卷之首 23
至圣解 23
历代圣像（历代圣容纪） 25
历代经书纪载圣德 30
天地神祇传扬圣德 36
穆罕默德纪 41
至圣篇 41
至圣行述略（天方至圣本末行略） 43
卷之一 46
至圣源流五十代传光小传（至圣源流历代传光记） 46
卷之二 62
（四统源流图说） 62
世统源流图说 62
国统源流图说 63
道统源流图说 65
化统源流图说 66
四统总说（四统源流总说） 68
卷之三 71
年谱 71
卷之四 80
孕产奇征 80
初娠 80
临产 81
圣诞 82
卷之五 88
一岁至八岁事实（起降生初年至八年事实） 88
卷之六 101
九岁至四十岁事实（起降生九年至四十年事实） 101
卷之七 111
为圣先征 111
为圣元年至五年事实（起为圣初年至五年事实） 111
卷之八 131
为圣六年至十三年事实（起为圣六年至十三年事实） 131
卷之九 150
迁都元年事实 150
卷之十 165
迁都二年的事实 165
卷之十一 187
迁都三年至四年事实 187
卷之十二 201
迁都五年至六年事实 201
卷之十三 224
迁都七年至八年事实 224
卷之十四 240
迁都九年至十年事实 240
卷之十五 264
迁都十一年至终事实 264
卷之十六 289
感应补遗 289
卷之十七 297
至圣赞 297
卷之十八 309
仪行录（至圣仪行录） 309
仪容 309
德性 310
学问 310
沐浴 311
礼拜 311
念主 312
诵经 312
斋戒 313
施予 314
朝觐 314
语言 315
动止 315
父母 316
子嗣 316
婚姻 317
夫妇 318
兄弟 318
奴仆 319
交人 319
接物 320
晏会 320
待士 321
结友 322
和邻 322
营艺 323
干求 324
旅行 324
商议 325
医治 325
占卜 326
占梦 326
居处 326
冠服 327
食饮 327
视病 330
哈参问 330
侯腮尼问 332
卷之十九 336
天方圣国风土考证略 336
方域 336
气候 336
风俗 337
人物 337
崇奉 337
礼制 337
食饮 337
财货 338
工艺 338
学问 338
国纪 339
官制 339
刑政 339
科制 339
文字 340
奇器 341
附录国名（中史所载者） 341
西使记 341
天方国 344
默底纳 346
忽鲁漠斯 346
古里 347
哈烈 348
撒马儿罕 348
苏门答拉 350
五印度 350
榜葛拉 351
悖尼 352
南泥里 353
祖法儿 353
阿丹国 354
满拉加 354
溜山 354
亚鲁 355
拂秣 355
回回国 355
哈密 356
回鹘 356
回回教 356
回回历 357
回回钦天监 357
卷之二十 358
赞颂碑记序说 358
明高皇帝字赞（御制至圣百字赞） 358
明太宗敕谕（敕诰清修寺护持文） 358
明武宗皇帝评 358
敕回回太师文 358
回回天文书序 359
敕建清真寺碑记（敕建清真寺碑记文） 361
敕赐清修寺重修碑记 362
敕建净觉礼拜二寺碑记 362
天方圣教序 363
天房赋 364
清真教考叙（清真教考序） 365
群书释疑跋（群书汇辑释疑跋） 366
清真教说 368
回回说 370
（补遗） 372
真教寺碑记（自京口本补入） 372