1绪论 1
1.1生物化学的概念和内容 1
1.2生物化学发展简史 1
1.3生物化学与化学工程及有关学科的关系 3
2蛋白质化学 5
2.1蛋白质通论 5
2.1.1蛋白质的化学组成 5
2.1.2蛋白质的分类 5
2.1.3蛋白质的生物学功能 7
2.2蛋白质的基本结构单位——氨基酸 8
2.2.1氨基酸的一般结构特征 8
2.2.2氨基酸的分类 10
2.2.3氨基酸的重要理化性质 12
2.3肽 18
2.3.1肽的结构与功能 18
2.3.2天然活性肽 20
2.4蛋白质的分子结构 22
2.4.1蛋白质的共价结构 22
2.4.2蛋白质的二级结构 29
2.4.3蛋白质的三级结构 33
2.4.4蛋白质的四级结构 34
2.5蛋白质结构与功能的关系 34
2.5.1 一级结构与功能的关系 34
2.5.2高级结构与功能的关系 36
2.6蛋白质的性质 37
2.6.1紫外吸收 37
2.6.2两性解离 37
2.6.3胶体性质 37
2.6.4沉淀反应 38
2.6.5蛋白质变性 38
2.6.6蛋白质的水解 39
2.6.7蛋白质的颜色反应 40
3酶与辅酶 41
3.1概述 41
3.1.1酶的概念 41
3.1.2酶的化学本质 41
3.1.3酶的特点 42
3.2酶的分类与命名 42
3.2.1酶的分类 42
3.2.2酶的命名 44
3.3酶促反应动力学 44
3.3.1酶促反应的本质 44
3.3.2酶反应机制 45
3.3.3酶促反应的基本动力学 47
3.3.4酶浓度对酶促反应速率的影响 51
3.3.5 p H值对酶促反应速率的影响 51
3.3.6温度对酶促反应速率的影响 51
3.3.7激活剂对酶促反应速率的影响 52
3.4酶的抑制作用 52
3.4.1不可逆抑制作用 53
3.4.2可逆抑制作用 53
3.5酶的调节 56
3.5.1酶的活性部位 56
3.5.2酶原与酶原的激活 56
3.5.3酶的别构调控 57
3.5.4酶的共价修饰 59
3.5.5同工酶 60
3.6维生素与辅酶 60
3.6.1脂溶性维生素 60
3.6.2水溶性维生素 63
4生物氧化 69
4.1生物氧化和生物氧化酶类 69
4.1.1生物氧化的基本概念 69
4.1.2生物氧化酶类 72
4.2呼吸链 74
4.2.1呼吸链的主要组分 74
4.2.2氧化呼吸链 77
4.2.3胞浆中NADH的转移 78
4.3 ATP的生成、储存和利用 79
4.3.1 ATP的生成方式 79
4.3.2氧化磷酸化偶联部位的测定 80
4.3.3氧化磷酸化中ATP生成的结构基础 81
4.3.4氧化磷酸化的偶联机制 81
4.3.5氧化磷酸化抑制剂 82
4.3.6氧化磷酸化的调节 83
4.3.7高能磷酸化合物的储存和利用 83
5糖与糖代谢 85
5.1概述 85
5.1.1糖类的化学 85
5.1.2代谢通论 86
5.2糖的分解代谢 87
5.2.1糖酵解（EMP途径） 87
5.2.2糖的有氧氧化 92
5.2.3乙醛酸循环（DCA循环）——三羧酸循环支路 99
5.2.4磷酸戊糖途径（HMP途径） 100
5.3糖的合成代谢 103
5.3.1糖原的合成代谢 103
5.3.2糖异生作用 105
6脂类代谢 109
6.1脂类的酶促水解 109
6.1.1脂类的消化和吸收 109
6.1.2脂类转运和脂蛋白的作用 110
6.2脂肪的分解代谢 111
6.2.1甘油三酯的水解 111
6.2.2甘油的命运 111
6.2.3脂肪酸的β-氧化 112
6.2.4脂肪酸的其他氧化方式 116
6.3脂肪的合成代谢 116
6.3.1乙酰辅酶A的转运 116
6.3.2胞浆合成——全程合成途径 117
6.3.3微粒体合成——脂肪酸的加工改造 118
6.3.4不饱和脂肪酸的合成 120
6.3.5三脂酰甘油的生物合成 121
6.4磷脂和胆固醇代谢 121
6.4.1磷脂代谢 121
6.4.2胆固醇的代谢 123
7氨基酸代谢 125
7.1蛋白质酶促降解 125
7.1.1蛋白质营养的重要性 125
7.1.2蛋白质的需要量和营养价值 125
7.1.3蛋白质的消化与吸收和腐败 126
7.2氨基酸的分解代谢 128
7.2.1氨基酸的脱氨基作用 128
7.2.2氨基酸的脱羧基作用 130
7.2.3α-酮酸的代谢 131
7.3氨基酸合成代谢 132
7.3.1脂肪族氨基酸的生物合成 132
7.3.2芳香族氨基酸的生物合成 140
7.3.3组氨酸的生物合成 142
8核苷酸和核酸 143
8.1核酸概述 143
8.1.1核酸的发现 143
8.1.2核酸遗传物质的确立 143
8.1.3 DNA双螺旋结构的发现及模型建立 144
8.1.4核酸的现代研究进展 144
8.2核酸的组成成分 145
8.2.1碱基 145
8.2.2核苷 145
8.2.3核苷酸 146
8.3 DNA结构 148
8.3.1 DNA的化学组成 148
8.3.2 DNA的一级结构 148
8.3.3 DNA的空间结构 149
8.4 DNA与基因组 154
8.4.1基因的概念 154
8.4.2基因的特点 155
8.4.3基因组 155
8.5 RNA的结构与功能 156
8.5.1 RNA的类型 156
8.5.2 RNA的一级结构 156
8.5.3 RNA的高级结构 156
8.5.4 RNA组 160
8.6核酸的性质 161
8.6.1核酸的性质 161
8.6.2核酸的水解 162
8.6.3核酸的变性、复性和杂交 162
9核苷酸代谢 164
9.1核苷酸分解代谢 164
9.1.1核苷酸分解代谢主要涉及的酶 164
9.1.2核苷酸的酶促降解 165
9.2核苷酸合成代谢 167
9.2.1嘌呤核苷酸的生物合成 167
9.2.2嘧啶核苷酸的生物合成 170
9.2.3脱氧核糖核苷酸的生物合成 172
9.2.4核苷三磷酸的生物合成 172
10核酸的生物合成 173
10.1 DNA生物合成 173
10.1.1 DNA复制所需要的酶 173
10.1.2 DNA的复制方式 174
10.1.3 DNA复制的过程 175
10.1.4 DNA的修复 177
10.2 RNA生物合成 180
10.2.1转录 181
10.2.2参与转录的酶——RNA聚合酶 181
10.2.3转录过程 182
10.2.4基因转录的调节 183
10.2.5基因转录的方式 185
10.2.6 RNA的转录后加工 186
11蛋白质的生物合成 187
11.1遗传密码 187
11.1.1密码子 188
11.1.2遗传密码的基本特性 188
11.2核糖体 189
11.2.1核糖体的组成 189
11.2.2核糖体的功能 190
11.3氨基酸的活化——氨酰tRNA的合成 191
11.3.1氨基酸与tRNA的反应 191
11.3.2氨酰tRNA合成酶 191
11.3.3氨酰tRNA合成酶可识别特定底物 193
11.4起始密码子与起始tRNA 193
11.4.1起始密码子 193
11.4.2起始tRNA 194
11.5翻译过程 194
11.5.1密码子的识别 194
11.5.2肽链合成的起始 194
11.5.3肽链的延伸 196
11.5.4肽链合成的终止 198
11.6翻译后修饰加工 198
11.6.1 N末端甲硫氨酸的切除 199
11.6.2二硫键的形成 199
11.6.3氨基酸残基的修饰 199
11.6.4肽链的水解修饰 199
11.6.5与辅助物结合 199
11.6.6亚单位的聚合 199
11.7蛋白质的分泌和转运 200
11.7.1信号肽引导蛋白质的转运 200
11.7.2线粒体和叶绿体蛋白质的运输 201
11.7.3细菌蛋白质的运输 202
11.8蛋白质生物合成的抑制剂 202
11.8.1抗生素 202
11.8.2毒素 202
11.8.3抗代谢物 203
12物质代谢的调控 204
12.1物质代谢的相互关系 205
12.1.1糖代谢与脂类代谢的相互关系 205
12.1.2糖代谢与蛋白质代谢的相互关系 206
12.1.3脂类代谢与蛋白质代谢的相互关系 206
12.1.4核酸代谢与糖、脂肪及蛋白质代谢的相互联系 206
12.2代谢的调节 207
12.2.1细胞水平的调节 208
12.2.2激素水平的调节 209
12.2.3整体水平的调节 210