弥勒菩萨所问经论 七卷 元魏菩提留支译 （颠一—七） 1
无量寿经优波提舍 一卷 元魏菩提留支译 （颠八） 183
转法轮经优波提舍 一卷 东魏毗目智仙等译 （颠八） 193
大般涅盘经论 一卷 东魏达磨菩提译 （颠九） 207
涅盘经本有今无偈论 一卷 陈真谛译 （颠九） 221
能断金刚般若波罗蜜多经论颂 一卷 唐义净译 （颠九） 229
遗教经论 一卷 陈真谛译 （颠十） 235
成唯识宝生论 四卷 唐义净译 （沛一—四） 273
十二因缘论 一卷 元魏菩提流支译 （沛五） 361
壹输卢迦论 一卷 东魏般若流支译 （沛五） 365
大乘百法明门论 一卷 唐玄奘译 （沛五） 370
转识论 一卷 陈真谛译 （沛五） 372
唯识三十论 一卷 唐玄奘译 （沛六） 381
因明入正理论 一卷 唐玄奘译 （沛六） 386
显识论 一卷 陈真谛译 （沛六） 395
发菩提心论 二卷 姚秦鸠摩罗什译 （沛七—八） 413
三无性论 二卷 陈真谛译 （沛九—十） 453
佛性论 四卷 陈真谛译 （匪一—四） 503
大乘成业论 一卷 唐玄奘译 （匪五） 619
业成就论 一卷 东魏毗目智仙译 （匪六） 643
因明正理门论 一卷 唐义净译 （匪七） 661
因明正理门论本 一卷 唐玄奘译 （匪八） 683
止观门论颂 一卷 唐义净译 （匪九） 705
手杖论 一卷 唐义净译 （匪九） 710
缘生论 一卷 隋达摩笈多译 （匪九） 719
取因假设论 一卷 唐义净译 （匪十） 739
观总相论颂 一卷 唐义净译 （匪十） 750
六门教授习定论 一卷 唐义净译 （匪十） 751
能断金刚般若波罗蜜多经论释 二卷 唐义净译 （亏一—二） 767
略明般若末后一颂赞 一卷 唐义净术 （亏二） 809
妙法莲华经优波提舍 二卷 元魏菩提留支共云林等译 （亏三—四） 815
妙法莲华经论优波提舍 二卷 元魏勒那摩提共僧朗译 （亏五—六） 855
大宝积经论 四卷 元魏菩提留支译 （亏七—十） 895