第一章 功能基因组与蛋白质组 1
第一节 人类基因组计划及蛋白质组研究的历史背景 1
第二节 蛋白质组研究的开端及“蛋白质组”含义 10
第二章 蛋白质组研究方法 24
第一节 概述 24
第二节 大规模的蛋白质分离技术 27
第三节 高通量蛋白质鉴定技术 39
第三章 二维电泳的蛋白质提取与样品制备 48
第一节 细胞裂解的方法 49
第二节 蛋白质的分步提取技术 57
第三节 亚细胞分离与蛋白质提取 59
第四章 二维电泳与细胞蛋白质的分离 68
第一节 概述 68
第二节 一维等电聚焦电泳 72
第三节 二维SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳 80
第四节 胶上蛋白的检测 81
第五节 存在问题 87
第五章 图像分析与细胞蛋白谱的建立 91
第一节 蛋白电泳图像分析系统 91
第二节 二维电泳蛋白谱数据库 97
第六章 生物质谱技术与蛋白质鉴定 101
第一节 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 101
第二节 液相色谱-电喷雾-串联质谱 105
第三节 肽质量指纹谱鉴定蛋白质技术 110
第四节 串联质谱数据鉴定蛋白质技术 116
第七章 蛋白质翻译后修饰的鉴定 130
第一节 磷酸化蛋白质的鉴定 130
第二节 糖基化蛋白质的鉴定 145
第八章 定量蛋白质组学研究技术 165
第一节 利用荧光染料进行定量的蛋白质组分析技术 165
第二节 运用质谱进行定量的蛋白质组分析技术 168
第三节 蛋白质芯片技术 171
第九章 蛋白质组研究中的生物信息学 174
第一节 生物信息学简介 174
第二节 数据库的构建 180
第三节 蛋白质组研究中常用的网站及数据库 188
第十章 细胞器与蛋白质复合体的组成分析 203
第一节 细胞器的分离 203
第二节 细胞器的组成分析 214
第三节 蛋白复合体分离及组成分析 217
第一节 酵母双杂交技术及其应用 242
第十一章 蛋白质间连锁图的建立 242
第二节 免疫共沉淀技术 251
第三节 细胞共定位技术 257
第十二章 多能干细胞定向分化的蛋白质组研究 266
第十三章 肿瘤发生与发展的比较蛋白组研究 285
第一节 蛋白质组与肿瘤 285
第二节 肺癌转移的蛋白质组研究 285
第三节 辐射致癌相关蛋白质分子标志物的研究 296
第十四章 细胞凋亡的蛋白质组研究 304
第一节 细胞凋亡的信号传导 304
第二节 细胞凋亡的蛋白质组研究 315
第十五章 蛋白质组与新药开发 330
第一节 药物分子靶标的高通量筛选体系 332
第二节 药物的高通量筛选体系 337
第三节 药物作用的监测评价体系 340