第1章 绪论 1
1.1 计算机在生命科学领域的应用 1
1.2 学习本课程的目的与意义 3
1.3 学习本课程的基本方法 3
第2章 因特网与网上生物学资源 5
2.1 因特网概述 5
2.2 因特网的相关概念、提供的服务类型和软件 5
2.3 网上生物学信息资源分类 12
2.4 计算机检索原理 15
2.5 计算机检索基本原理 17
2.6 生物文献检索途径 19
第3章 搜索引擎与生物学资源导航站点 22
3.1 Internet上WWW生物资源的查询途径 22
3.2 搜索引擎的查询方法 23
3.3 非WWW生物资源检索途径 42
3.4 因特网涉及生物学习的资源介绍 48
3.5 引用Internet资源的注意事项 49
第4章 因特网上的生物学文献数据库 51
4.1 文献搜索引擎 51
4.2 生物相关文摘型数据库 60
4.3 全文数据库介绍 71
4.4 会议论文数据库 80
4.5 学位论文数据库 81
4.6 专利数据库 83
4.7 标准数据库 86
4.8 获取原文的方法总结 87
第5章 特定文献数据库的构建 88
5.1 文献管理软件的共同特点 88
5.2 Reference Manager软件的使用 89
5.3 国产文献管理软件——医学文献王简介 101
6.1 文献阅读的意义和方法 105
第6章 文献阅读与综述撰写 105
6.2 科技综述的写作 109
第7章 常用核酸蛋白质数据库介绍 112
7.1 常用核酸和蛋白质数据库及文件格式 112
7.2 其他注释序列数据库 132
7.3 基因组和特殊物种数据库 133
7.4 其他数据库 134
第8章 生物数据库检索 135
8.1 利用SRS（序列检索系统）搜索数据库 135
8.2 利用Entrez进行数据库搜索 139
8.3 DBGET/LinkDB 147
第9章 以序列相似性为准则的数据库搜索 148
9.1 序列相似性搜索 148
9.2 氨基酸取代矩阵 150
9.3 数据库搜索：FASTA和BLAST 151
9.4 序列过滤 154
9.5 反复数据库搜索和PSI-BLAST 155
第10章 PRISM统计分析软件的使用 156
10.1 常用统计软件介绍 156
10.2 GraphPad Prism使用介绍 158
上机实验 164
实验1 常用搜索引擎及专业搜索引擎的使用 164
实验2 PubMed的使用 164
实验3 常用文献数据库及专业数据库检索 165
实验4 利用文献管理软件构建文献数据库 166
实验5 常用分子生物学数据库检索 167
实验6 利用Entrez、SRS工具检索相关核酸蛋白数据库 168
实验7 利用Blast进行数据库相似性搜索 169
实验8 利用GraphPad Prism 4进行统计分析及作图 171
实验9 依给定题目进行文献检索并完成文献综述的写作 172