第1篇 基因组、转录组和蛋白质组 3
第1章 人类基因组 3
1.1 DNA 5
1.2 人类基因组 20
1.3 人类基因组计划为什么很重要 30
第2章 基因组结构 34
2.1 基因组结构概观 36
2.2 真核生物基因组结构 41
2.3 原核生物基因组结构 58
2.4 基因组中的重复DNA序列 69
第3章 转录组和蛋白质组 79
3.1 基因组表达概述 80
3.2 细胞内的RNA组分 83
3.3 细胞内的蛋白质组分 91
第2篇 基因组研究 109
第4章 DNA研究 109
4.1 DNA操作中所用的酶 112
4.2 DNA克隆 124
4.3 PCR反应 139
第5章 基因组作图 146
5.1 遗传学图和物理图谱 149
5.2 遗传学作图 150
5.3 物理学作图 172
第6章 基因组测序 192
6.1 DNA测序方法 193
6.2 连续DNA序列的拼接 203
6.3 人类基因组计划 213
第7章 解读基因组序列 219
7.1 在基因组序列中定位基因 220
7.2 确定单个基因的功能 229
7.3 基因组活性的整体性研究 242
7.4 比较基因组学 250
第3篇 基因组功能 259
第8章 接近基因组 259
8.1 核的内部 260
8.2 染色质修饰和基因组表达 267
第9章 转录起始复合物的组装 280
9.1 DNA结合蛋白的重要性 283
9.2 转录起始中DNA-蛋白质的相互作用 298
9.3 转录起始的调控 308
第10章 RNA的合成和加工 321
10.1 mRNA的合成和加工 322
10.2 非编码RNA的合成和加工 345
10.3 前RNA的化学修饰加工 353
10.4 mRNA的降解 358
10.5 真核细胞内的RNA转运 361
第11章 蛋白质组的合成与加工 367
11.1 tRNA在蛋白质合成中的作用 368
11.2 核糖体在蛋白质合成中的作用 376
11.3 蛋白质翻译后加工 390
11.4 蛋白质降解 399
第12章 基因组活性的调控 404
12.1 基因组活性的瞬时变化 407
12.2 基因组活性的永久性和半永久性变化 419
12.3 发育过程中基因组活性的调节 425
第13章 基因组复制 445
第4篇 基因组的复制与进化 445
13.1 拓扑结构问题 446
13.2 复制过程 453
13.3 真核生物基因组复制的调控 473
第14章 突变、修复和重组 482
14.1 突变 485
14.2 DNA修复 502
14.3 重组 514
第15章 基因组的进化模式 530
15.1 基因组：最初的100亿年 531
15.2 新基因的获得 536
15.3 非编码DNA与基因组进化 548
15.4 人类基因组：最近的500万年 553
第16章 分子系统进化学 558
16.1 分子系统进化学的起源 559
16.2 基于DNA的进化树的重建 562
16.3 分子系统进化学的应用 570
附录 585
词汇表 588