第一章 绪论 1
一、什么是蛋白质 1
二、蛋白质在生命体中的重要地位 1
三、蛋白质的元素组成和结构组成 2
四、蛋白质的分类 3
五、蛋白质研究史上的重要人物和事件 4
六、我国国内蛋白质研究现状 5
七、当前蛋白质研究的热点和特点 6
第二章 蛋白质的基本结构单位——氨基酸 11
第一节 氨基酸的结构及分类 11
一、常见的蛋白质氨基酸 11
二、不常见的蛋白质氨基酸 14
三、非蛋白质氨基酸 15
第二节 氨基酸的理化性质与应用 16
一、氨基酸的物理性质 16
二、氨基酸的化学性质 18
第三节 氨基酸的制备、分离与分析 23
一、氨基酸的制备 23
二、氨基酸的分离与分析 24
第三章 氨基酸的连接——肽键与肽 29
一、肽键和肽的基本概念 29
二、肽键的结构 30
三、肽的物理和化学性质 31
四、生物活性肽 32
五、多肽组与多肽组学 33
第四章 蛋白质的表征 37
第一节 蛋白质的定量 37
一、紫外吸收法 37
二、Folin-酚法 39
三、BCA法 40
四、考马斯亮蓝G-250比色法（Bradford法） 42
五、利用微波快速蛋白质定量法 44
第二节 蛋白质纯度的测定 45
一、光谱法 45
二、层析法 46
三、电泳法 47
四、N-末端氨基酸测定法 47
五、生物活性测定法 48
六、纯度测定的原则 48
第三节 蛋白质相对分子质量的测定 48
一、SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳测定法 49
二、凝胶过滤层析法 53
三、生物质谱法 58
第四节 蛋白质等电点的测定 62
第五章 蛋白质的分子构象 68
第一节 蛋白质分子中的化学键及蛋白质一级结构 68
一、蛋白质分子中的化学键 68
二、蛋白质的一级结构 69
第二节 蛋白质的二级结构 69
一、α螺旋 69
二、β折叠 70
三、β转角 71
四、β凸起 72
五、无规卷曲 72
六、超二级结构和结构域 72
第三节 蛋白质的三级结构和四级结构 75
一、蛋白质的三级结构 75
二、蛋白质的四级结构 76
第四节 蛋白质折叠异构酶和分子伴侣 77
第六章 蛋白质构象解析技术策略 81
第一节 蛋白质一级结构测定 81
一、蛋白质序列测定的基本战略 81
二、蛋白质序列测定的一般步骤 81
三、测序过程中关键步骤的测定方法 82
四、蛋白质序列测定的新方法——生物质谱 91
第二节 蛋白质高级结构解析技术 92
一、X射线晶体衍射技术 93
二、核磁共振技术 96
三、高级结构解析的其他方法 101
第三节 蛋白质高级结构预测技术 103
一、蛋白质结构预测的实验理论基础 103
二、蛋白质结构预测方法 105
第七章 蛋白质的结构与功能 112
第一节 蛋白质结构的价值及其与功能的关系 112
一、蛋白质的功能是蛋白质结构的延伸 112
二、蛋白质结构是蛋白质功能的基础 112
三、蛋白质的功能在与其他分子相互作用的互动中实现 114
第二节 蛋白质一级结构与功能的关系 114
一、活性蛋白质与前体 114
二、一级结构与物种进化的关系 118
三、一级结构改变与分子病 120
第三节 蛋白质空间结构与功能的关系 120
一、血红素辅基的结构 121
二、肌红蛋白和血红蛋白的结构与功能 121
第四节 蛋白质构象病及其治疗策略 127
一、蛋白质构象病的概念 127
二、构象病的发生、发现及蛋白质构象致病假说 128
三、其他的蛋白质构象病 131
四、蛋白质构象病治疗的新思路 131
第八章 蛋白质的翻译后加工与修饰 135
第一节 蛋白质的翻译后加工 135
一、氨基端的加工 135
二、蛋白质肽链的加工 136
第二节 蛋白质的翻译后修饰 137
一、蛋白质的磷酸化修饰 137
二、蛋白质的糖基化修饰 143
三、蛋白质的泛素化修饰 146
四、蛋白质的乙酰化修饰 148
五、蛋白质的甲基化修饰 149
第九章 蛋白质的理化性质与分离鉴定 152
第一节 理化性质 152
一、蛋白质的酸碱性 152
二、蛋白质的胶体性质 152
三、蛋白质的变性、沉淀和凝固 153
四、蛋白质的紫外吸收 154
第二节 蛋白质的分离和纯化 154
一、蛋白质分离提纯的一般步骤 154
二、蛋白质分离、纯化的方法 155
第十章 蛋白质组学 172
第一节 蛋白质组学产生的历史背景 172
一、大规模生物学的兴起 172
二、从基因组、转录物组到蛋白质组 173
三、蛋白质组学的基本概念及意义 173
第二节 蛋白质组学的研究范畴 174
第三节 蛋白质组学研究的技术策略与技术平台 176
一、蛋白质组分离鉴定方法的发展 176
二、蛋白质组学研究的技术策略 180
三、大规模蛋白质组的制备、分离与鉴定 181
第四节 蛋白质组学的应用 186
一、在基础研究方面的应用 186
二、在医学与药物学中的应用 186
三、在农业科学研究中的应用 187
第五节 蛋白质组学的挑战 188
参考文献 191