第一章 绪论 1
第一节 细菌分类学的发展和趋势 1
目录 1
第二节 细菌的分类单元和命名规则 2
一、细菌的分类单元 2
二、细菌分类单元的命名规则 4
二、普雷沃分类系统 5
三、伯杰氏分类系统 5
一、克拉西里尼科夫分类系统 5
第三节 细菌的分类系统 5
第四节 细菌在生物界中的分类地位及其系统发育研究 8
一、细菌 9
二、古细菌 13
第二章 细菌的分类特征和细菌鉴定 15
第一节 细菌的分类特征 15
一、个体形态特征 15
二、培养特征 17
三、生理生化反应 19
四、生态因子 19
一、鉴定与分类的区别 20
第二节 细菌鉴定 20
五、细胞组分 20
六、血清反应 20
二、检索表 21
三、鉴定的工作原则与步骤 22
四、常规鉴定技术的发展 23
第三节 细菌快速鉴定中的分子生物学技术 24
一、核酸探针技术 24
二、DNA聚合酶链反应（PCR） 27
第四节 血清学快速鉴定方法 29
一、免疫酶技术 29
四、单克隆抗体技术 30
第五节 分析微生物学检验技术 30
三、免疫印迹杂交 30
二、免疫荧光技术 30
一、生长过程的测定 31
二、细胞组分及代谢产物的分析 31
三、细菌自动化鉴定系统 31
第三章 细菌分类方法 33
第一节 细菌的传统分类 33
第二节 数值分类 34
一、定义和原理 35
二、工作步骤 35
一、DNA碱基组成的测定 40
三、小结 40
第三节 细菌分类中的核酸分析 40
二、DNA分子杂交技术 43
三、16SrRNA同源性分析 46
四、小结 54
第四节 遗传学分类法 54
第五节 化学分类法 54
一、细胞壁组成 55
二、脂肪酸组成及代谢产物分析 57
三、蛋白质序列分析及电泳 58
五、DNA限制性片段长度多态性（RFLP）分析 59
四、多位点酶电泳（MLEE） 59
六、其他方法 61
第六节 血清学分类法 63
一、细菌抗原类型 63
二、常用分析技术 63
三、免疫电泳 64
第四章 革兰氏阴性细菌类群 65
第一节 螺旋体目 65
一、螺旋体科 66
二、钩端螺旋体科 67
二、螺菌属 68
第二节 需氧（或微需氧）的、运动的、螺旋状（或弧状）的革兰氏阴性细菌 68
一、水螺菌属 68
三、固氮螺菌属 69
四、海洋螺菌属 69
五、蛭弧菌属 69
第三节 不运动（或很少运动）的革兰氏阴性弯曲细菌 70
第四节 革兰氏阴性、好氧（或微好氧）的杆菌和球菌 71
一、假单胞菌科 71
二、固氮菌科 71
三、根瘤菌科 72
四、甲基球菌科 74
五、醋酸杆菌科 75
六、奈瑟氏菌科 76
七、未归入科的其他属 78
第五节 兼性厌氧革兰氏阴性杆菌 79
一、肠杆菌科 79
二、弧菌科 81
三、巴斯德杆菌科 82
四、科地位不定的属 83
第六节 厌氧、直的、弯曲的和螺旋状的革兰氏阴性杆菌 83
第八节 厌氧的革兰氏阴性球菌 84
第七节 还原硫酸盐或硫的异养细菌 84
一、立克次氏体目 85
第九节 立克次氏体和衣原体 85
二、衣原体目 86
第十节 枝原体 86
一、枝原体属 87
二、无胆枝原体属 87
三、螺原体属 88
四、植物和无脊椎动物的类枝原体 88
第十一节 内共生体 88
一、原生动物的内共生体 88
三、真菌和其他无脊椎动物的内共生体 89
二、昆虫内共生体 89
第五章 革兰氏阳性细菌类群 90
第一节 革兰氏阳性球菌 90
一、微球菌科 91
二、奇异球菌科 92
三、未归入科的其他属 92
第二节 产芽胞的革兰氏阳性杆菌和球菌 93
一、芽胞杆菌属 94
二、梭菌属 94
第三节 不产生芽胞、形状规则的革兰氏阳性杆菌 95
三、芽胞八叠球菌属 95
二、利斯特氏菌属 96
一、乳酸杆菌属 96
第四节 不产生芽胞、形状不规则的革兰氏阳性杆菌 97
一、棒杆菌属 97
二、节杆菌属 97
三、丙酸杆菌属 98
四、放线菌属 98
第五节 分枝杆菌类 99
第六节 诺卡氏菌类 99
五、双歧杆菌属 99
第六章 古细菌、蓝细菌和其余的革兰氏阴性细菌类群 101
第一节 不产氧的光合细菌 101
一、紫色细菌 102
二、绿色细菌 106
第二节 产氧的光合细菌 107
一、蓝细菌 108
二、原绿菌目 111
第三节 好氧的化能无机营养细菌 111
一、硝化细菌 112
四、氧化和（或）沉积铁与锰的细菌 114
三、专性化能无机营养的氢细菌 114
二、无色硫细菌 114
五、趋磁细菌 115
第四节 芽生和（或）有附属物的细菌 115
一、有附属物、芽殖细菌类群 116
二、有附属物、非芽殖细菌类群 117
三、无附属物、芽殖细菌类群 118
四、无附属物、非芽殖柄细菌类群 118
第五节 鞘细菌 119
第六节 非光合、无子实体的滑行细菌 120
一、噬纤维菌目 120
三、贝日阿托氏菌目 122
二、溶杆菌目 122
四、其他科和属 123
第七节 产子实体的滑行细菌（粘细菌目） 124
一、粘球菌科 125
二、原囊菌科 125
三、孢囊杆菌科 126
四、多囊杆菌科 126
第八节 古细菌 126
一、产甲烷的古细菌群 127
三、极端嗜盐的古细菌群 130
二、还原硫酸盐的古细菌群 130
五、极端嗜热的代谢元素硫的古细菌群 132
四、无细胞壁的古细菌群 132
第七章 放线菌 135
第一节 多腔孢囊放线菌 137
一、嗜皮菌属 137
二、弗兰克氏菌属 138
第二节 孢囊放线菌 139
一、游动放线菌属 139
二、指孢囊菌属 139
一、链霉菌属 140
三、游动单孢菌属 140
第三节 链霉菌及相关菌属 140
二、链轮丝菌属 142
第四节 其他产生分生孢子的放线菌 143
一、小单孢菌属 143
二、高温放线菌属 143
三、高温单孢菌属 144
四、拟诺卡氏菌属 144
五、马杜拉放线菌属 144
参考文献 145