第1章 导论 1
1.1 信息和信息系统 1
1.1.1 数据和信息 1
1.1.2 信息的特点 2
1.1.3 信息的作用 4
1.1.4 信息系统 5
1.2 生物多样性 6
1.2.1 生物多样性与生物多样性科学 6
1.2.2 生物多样性的价值 7
1.3 生物多样性信息系统 9
1.3.1 生物多样性信息系统的特点 9
1.3.2 生物多样性信息系统的相关部分及其科学数据库 11
1.3.3 集成的生物多样性信息系统 12
1.3.4 信息系统技术和技术支撑系统 14
1.3.5 利用生物多样性信息的动机和用户 17
1.3.6 生物多样性信息系统在生物多样性科学研究中的重要性 19
1.4 生物多样性信息系统发展现状 20
1.4.1 发达国家生物多样性信息系统发展现状 20
1.4.2 中国科研信息系统发展现状 21
第2章 生物多样性信息系统数据规范 25
2.1 元数据库 25
2.1.1 元数据和元数据库 25
2.1.2 网络上的元数据 26
2.1.3 元数据的注册 27
2.1.4 元数据库的内容 28
2.1.5 元数据库的建立 31
2.2.1 什么是数据字典 32
2.2.2 建立数据字典的目的 32
2.2 数据字典 32
2.2.3 元数据和数据字典的区别 33
2.2.4 数据字典的内容 33
2.2.5 数据字典的建立过程 34
2.3 实例：中国生物多样性元数据库 35
2.4 生物多样性信息分类与编码 42
2.5 中国生物多样性信息系统数据字典和元数据标准 46
第3章 保护生物多样性所需的信息及管理工具 47
3.1 保护生物多样性所需的信息 47
3.1.1 信息交流的管理 50
3.2 实例：中国国家数据库 51
3.1.2 地方性信息的管理 51
3.1.3 国家组织对保护信息的管理 51
3.3 数据管理工具 52
3.3.1 数据管理 53
3.3.2 地理信息系统（GIS） 55
3.3.3 文本的管理和整合 59
3.3.4 电脑化现存数据的工具 59
3.3.5 调和工具 60
3.3.6 环境同义词典 62
3.3.7 其他的改进工具 63
3.4 报告、分析和建模工具 64
3.4.1 物理建模和生态学过程 64
3.4.3 建模和政策制定 65
3.4.2 风险 65
第4章 生物多样性信息系统的技术实现 66
4.1 计算机网络技术 66
4.1.1 计算机网络概述 66
4.1.2 Internet 69
4.1.3 TCP/IP协议 70
4.1.4 IP地址和域名 71
4.1.5 计算机的通信方式 73
4.1.6 Internet提供的主要服务 74
4.1.7 Internet提供的其他服务 76
4.1.8 Internet网络浏览工具 78
4.1.9 进入Internet的方式 80
4.2.1 数据库的发展历史和基本概念 82
4.2 数据库管理信息系统 82
4.2.2 网络数据库系统的结构 85
4.2.3 并行数据库技术 87
4.2.4 分布工数据库与联邦数据库技术 88
4.2.5 数据库的互操作 89
4.2.6 面向对象数据库系统与多媒体数据库技术 93
4.2.7 模糊数据库与演绎数据库技术 95
4.2.8 与Internet有关的数据库技术 96
4.3 空间信息技术 101
4.3.1 概述 101
4.3.2 3S技术 102
4.3.3 在生物多样性科学研究中的应用 104
4.4.1 概述 109
4.4 WebGIS 109
4.4.2 设计思想 110
4.4.3 几种WebGIS的比较 111
4.4.4 应用前景 113
4.5 生物多样性信息系统的网络构建 114
4.6 工具的选择 115
4.6.1 软件选择 116
4.6.2 硬件选择 116
4.6.3 选择过程 117
4.6.4 数据管理系统的选择 117
4.6.5 CIS的选择 118
4.6.6 生物多样性应用软件 119
4.6.7 网络之外的信息发布工具 119
4.7 信息的广泛利用 120
4.7.1 信息交换标准 121
4.7.2 信息表达 123
4.7.3 信息发布 124
4.7.4 电子出版物 127
第5章 生物多样性信息系统的规划与管理 129
5.1 数据采集和管理 129
5.1.1 数据类型 130
5.1.2 确定数据需求 132
5.1.3 数据格式 133
5.1.4 数据收集和管理策略 136
5.1.5 管理者的职责 138
5.1.6 标准和指南 139
5.2 信息系统的规划 141
5.2.1 系统规划 141
5.2.2 数据策略 142
5.2.4 对策 143
5.2.3 队伍建设 143
5.3 数据评估技术 144
5.3.1 信息系统的评价 144
5.3.2 信息系统的建设重点 144
5.3.3 数据分析与评估 145
5.3.4 固有时空尺度 147
5.3.5 信息系统技术评估 147
5.3.6 支撑系统技术评估 148
5.4 信息管理成功的标准 149
5.4.1 内在标准 149
5.4.2 外在标准 150
5.5.1 信息需求和可提供的信息资源 151
5.5 组织机构能力的发展 151
5.5.2 组织机构的能力建设 152
5.5.3 技术选择 152
5.5.4 人力资源和培训 153
5.5.5 财政预算 154
5.6 信息管理的合法性 154
5.6.1 关于立法的信息 154
5.6.2 国际法的来源 155
5.6.3 主要法律条款 157
5.7 中国的生物多样性信息管理建设 159
5.7.1 信息管理体系建设 159
5.7.2 信息设施建设 160
5.7.3 信息系统建设 162
5.8 小结 164
第6章 国际流行的技术和解决方案 166
6.1 SPECIES 2000 166
6.1.1 目的 166
6.1.2 组成 167
6.1.3 开发 169
6.2 票据交换所机制（CHM） 170
6.2.1 概述 170
6.2.2 CHM的目标 172
6.2.3 CHM与《生物多样性公约》 174
6.2.4 涉及CHM的COP决议 176
6.2.5 CBD决策过程和CHM 177
6.2.6 CHM的热点问题 179
6.2.7 CHM和模式变化 184
6.3 21世纪生物多样性信息网络（BIN21） 185
6.3.1 BIN21 185
6.3.2 历史背景 185
6.3.3 国际合作和各地区的努力 187
6.3.4 BIN21的未来 188
6.4 生物多样性特殊兴趣的网络（SIN） 189
6.4.1 功能和活动 189
6.4.2 组织 189
6.4.3 质量控制 190
6.4.4 标准 191
6.4.5 参与和共享 194
6.4.6 同其他SIN的合作 195
6.4.7 网络出版（e-publishing） 195
6.4.8 SIN的分布式数据库结构 196
6.4.9 数字图书馆 197
6.4.10 自动处理 199
6.4.11 主要讨论的内容 199
6.4.12 BIN21节点 201
6.4.13 运行机制 203
第7章 中国生物多样性信息管理的艰难探索 205
7.1 数据资源现状 205
7.1.1 机构数据集调查内容与方法 206
7.1.2 机构调查结果分析 207
7.2 数据管理能力建设 211
7.2.1 数据管理能力建设现状评价 211
7.2.2 数据管理机构的建设 214
7.3.1 数据库的开发现状 220
7.3 中国生物多样性信息系统现状 220
7.3.2 信息系统与信息网络的建设现状 221
7.3.3 面临的问题 221
7.4 中国生物多样性信息系统的结构设计 222
7.4.1 逻辑结构 222
7.4.2 组织结构 223
7.5 中国生物多样性信息系统（CBIS）简介 224
7.5.1 良好的信息积累 224
7.5.2 目标 224
7.5.3 概念设计 225
7.5.4 CBIS的组织结构 226
7.5.5 建设进展 227
7.6.1 中国微生物资源数据库 229
7.6 中国生物多样性信息系统实例简介 229
7.6.2 中国科学院信息中心内陆水体生物学分部Web数据库 232
7.6.3 上海市生物多样性信息系统 235
第8章 全球主要的生物多样性信息资源 241
8.1 生物多样性信息源 243
8.1.1 图书馆、书目和书目数据库 243
8.1.2 国家级生物多样性信息中心 244
8.1.3 国家级生物多样性评价 246
8.1.4 全球和区域评价 248
8.1.5 在线信息源 252
8.1.6 CD-ROM和磁盘 256
8.1.7 数据源的目录 260
8.2.1 国际植物园保护联盟 262
8.2 其他与生物多样性研究相关的网站简介 262
8.2.2 国际物种信息系统 263
8.2.3 世界资源研究所（WRI） 263
8.2.4 生物多样性信息网络（BIN21） 263
8.2.5 生物多样性保护信息系统（BCIS） 264
8.2.6 美国国家卫生研究院国家医学图书馆国家生物技术信息中心（NCBI） 265
8.2.7 世界保护监测中心（WCMC） 266
8.2.8 美国自然保护组织（TNC） 271
8.2.9 全球生物多样性信息机构（GBIF） 271
8.3 生物多样性应用软件 272
附录A 中国生物多样性信息系统数据集标准 277
附录B 与生物多样性研究相关的缩略语及URL 286
参考文献 322
后记 327