1 导言：走进发育的分子分析 1
新的思路 3
问题的起始 6
描述性胚胎学的全盛时期 7
实验胚胎学的诞生 10
Morgan的“背离”：遗传学 11
僵局 12
遗传学和分子生物学的接轨 13
历史的教训？ 15
关于本书 15
发育过程中的DNA 19
2 DNA和RNA中的程序和调控元件 19
DNA序列的类型 22
基因和基因组 24
DNA中的调控序列 25
DNA序列的不可逆修饰 32
RNA中的调控区域 34
基因表达的协调 35
发育程序 37
高级程序 38
3 解码程式：转录 42
原核生物基因转录 43
真核生物转录装置 45
增强子和基因特异转录因子 48
转录因子的DNA结合特异性 50
增强子上复合物的装配：增强体 52
启动子和增强子之间的相互作用 57
染色质在基因转录中的作用 57
转录活性和染色质重构的动力学分析 59
真核细胞的转录抑制 60
转录装置与转录调控 62
发育过程中的转录调控：果蝇囊胚从区域划分到条带建立的转变 63
发育过程中的转录调控：免疫球蛋白μ重链基因的转录调控 66
转录的延伸和终止 68
转录活性与非活性状态的稳定性 68
RNA结合蛋白 70
果蝇发育中的RNA定位和发育体制的建立 72
4 细胞表面蛋白：受体、配体及其环境 77
细胞间的通讯：细胞信号 77
信号分子及受体的鉴别 79
对信号分子和受体的定性 81
信号分子类型 82
小分子信号分子 84
肽和蛋白质信号分子 86
受体 91
细胞表面受体 92
受体酪氨酸激酶 93
丝氨酸／苏氨酸激酶受体 93
磷酸酶受体 93
胞质激酶相关受体 96
具有7次跨膜结构域的受体 98
其他细胞表面受体 98
作为受体的信号蛋白 101
胞内受体 101
受体-配体相互作用的调节 103
作为信号调制器策源地的脊椎动物组织者 107
胞外环境与细胞信息 107
5 细胞相互作用的胞内效应：信号转导通路与网络 110
上位性与信号转导通路分析 111
信号的流通媒介 113
接头模体 115
一种检测分子间相互作用的工具 117
蛋白激酶和磷酸酶的模块 118
G蛋白和细胞内的开关 119
信号转导通路 121
驱动效应器核定位的信号路线 121
Delta-Notch信号转导通路 122
NFκB/dorsal信号转导通路 122
JAK-STAT信号转导通路 123
转化生长因子β-Smad信号转导通路 125
膜-核传递：MAPK信号级联 127
第二信使信号转导通路 131
cAMP和PKA 131
脂类第二信使途径 132
Hedgehog信号转导 135
Hedgehog和Wnt信号转导 135
Wnt信号转导 136
细胞相互作用中信号转导的调控及其动力学特征 139
改变信号转导通路组分的活性 140
改变信号转导通路组分的浓度和稳定性 140
信号的区室化 142
信号转导通路的整合 145
信号网络的连接和整合 146
信号在细胞核中的整合 149
6 细胞及细胞间的相互作用 154
胞外基质 156
中间丝 158
细胞骨架 158
微管 160
肌动蛋白纤维 162
细胞粘连和细胞连接 165
细胞黏着的媒介分子 168
细胞粘连与信号转导 172
细胞极性 176
顶-基极性 176
平面极性 178
细胞的形态、运动和迁移 181
细胞运动的线索 186
7 细胞的基本生命程序：分裂、分化和死亡 189
细胞周期 189
细胞周期调控因子 191
细胞周期工作机制 193
细胞周期检验点：整合与监控 196
早期发育过程中的细胞周期 197
细胞分裂和细胞生长的相互协调 199
与细胞生长和细胞增殖联系的细胞外调控 202
细胞周期与细胞分化 202
细胞死亡：一种终级“分化” 207
细胞死亡机制 209
发育中的死亡信号 211
发育中细胞生存的调控 213
细胞数目与总体积 213
细胞谱系和细胞间相互作用 216
8 谱系的形成：发育程序的常规展现 216
谱系和命运图 218
干细胞谱系 220
干细胞因子 221
类干细胞谱系 223
复合确定性谱系 224
水蛭 226
秀丽隐杆线虫 228
谱系内的细胞命运决定 229
酿酒酵母和秀丽隐杆线虫谱系属性决定子的分隔机制 231
神经系统发育过程中谱系属性决定子的分隔机制 233
Notch信号转导：谱系介导细胞命运分派中的一种常用手段 237
Notch信号转导的时空调控 241
细胞命运分派过程中重复的分子机制 242
不确定谱系和多克隆谱系的区室 244
9 细胞多样性发生中的长程诱导和短程诱导 249
诱导与位置信息 249
长程和短程诱导分子 253
细胞对诱导信号的应答：感受态 257
诱导事件的信号诱导修饰 258
形态发生素的概念：对可扩散信号的应答分级 261
备选形态发生素 262
果蝇中的备选形态发生素 262
bicoid 262
dpp 265
dorsal 265
脊椎动物中的备选形态发生素 269
经典形态发生素概念的局限性 271
梯度分子信息的建立 274
对梯度分子信息的解读 274
图式形成过程中的长程与短程模式机制 276
10 细胞类型的特化：发育的操作 280
基因时空表达活性的分析方法 280
肌肉的发育：肌发生 283
肌细胞的起源 283
不同中胚层命运的建立 286
生肌调控因子与生肌路线的确定 289
肌肉分化 295
神经发生：中枢神经系统 297
中枢神经系统的起源 298
神经组织的出现 300
神经系统的轴向组织 302
神经发育路径的定型 303
神经元的诞生：神经元类型的特化 306
果蝇的神经发生 306
细胞命运建立的调控序位 309
11 一维与二维发育模式 314
秀丽隐杆线虫产卵器的发育和图式形成 314
产卵器前体细胞的产生与特化 316
来自锚状细胞的信号：Ras信号通路与VPC的特化 316
VPC:1in-12信号 321
VPC命运的实施 323
产卵器的形态发生 325
果蝇幼虫表皮的发育和图式形成 325
发育参照和极性的建立 326
细胞多样性形成和相互协同 331
发育图式的出现 331
牙齿的发育和图式形成 334
牙齿发育的启动 336
形态发生与分化 337
牙齿的不同类型 338
细胞二维图式构建的普遍原理 339
肢体与附肢 342
12 三维发育模式 342
脊椎动物肢体发育的起始 344
肢芽AP轴和DV轴的协同建立 345
昆虫附肢的发育起始 346
脊椎动物肢体发育的细胞学参数 347
由AER推动的PD轴图式形成与生长的起始 349
肢芽生长过程与定位信息的分子载体 352
ZPA与AER信息的整合 353
背-腹轴在肢体图式形成中的作用 353
近-远端轴的生长和图式形成 356
由Hox编制与确定的位置信息 357
果蝇附肢的发育和图式形成 359
趾的发育 359
翅发育的起始 360
翅的图式建立和生长 360
翅的发育图式：翅脉 366
脊椎动物肢体和果蝇附肢的发育和图式构建策略 367
分支结构：昆虫的气管系统与脊椎动物的肺 368
果蝇的气管系统 368
气管系统中细胞类型的特化 369
气管系统分支结构的形态发生 371
分支迁移中细胞的特化 372
脊椎动物肺的发育 373
三维图式形成有没有普适原则？ 375
英汉名词对照 378
索引 383