第一章 植物内生菌的多样性 1
第一节 植物内生真菌多样性研究 1
第二节 植物内生细菌多样性研究 5
第二章 植物内生菌与宿主植物的关系及生物学作用 11
第一节 植物内生真菌与宿主植物的关系及生物学作用 11
一、植物内生真菌与宿主植物的关系 11
二、内生真菌的生物学作用 14
第二节 植物内生细菌与宿主植物的关系及生物学作用 26
一、植物内生细菌的来源 27
二、植物内生细菌在植物体内的存在方式 28
三、植物内生细菌侵染定殖过程的研究 30
四、植物内生细菌定殖影响因子研究 36
五、内生细菌的生物学作用及其机制 37
第三章 植物内生菌的研究技术及研究实例 53
第一节 植物内生菌分离和功能菌筛选 53
一、植物内生菌分离纯化方法 53
二、非培养（Culture-independent）方法应用于植物内生细菌的研究 55
三、植物功能内生菌筛选 57
四、功能内生菌改良 57
五、研究实例 60
第二节 植物内生菌的定殖检测 67
一、抗生素标记法 68
二、免疫学方法 69
三、基因标记法 69
四、特异性寡核苷酸片段标记法 71
五、发光标记系统 71
六、研究实例一 72
七、研究实例二 76
第三节 植物内生菌抑菌活性物质的研究方法 82
一、内生菌提取物的活性物质初筛 83
二、抗菌活性化合物的追踪分离和活性评价 84
三、抗菌活性化合物的提纯 84
四、研究实例 85
第四章 植物内生菌的开发与应用 102
第一节 内生真菌的开发与应用 102
一、生物防治 103
二、内生真菌在作物抗非生物胁迫上的应用 106
三、促生作用 107
四、发酵工程 108
五、内生真菌在医药方面的应用 108
第二节 植物内生细菌的开发和应用 111
一、内生细菌在生物防治上的应用 111
二、植物微繁系统（Micropropagation）的生物化（Biotization）或细菌化（Bacterization） 124
三、植物修复 125
四、果蔬采后保鲜剂 126
五、内生生物菌肥 127
六、化学农药植物内生降解菌剂 127
七、功能内生细菌资源库的构建 128
第五章 植物内生菌研究展望 129
一、植物内生菌生物学特性的研究 129
二、植物内生菌存在的普遍性 129
三、植物内生菌的起源 130
四、植物内生菌作用机理的研究 130
五、植物内生菌定殖研究 131
六、内生真菌研究展望 132
七、内生细菌研究展望 138
参考文献 140