目录 1
前言 1
第1章 绪论 1
1.1 引言 1
1.2 矢量分子描述子研究的某些进展 3
1.2.1 分子连接性指数 3
1.2.2 电拓扑状态指数 3
1.2.3 分子指纹 4
1.2.4 谱学描述子 6
1.2.5 CoMFA与GRID描述子 7
1.2.6 与CoMFA相关的描述子 8
1.2.7 分子相似性描述子 9
1.2.8 WHIM描述子 10
1.2.9 小结 11
1.3 本文的研究内容 12
参考文献 14
第2章 建立分子电性距离矢量 23
2.1 基于四原子类型的分子电性距离矢量（MEDV-4） 24
2.1.1 MEDV-4中的几个基本概念 24
2.1.2 MEDV-4的构建 29
2.1.3 MEDV-4的计算机程序 33
2.2 分子全息距离矢量（MHDV） 35
2.2.1 原子类型、原子属性、相对键长 36
2.2.2 MHDV的构建 37
2.3 基于13种原子类型的MEDV 39
2.3.1 原子类型与原子属性 39
2.3.2 相对电性量度：修正的E-状态指数 42
2.3.3 MEDV-13的构建 43
参考文献 47
第3章 矢量描述子研究方法 49
3.1 矢量描述子对分子结构的分辨率 50
3.2 变量选择 53
3.2.1 描述子变量的初步选择 55
3.2.2 基于遗传算法的变量选择 56
3.2.3 基于最佳子集回归的变量选择 57
3.3 多元线性回归（MLR） 59
3.3.1 模型回归系数 60
3.3.2 MLR中几个重要统计量 62
3.3.3 标准回归系数和置信区间 63
3.4 主成分回归（PCR） 63
3.4.1 PCR基本原理 64
3.4.2 从PCR模型到MLR模型 65
3.5.1 PLSR基本原理 66
3.5 偏最小二乘回归（PLSR） 66
3.5.2 从PLSR模型到MLR模型 68
3.5.3 原始描述子变量的重要性分析 69
3.6 模型质量评价 70
3.6.1 模型估计能力 70
3.6.2 模型稳定性 71
3.6.3 模型预测能力 72
3.7 应用程序VSMP简介 73
3.7.1 VSMP 1.0主要模块与功能 73
3.7.2 应用程序VSMP的工作流程 75
参考文献 76
第4章 MEDV-4用于QSPR研究 79
4.1 烷烃分子结构表征与沸点QSPR模型 79
4.1.1 烷烃分子的MEDV-4 80
4.1.2 150个烷烃沸点QSPR模型 97
4.1.3 沸点模型的比较分析 102
4.2 烷烃其他性质QSPR模型 105
4.2.1 密度与折光指数 105
4.2.2 临界温度与临界压力 109
4.2.3 表面张力 112
4.2.4 摩尔体积、摩尔折光率与蒸发热 114
4.2.5 热容与热焓 117
4.2.6 液态与气态生成焓 122
4.2.7 色谱保留指数 124
4.3 链烃及醇结构表征与沸点相关 126
4.3.1 63个烯烃 127
4.3.2 147个链烃 133
4.3.3 106个醇 134
4.4.1 66个不含杂原子芳烃与沸点 158
4.4 芳烃化合物结构表征与性质相关 158
4.4.2 209个多环芳烃与色谱保留指数 165
参考文献 181
第5章 生物活性物质QSAR研究 184
5.1 MHDV用于两组二肽分子QSAR研究 185
5.1.1 二肽分MHDV描述子 186
5.1.2 最佳主成分数的选择 214
5.1.3 主成分回归模型与似回归（MLR-like）模型 218
5.1.4 偏最小二乘回归模型与似回归模型 222
5.1.5 结果比较 225
5.2 MHDV构建取代苯生物降解模型 226
5.2.1 取代苯分子结构表征 227
5.2.2 最佳主成分数的确定 227
5.2.3 似回归模型与检验 230
5.3.1 31个甾族化合物的结构表征 239
5.3 MEDV-13研究31个甾族化合物的生物活性 239
5.3.2 最佳主成分与PLS模型 243
5.3.3 变量选择与MLR模型 244
5.3.4 结果比较分析 248
5.4 MEDV-13研究CCK的生物活性 254
5.4.1 CCK化合物的结构表征 254
5.4.2 变量选择与最佳子集 255
5.4.3 多元线性回归模型 257
参考文献 261
第6章 几类COX-2抑制剂QSAR研究 264
6.1 吲哚美辛及其酰胺与酯 266
6.1.1 吲哚美辛衍生物的结构表征 266
6.1.2 最佳主成分与重要描述子选择 267
6.1.3 PLSR模型对应的似回归模型 273
6.2.1 DAP分子的结构表征 275
6.2 二芳基环戊烯酮类（DAP）抑制剂 275
6.2.2 最佳主成分选择 276
6.2.3 QSAR模型 279
6.3 噻唑酮与噁唑酮类（TOS）抑制剂 288
6.3.1 TOS分子的结构表征 288
6.3.2 最佳主成分选择与PLSR分析 290
6.3.3 最佳子集回归与MEDV变量分析 296
6.4 3,4-二芳基噁唑酮（DAA）类抑制剂 302
6.4.1 DAA分子结构表征 302
6.4.2 主成分选择与PLSR模型 305
参考文献 310
附录 发表与博士论文有关的学术论文 315
1 被SCI收录的学术论文 315
2 其他论文 317