第一篇 植物病害诊断方法与文献查询第一章 植物病害诊断方法 3
第一节 微观诊断方法 3
一、免疫学方法 3
二、分子杂交检测法 9
三、多维显微观察法 35
四、超微观察 39
第二节 多媒体技术在病害诊断中的应用 45
一、多媒体技术的种类与原理 45
二、多媒体加工处理技术 47
三、病害诊断多媒体信息系统的构建 50
第二章 植物病害文献查询 52
第一节 数据库检索系统 52
一、Dialog检索系统 52
二、Questel-ORBIT系统 53
三、EINS系统 53
四、STN系统 54
五、OCLC FirstSearch检索系统 54
六、EI Compendex Web 55
七、CSA——剑桥科学文摘 56
八、PQDD——博士、硕士论文数据库 56
九、Ingenta检索系统 57
十、WOSP-ISTP 57
十一、万方数据资源系统 57
十二、中国期刊网全文数据库 58
十三、Kluwer Online Journals——电子期刊全文数据库 58
十四、ELSEVIER SCIENCE电子期刊全文库 59
十五、ProQuest Academic Research Library——全文期刊与报纸数据库 59
第二节 Internet植物病害信息的检索 59
一、搜寻引擎和搜寻方法 60
二、有关植物病理学科重要网站 61
三、数字化图书馆 62
四、国家科技图书文献中心简介 62
五、专利信息的网上检索 63
第三节 植物病害综合治理信息服务 64
一、工具类服务方式 64
二、讨论类服务方式 64
三、查询类服务方式 65
四、Internet在植物病理学研究中的应用 65
五、虚拟化网络环境在植物病害综合治理中的应用前景 66
参考文献 70
第二篇 植物病害流行学研究方法第一章 信息技术在病害流行学研究中的应用 75
第一节 地理信息系统（GIS） 75
一、数据的采集方法 77
二、数据的存储、管理、分析 79
三、系统软件的构建 83
四、地理信息系统在植物保护领域的应用 84
第二节 全球定位系统（GPS） 89
一、全球定位系统（GPS）接受器的原理 89
二、全球定位系统（GPS）在植物保护中的应用 90
第三节 遥感技术（RS） 91
一、遥感（RS）技术的原理 92
二、遥感（RS）技术在植物保护中的应用 96
第二章 电算模拟在植物病害流行学研究中的应用 98
第一节 流行模拟 98
一、系统分析和电算模拟 98
二、系统模拟的工作步骤 100
三、模型模拟的应用前景 103
第二节 损失估计 104
一、损失的生理学 104
二、损失估计模型 105
三、损失估计的类型 108
四、产量损失模型的数据要求 108
五、植物病害损失估计的研究方法 109
参考文献 114
第三篇 植物致病生理的研究方法第一章 植物病原侵染过程的观察 119
第一节 植物病原物与寄主的识别 119
一、识别的类型 119
二、致病性相关识别的研究方法 120
第二节 侵入过程的超微和显微观察 122
一、侵染器官观察 122
二、侵染过程的组织学观察 123
第三节 植物病株内病原物分布的免疫细胞化学研究 124
一、植物免疫化学发展简况 124
二、免疫化学基本原理 125
三、免疫化学操作基本步骤 127
第二章 植物病原物产生的角质酶的致病作用分析 134
第一节 角质酶及其致病作用 134
一、酶的特性 134
二、致病作用 134
第二节 角质酶提取与致病性测定 135
一、酶的获得与活性测定 135
二、酶在病程中的作用 136
第三章 植物病原物产生的细胞壁降解酶的致病作用分析 138
第一节 细胞壁降解酶的种类与一般特性 138
一、酶的种类与特性 138
二、酶的致病作用 142
第二节 细胞壁降解酶的提取、纯化与活性测定 154
一、胞外细胞壁降解酶的提取、纯化 154
二、细胞壁降解酶活性测定 155
第三节 细胞壁降解酶致病作用的确定 156
一、离体下的鉴定方法 156
二、活体下的鉴定方法 156
三、细胞壁降解酶致病作用鉴定与评价 160
第四节 细胞壁降解酶编码基因的表达与调控 162
一、植物病原细菌产生的细胞壁降解酶基因的表达与调控 162
二、植物病原真菌产生的细胞壁降解酶基因的表达与调控 164
第四章 植物病原物毒素的致病作用分析 166
第一节 植物病原菌毒素的种类和来源 166
一、毒素的概念及其演化 166
二、寄主选择性植物病原菌毒素的特点及来源 167
三、非寄主选择性植物病原菌毒素的特点及来源 172
第二节 植物病原菌毒素的生物测定 178
一、毒素致毒活性的确定 178
二、植株水平的生物测定 179
三、组织器官水平的生物测定 180
四、细胞水平的生物测定 182
五、细胞器水平的生物测定 183
六、酶及代谢水平的生物测定 186
第三节 植物病原菌毒素的定量化学分析 191
一、电导率法（电阻法） 191
二、分光光度法 192
三、色谱法 193
四、差重法 196
第四节 植物病原菌毒素作用机制 196
一、植物病原菌毒素致病作用确定 196
二、受体蛋白分离 200
三、受体蛋白功能鉴定 204
四、毒素对寄主代谢的影响 206
第五章 植物病原菌毒素的纯化与结构鉴定 207
第一节 植物病原菌的产毒条件 207
一、培养基选择 207
二、营养条件 213
三、环境条件 216
第二节 植物病原菌毒素的分离 218
一、活体外病原菌毒素的分离 218
二、活体内病原菌毒素的分离 220
三、毒素的萃取方法 221
第三节 植物病原菌毒素纯化方法 225
一、分馏纯化 225
二、重结晶纯化 228
三、色谱纯化 230
第四节 植物病原菌毒素的结构鉴定 239
一、毒素的红外光谱分析 239
二、毒素的气—质联用分析 241
三、毒素的高分辨率色谱分析 242
四、毒素的核磁共振分析 245
第六章 植物病原菌毒素的应用实践 247
第一节 植物病原菌毒素与作物品种抗病性测定 247
第二节 毒素与抗病突变体的筛选 251
一、基本原理 252
二、操作基本步骤 252
第三节 植物病原菌毒素与病原菌生理小种鉴定 254
一、基本原理 254
二、鉴定方法 255
三、应用实例 255
第四节 植物病原菌毒素与生物农药研制 255
一、毒素生物合成抑制剂 256
二、毒素活性钝化剂 256
三、毒素与感病植物受体结合的干扰剂 257
四、毒素间交互抑制 258
五、毒素的抗菌物质 258
第七章 激素失调的致病作用分析 260
第一节 激素的种类及来源 260
一、生长素 260
二、赤霉素 261
三、细胞分裂素 262
四、脱落酸 262
五、乙烯 264
六、油菜素甾醇类 264
七、水杨酸类 265
八、茉莉酸类 265
九、多胺 266
第二节 植株体内激素含量的测定 266
一、生物测试技术 266
二、免疫血清学技术 267
三、物理化学检测技术 269
四、其他方法 271
第三节 激素致病作用确定 271
一、生长素 271
二、赤霉素 274
三、细胞分裂素 274
四、脱落酸 275
五、乙烯 276
参考文献 278
第四篇 植物抗病生理研究方法第一章 植物组织结构抗性的观察 285
第一节 植物抗性结构种类与功能 285
一、植物固有的形态结构抗性 285
二、植物被诱发的形态结构抗性 286
第二节 抗性结构的显微观察方法 288
一、光学显微镜 288
二、荧光显微镜 290
三、抗性结构观察 292
第三节 抗性结构的超微观察方法 295
一、电子显微镜原理 295
二、电子显微镜制片 295
三、抗性结构的超微观察 298
第二章 生理生化抗性分析 304
第一节 致病因子的抑制因子分离与鉴定 304
一、果胶酶抑制因子的特性 304
二、果胶酶抑制因子的分离鉴定 307
三、木质素的测定 310
第二节 侵染诱发的抗病性和获得抗性 313
一、侵染诱发抗性和诱导抗性原理 313
二、激发子的种类与工作模式 314
三、抗性诱导方法 315
四、诱导抗性的生理效应 320
参考文献 341
第五篇 植物—病原物分子互作第一章 植物抗病信号转导研究 349
第一节 寄主—病原菌互作过程中的信号转导 349
一、病菌侵染诱发抗病性的信号种类 349
二、信号转导系统 349
三、防御反应的发生 353
第二节 信号转导的研究方法 354
一、标记配体法检测受体 354
二、亲和技术提纯受体 354
三、分子克隆技术获取微量受体 355
第三节 寡糖素信号测定 355
一、寡糖素的提取 355
二、寡糖素的检测 356
第四节 钙信号的测定 357
一、钙调素的定量测定 357
二、钙调素的分布与定位 359
三、钙调素结合蛋白（CaMBP）的检测 359
第五节 蛋白质磷酸化活性的测定 360
一、钙依赖蛋白激酶（CDPK）待测样制备 360
二、液闪法测定钙依赖蛋白激酶（CDPK）活性 360
三、放射自显影法测定钙依赖蛋白激酶（CDPK） 361
第六节 G蛋白的测定 362
一、GTP结合实验 362
二、GTPase活性实验 362
三、细菌毒素诱导的核糖基化实验 362
四、免疫转移电泳实验 362
第七节 水杨酸和茉莉酸含量的测定 362
一、水杨酸含量的测定 362
二、茉莉酸含量的测定 363
第八节 信号物质功能鉴定 363
一、寡糖素 363
二、钙离子（Ca2+）和钙调蛋白（CaM） 364
三、水杨酸 364
四、茉莉酸 364
五、G蛋白 365
六、活性氧 365
第九节 信号转导过程 365
一、信号分子级联转导 365
二、信号分子转导效应分析实例 369
第二章 植物病原致病性的分子机理 373
第一节 病原菌致病基因与相关基因 373
一、病原菌致病基因 373
二、病原菌致病相关基因 376
第二节 病菌生理分化的遗传学基础 382
一、病菌遗传多态性 382
二、生理分化分子鉴定技术 382
第三章 植物抗病的分子机理 391
第一节 植物与病原物互作的遗传基础 391
一、抗病基因的种类及功能 391
二、抗病基因的克隆 396
三、抗病基因的转化 407
第二节 防御反应基因的诱导表达 414
一、防御反应基因种类与功能 414
二、防御反应基因的克隆与序列分析 418
第三节 无毒基因的诱导表达 419
一、无毒基因的种类与功能 419
二、无毒基因的克隆 424
第四节 蛋白质组学技术在植物—病原菌互作研究中的应用 428
一、蛋白质组学的概念 428
二、蛋白质组学研究的意义 428
三、蛋白质组学研究的技术体系 429
四、蛋白质芯片技术 436
五、酵母双杂交系统 436
六、蛋白质组学在植物病理学研究中的应用 437
参考文献 445
第六篇 植物病害防治技术研究方法第一章 植物病害综合治理决策系统的构建 455
第一节 病害决策系统概述 455
第二节 决策系统构建的基本原理 456
第三节 决策系统构建的方法 457
一、病害综合治理决策系统方法 457
二、病害综合治理决策系统建立过程 459
三、病害决策支持系统应用实例——小麦病害防治决策支持系统EPIPRE 459
第二章 植物抗病基因工程原理和方法 461
第一节 植物抗病基因工程原理 461
一、目的基因的转化 461
二、外源基因的检测 467
三、转基因植物的抗病性鉴定 469
第二节 抗病基因工程植株构建关键技术 470
一、抗真菌病害 470
二、抗病毒病害 472
三、抗细菌病害 475
第三章 分子标记辅助抗性育种 478
第一节 植物中常用的抗性遗传标记 478
一、RFLP 479
二、RAPD 484
三、AFLP 486
四、SSR 487
五、SCAR、CAPs和STS 487
六、各标记间的联系及标记间的相互转化 488
第二节 分子标记辅助育种一般程序 489
一、高密度分子图谱的构建 489
二、分子标记辅助抗性育种的方法及程序 491
三、展望 498
第四章 植物病害的基因治疗技术 500
第一节 基因治疗的基本过程 500
一、治疗相关基因的种类 500
二、基因导入载体 500
三、基因的导入 500
四、基因的表达 501
第二节 基因修正技术及应用 501
一、依赖于靶基因的同源重组 501
二、嵌合RNA/DNA寡聚核苷酸介导的基因修复 502
第三节 基因沉默在植物病害治疗中的应用 504
一、基因沉默产生的机理 504
二、RNA沉默与其他基因表达抑制技术的比较 504
三、基因沉默在植物病害防治中的应用 504
第五章 生物农药的研制与开发 506
第一节 微生物源农药的研制与开发 506
一、一般筛选方法 506
二、分子筛选方法 509
三、工程菌株构建 510
四、拮抗微生物生产药物的提取精制工艺 514
第二节 植物源杀菌剂的研制与开发 517
一、应用植物源杀菌剂的重要性 517
二、植物源杀菌剂的概念与种类 518
三、植物源杀菌剂的筛选途径 519
四、植物源杀菌剂的主要组分和结构类型 521
五、植物源杀菌成分的提取 524
六、植物杀菌物质活性测定方法 528
七、植物源杀菌成分的分离、纯化及理化性质分析 529
八、植物源杀菌剂作用机制 538
第六章 转基因植物的应用与安全评价技术 542
第一节 生物安全性的概念 542
第二节 安全性研究技术 543
一、转基因植物安全性评价的内容 543
二、转基因植物安全性评价方法 546
第七章 转基因拮抗微生物的应用与安全评价技术 550
第一节 转基因拮抗微生物的应用 550
一、国外应用进展 550
二、国内应用进展 551
第二节 生物安全性评价的程序 551
一、安全性的分级标准 552
二、安全等级的划分程序 552
三、生物安全性评价的主要内容 552
四、安全性评价的方法和资料要求 556
五、生物安全性评价的重要影响因素 557
附录：农业转基因生物安全管理条例 558
参考文献 568
第七篇 植物病理学中统计方法与生物信息学第一章 统计分析软件 577
第一节 常用统计分析软件简述 577
一、SAS系统 577
二、SPSS（社会科学统计软件包） 577
三、NCSS软件包 578
四、Stata软件 579
五、S-PLUS软件 579
六、MiniTab软件 579
七、SYSTAT统计分析软件 580
八、SigmaStat v3.1统计分析软件 580
九、JMTJ 580
十、非典型数据统计分析系统 581
第二节 数据统计分析软件SPSS11.0的应用 581
一、主要窗口功能、数据文件建立和数据转换 581
二、数据统计分析软件（频数分布分析） 584
三、数据统计分析软件SPSS的应用（均数比较） 585
四、广义因素方差分析 589
五、数据统计分析软件SPSS的应用——相关分析与回归分析 594
六、数据统计分析软件SPSS的应用——统计图形 598
第二章 生物信息学 602
第一节 分子植物病理学中的生物信息学 602
第二节 引物设计与序列分析 603
一、引物设计 603
二、序列分析 609
参考文献 614