第一章 历史 1
1.1古代结核病 1
1.2肺结核/肺病 3
1.3白色瘟疫 4
1.4结核分枝杆菌的发现 5
1.5疗养院和最初的治疗 6
1.6 19世纪和20世纪 9
1.7全球结核病紧急状态 13
第二章 结核分枝杆菌的分子进化 19
2.1分枝杆菌的基本进化系统 19
2.2结核分枝杆菌复合群的群体分子遗传学 22
2.3结核分枝杆菌和其宿主的协同进化 22
2.4穿越空间和时间的结核分枝杆菌 24
2.5寻找强大的进化标记 24
2.6为何重复序列从一开始就如此有用 25
2.7结核分枝杆菌的差异区和SNPs 25
2.8在多态性标记中寻找相关性 27
2.9结核分枝杆菌种群内的主要分枝 30
2.10结核分枝杆菌从牛转移到人体的时间 33
2.11结核分枝杆菌的比较基因组学和进化 34
2.12短期进化标记和数据库的建立 34
2.13结论和展望 35
第三章 临床细菌学基础 45
3.1结核分枝杆菌分类 45
3.2微观形态学 46
3.3细胞壁结构 48
3.4生长对营养和环境的要求 50
3.5生长时间 51
3.6代谢和生化标记 52
3.7对物理和化学因素的抵抗性 53
第四章 基因组学和蛋白质组学 57
4.1新技术对结核分枝杆菌基因组学的影响 57
4.2结核分枝杆菌基因组 58
4.3结核分枝杆菌基因表达 65
4.4结核分枝杆菌蛋白质组 69
4.5结核分枝杆菌代谢组学研究 73
4.6结束语 75
第五章 免疫学、致病机制与细菌毒力 86
5.1抗结核分枝杆菌免疫反应 86
5.2结核病病理发生机制与免疫病理学 93
5.3潜伏感染和免疫反应的维持 98
5.4肺结核免疫治疗 99
5.5结论 101
第六章 宿主的遗传学和易感性 119
6.1确认人类结核病易感性相关遗传因子的困难性 119
6.2对增加结核病易感性相关基因突变和多态性的研究 125
6.3机体抗结核免疫反应中的候选基因 129
6.4小鼠模型易感性研究时发现的基因 141
6.5结论与展望 145
第七章 全球结核病疫情 161
7.1结核病的全球流行 161
7.2结核病和艾滋病流行的相互作用 165
7.3 DOTS策略的进展 167
7.4遏制结核病的新策略 169
第八章 结核分枝杆菌复合群中其他细菌引起的结核病 173
8.1牛分枝杆菌感染人体引起的疾病 173
8.2 BCG疫苗副作用 177
8.3非洲分枝杆菌亚型 178
8.4感染田鼠分枝杆菌（M.mioroti）引起的疾病 179
8.5 caprae分枝杆菌和pinnipedii分枝杆菌 181
8.6结核分枝杆菌复合群菌种的鉴定 183
第九章 分子流行病学：重大成就和未来展望 195
9.1引言 195
9.2历史演变 196
9.3结核患者的感染 198
9.4 DNA指纹图谱、接触史调查和传染源的发现 198
9.5耐药结核的传播 199
9.6耐药性及北京基因型 200
9.7结核分枝杆菌的基因异质性与多重感染 201
9.8新型标准的基因标记物：VNTR分型 203
9.9 DNA指纹图像监测结核病消灭 204
9.10展望 204
第十章 新型结核疫苗 212
10.1引言 212
10.2历史回顾 213
10.3 BCG菌株的遗传多样性 214
10.4新疫苗：从实验室到临床试验 214
10.5候选亚单位疫苗 216
10.6亚单位疫苗加强BCG免疫 217
10.7重组BCG疫苗 218
10.8以减毒结核分枝杆菌为基础的活菌疫苗 219
10.9结论 220
第十一章 生物安全与医院防护 226
11.1医院中的生物安全 226
11.2实验室生物安全 231
第十二章 传统诊断方 246
12.1引言 246
12.2标本的处理 247
12.3涂片染色 248
12.4腺苷脱氨酶活性 250
12.5培养 251
12.6鉴定 254
第十三章 免疫学诊断 261
13.1历史回顾 261
13.2目前的结核病诊断方法 262
13.3免疫学诊断的基础 263
13.4血清学检测 264
13.5以T细胞为基础的检测方法 265
13.6结论与展望 267
第十四章 新型诊断技术 272
14.1引言 272
14.2自动化培养方法 272
14.3核酸扩增法 277
14.4基因型鉴别方法 283
14.5非传统表型诊断方法 288
第十五章 成人结核病 301
15.1引言 301
15.2早期损伤 301
15.3炎症反应 302
15.4结核感染 303
15.5结核病 303
15.6诊断方法 310
15.7潜伏性结核感染的治疗 314
15.8接触追踪及控制 315
15.9感染与疾病的界限 315
第十六章 儿童结核病 320
16.1引言 320
16.2病原学、疾病传播和发病机理 320
16.3原发肺结核 322
16.4非呼吸系统的结核病 324
16.5先天性结核病 325
16.6诊断 326
16.7儿童结核病的治疗 329
16.8疫苗 333
16.9儿童结核病的预后 334
第十七章 结核病和HIV/AIDS 340
17.1流行病学背景 340
17.2结核分枝杆菌与HIV的相互作用 341
17.3临床特征 341
17.4耐多药结核和HIV/AIDS 347
17.5对HIV/AIDS患者结核病的治疗 350
17.6免疫重建炎症反应综合征 353
17.7 HIV/AIDS患者潜伏感染结核的治疗 353
17.8 AIDS患者的分枝杆菌病 354
第十八章 抗痨药物及药物间的相互作用 363
18.1引言 363
18.2目前使用的治疗方案综览 364
18.3药物：结构、药代动力学和毒性 368
18.4耐药机制 374
18.5药物间的相互作用 377
18.6新型抗痨药物 379
18.7相关链接 382
第十九章 药物耐药和药物耐药检测 389
19.1引言 389
19.2药物耐药监测 389
19.3药物耐药的检测方法 392
第二十章 新的发展和展望 406
20.1简介 406
20.2细菌和疾病分子流行病学 407
20.3诊断学新观点 408
20.4耐药性检测问题 410
20.5药物研发进展 411
20.6疫苗开发 412
20.7研发资源的全球管理 413
20.8有用的链接 413