导论 1
第一节 药物发现 1
一、药物发现历史 1
二、药物发现的含义和特征 2
三、我国药物发现的现状和发展前景 3
四、药物发现的阶段 3
五、新药R＆D的社会属性 8
第二节 药物设计 12
一、靶点和配体 12
二、药物作用的体内过程 13
三、先导化合物 13
四、合理药物设计 14
五、筛选途径 17
六、虚拟筛选 19
七、先导化合物的优化 19
结语 20
第一章 基于筛选途径的药物发现 21
第一节 化合物的来源 21
一、天然产物的提取物 21
二、通过组合化学合成的化合物 24
三、各研究机构库存化合物 24
第二节 组合化学和组合化合物库 24
一、概述 24
二、固相组合合成 25
三、液相组合化学 33
四、动态组合化学 39
五、虚拟组合化合物库 40
第三节 筛选模型和方法学 41
一、药物靶点的识别和确证 41
二、筛选模型和方法学 41
三、高通量筛选 43
四、高内涵筛选 46
结语 48
第二章 基于靶点的药物设计 49
第一节 药物发现的方法学 49
一、基于功能的途径 49
二、基于症状的途径 50
三、基于机制的途径 51
四、三种药物发现途径的特点比较 52
第二节 药物靶点的发现 53
一、药物靶点的内涵 53
二、确定药物靶点在新药研究中的意义 54
三、药物靶点研究的现状 54
四、药物靶点的发现途径 55
五、药物靶点发现的识别和确证过程 56
六、药物靶点研究的主要技术平台 59
第三节 基于靶点的药物设计方法 60
一、基因性靶点及药物设计方法 60
二、机制性靶点及药物设计方法 62
第四节 实例 63
一、抗消化道溃疡药物的研究 63
二、抗肿瘤药物的研究 68
三、治疗阿尔茨海默病药物的研究 73
结语 79
第三章 基于结构的药物设计 80
第一节 概述 80
一、基于结构的药物设计 80
二、计算机辅助药物设计 81
第二节 基于结构的药物设计基本理论和方法 83
一、药物－受体相互作用理论 83
二、分子三维结构的理论计算方法 87
三、分子三维结构的实验测定方法 95
四、分子模型技术 97
五、计算机硬件和软件 99
第三节 基于靶点结构的药物设计——直接法 101
一、分子对接与打分函数 102
二、基于受体的药效团模型方法 105
三、基于片段的药物设计 106
第四节 基于配体结构的药物设计——间接法 112
一、基于配体药效团模型的药物设计 113
二、基于药效团的三维结构搜寻 117
三、基于定量构效关系的药物设计 117
结语 123
第四章 基于性质的药物设计 124
第一节 概述 124
第二节 药物理化性质与其体内过程间的关系 125
一、药物在体内的ADME过程 125
二、药动学 134
第三节 类药性及其测量方法 137
一、类药性 137
二、类药性的测量方法 138
第四节 类药性预测方法 142
一、基于知识的经验法 142
二、计算法 144
第五节 药动学优化 147
一、通过结构修饰改善化合物药动学性质 147
二、通过制剂方法改善药物药动学性质 152
结语 157
第五章 药物发现的虚拟筛选方法 159
第一节 概述 159
第二节 化学信息处理 160
一、化学结构的计算机表达 160
二、化合物数据库的构建和管理 167
三、分子相似性和多样性分析 169
四、互联网上的化学信息资源 171
第三节 生物信息处理 172
一、序列分析 173
二、蛋白质结构预测 177
三、互联网上的生物信息资源 180
第四节 虚拟筛选 181
一、基于靶点结构的虚拟筛选 182
二、基于配体药效团的虚拟筛选 185
三、虚拟筛选后评估 186
第五节 应用实例 188
一、利用基于结构虚拟筛选方法发现选择性雌激素受体β配体 188
二、利用基于药效团虚拟筛选方法发现大麻素CB1受体拮抗剂 190
结语 192
第六章 先导化合物的优化 193
第一节 先导化合物优化的目标 193
一、先导化合物优化的准备 193
二、先导化合物优化的基本原则 193
第二节 基于增强药效学性质的先导化合物优化 195
一、局部修饰 195
二、生物电子等排原理 198
三、拼合原理 210
四、结构简化 216
五、对映体优化 217
六、骨架结构变换 219
第三节 基于改善ADME/T特性的先导化合物优化 225
一、副作用选择优化法 225
二、前药原理 226
三、软药 239
结语 243
第七章 酶抑制剂和肽拟似物 245
第一节 酶抑制剂 245
一、概述 245
二、酶抑制剂的特征 246
三、酶抑制剂的类型 246
四、设计原理和方法 250
第二节 肽拟似物 260
一、概述 260
二、设计方法和原理 261
第三节 设计实例 272
一、肾素和血管紧张素转化酶抑制剂 272
二、凝血酶抑制剂 279
三、HIV蛋白酶抑制剂 283
结语 285
第八章 药物剂型与制剂的设计 286
第一节 药物剂型与制剂 286
一、药物剂型与制剂及其重要性 286
二、药物常用剂型 288
三、药物传递系统 289
四、药用辅料及其在制剂中的作用 290
第二节 药物剂型选择与制剂设计 291
一、制剂设计的基本原则 291
二、剂型选择与制剂设计的一般方法 292
第三节 药物制剂研究的基本内容 299
一、药物制剂的处方前研究 300
二、制剂的处方筛选 300
三、制剂的工艺优化 300
四、制剂质量研究 301
五、制剂稳定性研究 301
六、制剂包装材料考察 301
结语 302
索引 303