1 植物细胞核基因组 1
1.1 植物核基因组大小 2
1.2 重复序列 7
1.3 基因家族 11
1.4 真核基因的断裂结构 15
2 叶绿体基因组 18
2.1 叶绿体DNA的信息含量 19
2.2 叶绿体基因组的结构 20
2.3 叶绿体基因的组成 22
2.4 叶绿体基因的一些结构特征 30
3.1 线粒体基因组的大小 34
3 线粒体基因组 34
3.2 线粒体基因组的组织结构 36
3.3 线粒体基因组的组成 39
3.4 线粒体基因的一些特征 42
3.5 RNA编辑 44
3.6 植物细胞质雄性不育与线粒体的关系 45
3.7 遗传信息在基因组之间的流动 46
4 植物的可移位遗传因子 49
4.1 可移位因子的类型 50
4.2 转座子 50
4.3 LTR逆转录转座子 58
4.4 无LTR—逆转录转座子 63
4.5 花椰花叶病毒中的逆转录酶 65
5 核酸的分子操作 66
5.1 限制性内切酶 66
5.2 操作和标记核酸的酶 74
5.3 分子杂交 81
6 分子克隆 85
6.1 作为受体细胞的大肠杆菌 85
6.2 由质粒衍生的载体 88
6.3 由λ噬菌体衍生的载体 93
6.4 粘粒载体 98
6.5 单链丝状噬菌体M13 100
6.6 外源DNA与载体重组 101
6.7 重组DNA导入受体细胞 103
6.8 阳性重组体的筛选和鉴定 105
7 DNA序列测定与分析 107
7.1 测序策略 108
7.2 Sanger双脱氧终止法 112
7.3 Maxam-Gilbert化学直读法 116
7.4 杂交测序与DNA芯片技术 117
7.5 EST 120
7.6 DNA序列分析 124
8 PCR——聚合酶链反应 127
8.1 PCR的基本原理 128
8.2 PCR条件的优化 129
8.3 由基本PCR拓展的相关技术及其应用 133
9 DNA分子标记技术 142
9.1 基于Southern杂交技术的分子标记 143
9.2 随机（或半随机）引物分子标记技术 147
9.3 序列标志位点技术 152
9.4 分子标记的应用领域 154
10 基因文库和目的基因的分离 160
10.1 基因文库的构建 160
10.2 克隆已知基因产物或核苷酸序列信息的基因 168
10.3 蛋白质功能互补克隆 171
10.4 定位克隆 173
10.5 差示减法杂交法系列 179
10.6 通过DNA全序列分析确定基因 183
11 转录前的基因活化 184
11.1 染色质结构与基因活化 185
11.2 核基质附着区与基因表达 188
11.3 DNA甲基化在调节基因表达的作用 193
12 转录水平的调控 198
12.1 基本转录过程 198
12.2 顺式作用元件 202
12.3 反式作用因子 206
12.4 真核生物基因转录调控的复杂性 211
12.5 研究基因表达调控中DNA－结合蛋白相互作用的实验方法 215
13 基因表达的转录后调控 219
13.1 真核生物前体mRNA剪接 220
13.2 高等植物内含子的结构特性 225
13.3 高等植物剪接体蛋白质的组成特点 230
13.4 变位剪接 230
13.5 RNA编辑 233
14 外源基因在真核细胞中的表达 237
14.1 选择标记和报告基因 237
14.2 DNA直接导入的基因转化方法 241
14.3 农杆菌作载体的植物转基因方法 244
14.4 转基因植物的鉴定 250
14.5 外源基因转化在基因表达调控研究中的应用 251
15 植物激素与基因表达调控 258
15.1 激素受体 259
15.2 激素作用的信号传递途径 261
15.3 激素与激素响应基因的表达调控 265
15.4 不同激素对同一基因表达的调控 272
16 光调节基因及其表达调控 274
16.1 植物光受体 275
16.2 光信号传递途径 279
16.3 光调节基因表达的转录水平调控 281
16.4 光敏色素基因的转录调控 285