第一章 绪论 1
第一节 生物信息学概述 1
第二节 信息学基础 10
第二章 医学信息学基础 15
第一节 医学信息学概述 15
第二节 医学信息学的研究与应用 22
第三节 医学信息学发展趋势 24
第一节 生物信息学的计算机基础 30
第三章 生物信息学的计算机和互联网基础 30
第二节 生物信息学的互联网络基础 32
第四章 生物信息学中的生物学、分子生物学 43
第一节 生物信息学中的生物学、分子生物学基础知识 43
第二节 基因工程和核酸研究技术简介 52
第五章 生物信息学信息资源检索的常用工具 56
第一节 概述 56
第二节 通用型检索工具 59
第三节 医学专业搜索引擎 66
第四节 生物医学信息检索工具的综合利用 71
第一节 浏览器及其应用技巧 73
第六章 生物信息学网上浏览及网络文件传输 73
第二节 文件压缩与解压 77
第三节 文件传输与FTP 78
第四节 网络蚂蚁 80
第五节 离线浏览工具WebZIP 82
第六节 文档阅读工具Acrobat Reader 84
第七节 图像浏览软件ACDSee 85
第一节 重要生物信息中心简介 88
第七章 生物医学信息学的重要信息中心和主要数据库 88
第二节 生物大分子序列核心数据库 92
第三节 生物信息学中常用的三大数据库 95
第四节 其他重要的生物医学网站介绍 104
第八章 生物医学网络资源及获取 107
第一节 网络生物医学资源 107
第二节 网络文献数据库检索 113
第三节 特殊网络医学资源 118
第一节 核酸序列的检索 131
第九章 核酸序列分析 131
第二节 核酸序列的基本分析 132
第三节 核酸序列比对分析 135
第十章 基因组信息分析 142
第一节 基因组生物信息概述 142
第二节 基因组信息分析 146
第三节 DNA中的功能性位点搜索 150
第十一章 蛋白质序列分析和蛋白质功能预测 153
第一节 蛋白质和蛋白质组研究的意义 153
第二节 蛋白质序列检索 156
第三节 蛋白质序列基本性质分析 158
第四节 蛋白质功能预测 160
第五节 蛋白质结构预测与结构生物信息学 163
第六节 后基因组学、信息学和分子相互作用简介 169
第十二章 生物信息学与基因芯片 176
第一节 基因芯片概述 176
第二节 生物信息学和基因芯片的相互关系 182
第三节 生物信息学在基因芯片技术应用中的举例 185
第四节 基因芯片制备和应用中的原则及注意事项 191
第十三章 生物信息学与生物制药 195
第一节 概述 195
第二节 生物信息学在新药研发中的作用 196
第三节 生物信息学推动了药物基因组学的发展 203
第四节 未来药物研究方法展望 210
第十四章 医用生物信息学教学实习 216
实习一 生物医学网络原始文献的获取 216
实习二 核酸序列的搜索与分析 218
实习三 PCR引物设计的原理和方法 221
实习四 基因组分析 225
实习五 蛋白质序列分析 227
附录 230
附录一常用缩略语及词汇表 230
附录二分子生物学与分子遗传学相关数据库表 238
附录三生物医学有关数据库表 242
附录四生物医学文献数据库表 247
参考文献 248