第一章 科学与人文的混战 1
第一节 两种文化 1
第二节 科学大战 10
第三节 康德：榜样和教训 18
第二章 科学对人类尊严的打击 26
第一节 弗式革命：三次？四次？五次？ 26
第二节 目的论和哥白尼原则 32
第三节 达尔文的咒语 37
第四节 科学和人文和解的可能 44
第三章 莫诺“指引”方向 54
第一节 裂隙和谎言 55
第二节“万物有灵论” 58
第三节 “辩证唯物主义的破产” 66
第四节 反人类中心论 80
第四章 对“莫诺论题”的分析 85
第一节 莫诺的生命观 86
第二节 “无故”——莫诺对进化中偶然性的强调 96
第三节 莫诺的科学观 107
第四节 莫诺的方案 114
第五章 进步观如何被现代综合进化论剔除 120
第一节 达尔文对进步观的态度 120
第二节 达尔文主义的日食 123
第三节 进步式进化观的失败 130
第六章 古尔德和德迪夫 138
第一节 “古尔德灌丛” 138
第二节 “古尔德对阵复杂性” 154
第三节 德迪夫对阵莫诺 162
第七章 罗素论题和热力学第二定律 172
第一节 热力学第二定律和熵 172
第二节 热力学第二定律支配下的宇宙演化 176
第三节 热力学第二定律对文化的影响 180
第八章 超越热力学第二定律是可能的吗 184
第一节 围剿“热寂” 184
第二节 普列高津对热力学第二定律的部分超越 188
第三节 考夫曼的突破：功循环 192
第四节 考夫曼深陷泥潭 204
第五节 考夫曼的热力学第四定律 212
第六节 我的不同意见 218
第七节 对复杂性科学的一点批评 228
第九章 生命产生的必然性 234
第一节 巧合：人择原理？ 235
第二节 生命的本质：“复制教条” 239
第三节 新的生命观 246
第十章 达尔文主义能够被超越吗？ 252
第一节 基因是篡权者：从一元机制到二元机制 253
第二节 类比及其合理性 263
第三节 效率高者生存 266
第四节 进化中的必然性：机制进化 272
第十一章 人类产生的必然性 282
第一节 通常的思路及其问题 282
第二节 从生命机制的进化来看 290
第十二章 科学为什么会打击人的尊严 297
第一节 对科学的不同态度 297
第二节 对自由问题的简短说明 300
第三节 科学和人的关系的二重性及其解决 307
第四节 具体的案例 315
第五节 构建理论生物学：不同文化融合之难 323
附录一 在北大、清华、人大三校博士生论坛上的发言全文 338
一、进步还是退化 339
二、较量 341
三、路标 345
四、前进 347
附录二 西西弗斯的神话（节选） 350
后记 351
参考文献 356