第一章 电喷雾质谱历史、理论和仪器原理 1
第一节 简介：喷雾技术革命 1
一、ESI出现之前的质谱技术 1
二、电喷雾电离技术的发展 4
第二节 操作原理 11
一、ESI/APCI离子源的组成 11
二、电喷雾电离：“去除溶剂，而非解吸附过程” 12
三、电喷雾的过程：“纯”ESI条件下电喷雾电离针上发生的事件 13
四、在小液滴干燥过程中发生的事件 16
五、真空接口 19
六、各种各样的辅助技术 20
七、溶剂和缓冲液 26
八、ESI-MS中观察到的各种离子 29
九、非共价复合物 30
十、从ESI质谱图看质谱离子与液相离子的关系 32
十一、与大气压化学电离的比较 33
第三节 质量分析器 35
一、连续检测离子的质谱仪 35
二、脉冲式质谱仪 38
三、复合式串联质谱 47
第四节 质谱的其他参数 48
一、质量校正 48
二、分辨率 51
一、联立方程求算法 52
三、质量准确度 52
第五节 ESI-MS的数据处理 52
二、分辨同位素峰 53
三、数据转换（去卷积拆分）方法 55
第六节 结论 60
参考文献 60
附录几种常用ESI校正校样的质荷比 91
第二章 纳升喷雾电离的发展：LC/MS及CE/MS应用 100
第一节 简介 100
第二节 纳升流量的电极 103
一、流量与电喷雾针的构造 103
二、纳升流量样品导入系统的一些实例 110
第三节 纳升流量液相色谱-质谱联用 122
一、分析液相色谱色谱柱的小型化 123
二、色谱柱和纳升电极的整体式装置 124
三、多路NanoLC系统实例 125
四、今后的方向 130
第四节 结论 132
参考文献 134
第三章 电喷雾电离质谱定性分析药物及天然产物 142
第一节 导言 142
第二节 小分子化合物的结构特征 144
一、分子量的确定 144
二、多电荷电离 146
三、盐 148
四、液相色谱-质谱联用 149
五、化学衍生和大气压化学电离源 154
六、串联质谱 155
第三节 抗生素及天然产物的结构解析 157
一、抗生素 157
二、利用［M＋H］+和［M＋Na］+离子解析结构 162
三、相似化合物的质谱图 167
四、负离子 169
五、准确质量测定 171
参考文献 178
第四节 结论 178
第四章 电喷雾质谱在组合化学中的应用 182
第一节 导言 182
第二节 化合物的鉴定 184
第三节 纯化过程 186
第四节 质量控制 189
第五节 筛选 191
一、生物亲和性筛选 191
二、用QTOF质谱的准确质量测定 194
三、FT-ICR质谱的准确质量测定 196
第六节 分析前景 198
参考文献 200
第七节 结论 200
第五章 电喷雾质谱在现代药物代谢和药物动力学中的应用 206
第一节 导言 206
第二节 药物代谢及药物动力学中的质谱平台 207
一、四极杆质谱仪器的作用 207
二、四极杆离子阱质谱仪的作用 208
三、飞行时间质谱的作用 210
四、四极杆／TOF复合型仪器的作用 213
第三节 电喷雾质谱应用的发展 213
一、定量分析 213
二、确定药物的生物转化 215
第四节 电喷雾质谱在新药开发研究中的应用 218
一、新药开发研究中的定量分析 219
二、新药开发中的生物转化 220
第五节 自动化高通量分析 224
一、样品制备 225
二、选择MS条件 226
三、样品分析 226
四、数据处理与校阅 231
五、尝试平行定量 233
参考文献 236
第六章 电喷雾质谱分析多肽与蛋白质方法学研究及其应用 244
第一节 导言 244
第二节 电喷雾质谱分析完整的蛋白质：方法学研究 246
二、样品污染 247
一、蛋白质混合物的电喷雾质谱 247
第三节 电喷雾质谱的应用 250
一、蛋白质组学 250
二、二硫键的确定 251
三、非共价键结合的蛋白质复合物 253
第四节 分离和序列测定 256
一、毛细管LC-MS 256
二、毛细管LC-MS在蛋白质组学上的应用 258
三、多肽的毛细管电泳质谱 259
第五节 高质量多肽和蛋白质的串联质谱分析 266
第六节 结论 270
参考文献 271
第七章 电喷雾质谱分析糖蛋白的结构 275
第一节 简介 275
第二节 确定糖蛋白的分子量 276
一、分子量和多元性 276
二、纳升电喷雾和正交加速TOF质谱 280
第三节 糖蛋白指纹分析 285
一、多糖的类型 285
二、蛋白序列指纹分析和糖基化位点的确认 286
三、确定连接位点的非均一性 292
第四节 未来的发展方向 294
参考文献 295
第一节 简介 299
第八章 先进的质谱方法快速研究和定量分析蛋白质组 299
第二节 蛋白质组的目前测定方法 301
第三节 使用质谱确定蛋白质 303
第四节 利用FTICR质谱的特性测定蛋白质组 304
第五节 完整蛋白质的蛋白质组分析方法 307
一、毛细管等电聚焦法分离蛋白质 308
二、CIEF与FTICR质谱联用 309
三、自动处理数据和结果显示 310
第六节 FTICR方法确定完整的蛋白质 313
一、依据分子量确定完整的蛋白质 313
二、依据MS/MS数据确认完整的蛋白质 314
三、依据同位素标记确认完整的蛋白质 317
一、准确质量标签用于蛋白质的确认 319
第七节 测定全体蛋白质的蛋白质组分析方法 319
二、提供准确质量标签确定翻译后修饰 323
三、同位素编码亲和标签的准确质量标签 325
第八节 根据实验产生的准确质量标签 327
一、通过MS/MS来确认AMT 327
二、多元MS/MS方法 328
第九节 高通量测定蛋白质的相对强度 331
一、稳定同位素的代谢标记 332
二、后提取的稳定同位素标记法 341
第十节 将来的方向 344
参考文献 345
第一节 简介 352
第九章 非共价复合物的电喷雾电离质谱分析 352
第二节 蛋白-配体相互作用 354
一、pH值的影响 355
二、溶剂的影响 358
三、ESI锥孔电压的影响 359
第三节 药物-蛋白质-配体复合物 360
一、ras-GDP-配体 360
二、确定键合的位置 362
第四节 蛋白-金属络合物 364
一、钙调节 蛋白／Ca 364
二、HCV/Zn 366
二、γ-IFN 367
第五节 蛋白-蛋白结合 367
一、亮氨酸拉链肽 367
三、大蛋白复合物 369
第六节 蛋白-核酸相互作用 372
第七节 药物-核酸复合物 373
一、与HIV-RNA键合的抗生素 373
二、药物-DNA的相互作用 374
第八节 结论 375
参考文献 375
第十章 氢交换法和电喷雾质谱研究蛋白质的结构及动态构象 379
第一节 简介 379
一、蛋白质的氢交换背景 380
第二节 实验方法和实验设计 380
二、MS测量H/D交换的实验方法 382
三、质谱分析蛋白质的片段 383
四、确定氘代的速率常数 384
第三节 应用 386
一、蛋白-配体和蛋白-金属离子相互作用 386
二、蛋白质的折叠及动态构象 389
三、筛选可用作重组药物的蛋白质 394
四、从组合化合物库中筛选蛋白质 394
五、单个酰胺分析方案 395
第四节 结论和展望 397
参考文献 398
第十一章 利用微升电喷雾分析微量透析得到的神经肽及药物 401
第一节 简介 401
第二节 仪器 403
一、毛细管喷雾针头 403
二、获得高灵敏度的测定方法 404
三、样品的在线预纯化 405
四、使用微升ESI和串联质谱分析体内微量渗析物 407
第三节 测量在细胞外释放的内源性神经降压素 407
第四节 神经降压素代谢物的研究 411
第五节 药物的微升电喷雾和体内微量渗析 415
第六节 结论 417
参考文献 417