chi-square test） 35
四、Castle-Hardy-Weinberg平衡 36
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基本概念 38
思考题 39
第三章 突变 40
第一节 突变与遗传变异 40
一、历史认识的回顾 40
二、逐渐进化与跳跃进化 40
三、认识的进展 42
第二节 突变的本质与类型 43
一、突变的定义 43
二、突变的性质 43
三、突变的类型 44
四、突变的适合度 47
第三节 种群中的突变 48
一、单发突变或一次性突变 48
二、频发突变 50
第四节 突变率 52
一、突变率难于确定的原因 53
二、四种水平的突变率 53
第五节 突变的进化效应 56
一、突变是遗传变异的根本来源 56
二、突变与遗传重组 57
三、增变基因和反增变基因 58
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基本概念 60
思考题 60
第四章 自然选择 61
第一节 自然选择的类型 62
一、稳定选择 62
二、定向选择 62
三、歧化选择 63
第二节 适合度 65
一、适合度的定义 65
二、适合度的组成 65
三、绝对适合度和相对适合度 66
四、适合度的测定 66
五、自然选择的生态模式 67
第三节 自然选择模型 68
一、配子体选择 68
二、合子体选择 70
三、一般模型 71
四、对纯合体的选择 72
五、对杂合体的选择 73
六、对纯合隐性致死基因的选择 74
七、自然选择的基础定理 76
第四节 导致平衡多态的自然选择 78
一、频率制约选择 79
二、时空异质性 79
三、与密度有关的选择 80
四、突变与选择的平衡 81
第五节 暂时多态现象 83
一、暂时多态现象与定向选择 83
二、暂时多态现象与遗传负荷 84
第六节 自然选择的扩展认识 84
一、自然选择的单位 84
二、配子选择 85
三、亲子选择 85
四、性选择 87
五、生育力选择 88
六、减数分裂比偏移 88
七、软选择与硬选择 89
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基本概念 90
思考题 91
第五章 迁移与基因流 92
第一节 几个相关概念 92
一、传播 92
二、散布 92
三、迁移 93
四、种群结构 93
五、基因流 94
第二节 基因流的模型 95
一、岛屿模型 95
二、景观尺度模型 98
三、其他模型 99
第三节 基因流与自然选择 100
第四节 基因流的测定 103
一、直接测定法 103
二、间接测定法 103
第五节 基因流的进化结果 104
一、杂交 104
二、渐渗杂交 105
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基本概念 107
思考题 107
第六章 随机遗传漂变 108
第一节 随机遗传漂变 109
一、概念 109
二、基因漂变过程 110
三、突变基因的命运 111
四、随机遗传漂变的特性 112
五、随机遗传漂变的进化意义 112
六、遗传漂变量的概率分布 113
第二节 有效种群大小 114
一、理想种群 114
二、异常性比 114
三、实际种群变动 115
四、近交及近交系数 116
五、有效种群大小与突变、选择和迁移的关系 118
第三节 漂变的进化效应 119
一、种群瓶颈效应 119
二、建群者效应 119
三、种群细分与Wahlund公式 122
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基本概念 124
思考题 124
第七章 种群特征 125
第一节 种群概念及其特性 125
一、认识的发展 125
二、种群系统 127
三、种群定义 129
四、种群构件理论 130
五、种群的基本特征 132
第二节 种群的空间特征 132
一、种群分布 132
二、种群分布格局 133
第三节 种群的数量和动态 137
一、种群统计参数 137
二、种群过程描述 140
第四节 种群的遗传结构 146
一、种群遗传多样性参数 146
二、种群遗传分化 149
三、遗传距离分析 151
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基本概念 154
思考题 155
第八章 生物变异与遗传多样性 156
第一节 生物多样性 157
一、生物多样性的概念 157
二、遗传多样性的重要意义 159
第二节 遗传多样性的起源与维持 160
一、遗传信息的分子基础 160
二、核酸的复制 161
三、进化动力与遗传变异性 162
第三节 生态变异 163
一、表型可塑性与遗传分化 163
二、生态型变异 164
三、梯度变异 166
四、生态变异的其他式样 167
第四节 遗传多样性的检测方法 169
一、形态学水平 169
二、染色体水平 169
三、等位酶水平 170
四、DNA水平 171
第五节 决定遗传多样性水平和遗传结构的因素 175
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基本概念 178
思考题 178
第九章 适应及其起源 179
第一节 适应及适合度 180
一、适应的含义 180
二、Darwin的“最适者生存” 181
三、适应及适合度概念 181
第二节 生活史进化 184
一、生活史策略 184
二、生活史模式 192
第三节 繁育系统 196
一、繁育系统的概念及类型 196
二、远交机制 199
三、近交（自交）机制 200
四、近交衰退与远交衰退 201
第四节 适应实例 202
一、工业黑化 202
二、拟态 204
三、分子水平的适应 208
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基本概念 210
思考题 210
第十章 物种概念 212
第一节 物种概念的回顾 213
一、Linnaeus时代 213
二、Darwin时代 213
三、现代综合进化论时代 213
第二节 物种的定义 214
一、形态学种与模式概念 214
二、生物学种与种群概念 215
三、其他 219
第三节 生殖隔离 219
一、生殖隔离机制 219
二、生殖隔离的起源 221
第四节 对物种本质的再认识 223
第五节 几个关于物种的概念 224
一、多型种 224
二、兄弟种或姊妹种 224
三、生态种和群型种 225
四、无性生物的“种” 225
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基本概念 226
思考题 226
第十一章 生态分化和物种形成 227
第一节 进化式样 228
一、物种形成问题的争论 228
二、进化式样的分类 229
三、物种形成模式 230
第二节 生态分化的遗传基础 232
一、遗传体制 232
二、遗传体制的进化 233
第三节 物种形成 234
一、物种形成的遗传理论 234
二、异地物种形成 235
三、跳跃式进化 236
四、同地物种形成 239
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基本概念 243
思考题 243
第十二章 生态系统的演化与协同进化 244
第一节 群落演替 245
一、演替概念 245
二、有关概念 246
三、演替的类型 251
四、群落演替的一般趋势 252
五、演替的动力 255
六、演替的研究方法 257
第二节 生态系统的演化 258
一、局域生态种群与混交群 260
二、生态等级与系统等级 260
三、生态成功与繁殖成功 261
四、物种选择 262
五、复制者与互作者 263
六、群体选择 263
第三节 协同进化 264
一、概念 264
二、生态系统内的协同进化 265
三、红王后假说 271
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基本概念 273
思考题 273
第十三章 进化生态学的应用 274
第一节 珍稀濒危物种的管理 274
第二节 小种群灭绝的近因 277
第三节 遗传多样性的管理 278
一、近交衰退 278
二、远交 279
三、等位基因的漂变流失 279
四、栖息地片段化 279
第四节 GMOs释放 281
一、重组基因的稳定性 281
二、引种原则 281
三、转基因生物的特殊性 283
第五节 农作物的遗传改良 284
一、新的基因及农作物品种 284
二、基因库与生物多样性的价值 285
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基本概念 286
思考题 286
参考文献 287
索引 300