第1章 方法的重要性 1
一、方法的重要性 1
二、方法和方法论 3
三、生物学方法论 5
第2章 生物学观察 9
一、从扁鹊的“起死回生”谈起 9
二、观察出真知 10
三、观察仪器与观察能力的扩展 12
四、观察的作用 16
五、观察的客观性问题 18
六、亚里士多德与鸡胚的发育 21
七、典型观察 23
八、举世无双的观察者 24
第3章 生物学实验 26
一、从神奇的“借尸还魂”说起 26
二、实验是探索的源泉 29
三、实验是确实性之母 30
四、实验需要理论的指引 32
五、实验需要精心构思 35
六、天才的实验家 37
七、实验仪器的作用 39
八、实验中的机遇 40
九、生物学实验的类型 42
第4章 敞开思想的翅膀——类比方法 44
一、胸腔与酒桶 44
二、阿契厄斯、机器和生命 45
三、类比、相似与模拟 47
四、原始地球上的闪电 48
第5章 求同与求异——比较方法 50
一、有比较才能进行鉴别 50
二、比较方法与比较解剖学的诞生 51
三、比较方法与比较胚胎学的建立 54
四、比较方法的作用 56
第6章 借用他山之石——物理化学方法 58
一、物理学家步入生物学领域 58
二、化学方法与生物学的早期成就 60
三、物理学方法与分子生物学革命 61
四、物理化学方法与基因作用机制的发现 70
五、层析方法与蛋白质中氨基酸顺序的确立 72
六、物理化学方法与遗传密码的破译 74
第7章 巧妙地运用数学方法 77
一、数学：科学的皇冠 77
二、数学推理与血液循环的发现 79
三、数学方法与进化论的建立 80
四、数学方法与经典遗传学定律的提出 81
五、数学方法的前景 86
第8章 计算机人工生命方法 89
一、计算机仿真：科学研究方法的新革命 90
二、人工生命的产生 93
三、人工生命的基本思想 96
四、人工生命的构造 98
五、一种崭新的思维方式：人工生命的非中心化思维 118
六、人工生命方法的意义 124
第9章 假说方法 127
一、科学发展的必由之路 127
二、大胆的猜测和严密的论证 129
三、生物学中的“谜中之谜” 130
四、形形色色的假说 130
五、从混沌到有序 132
六、巧妙地证明 134
第10章 创造性思维方法 136
一、“尤利卡”效应 136
二、丰富的想象 137
三、灵感的出现 139
四、捕捉灵感 143
第11章 分析和综合方法 145
一、分析方法 145
二、综合方法 147
三、系统方法 149
四、21世纪的生物学——系统生物学 150
第12章 历史与逻辑相统一的方法 153
一、历史与逻辑的统一 153
二、在生物学中的表现 154
第13章 生物学研究的伦理原则 158
一、从黄禹锡事件说起 158
二、“卵子风波”中的生命伦理学 161
三、“卵子风波”中人们对生命伦理的忽视 164
四、科学必须真实 167
五、人本道德和学术道德同样重要 167
参考文献 171
附录 174