第一篇 基 础篇 3
第一章 基因健康信息学的兴起 3
第一节 基因组导向下的健康管理是现代疾病防治的有效手段 3
第二节 基因健康信息学是基因健康事业的基础 9
参考文献 17
第二章 基因健康信息学理论基础 19
第一节 基因、基因组、健康的定义及其相互关系 19
第二节 基因健康信息学及具体内容 28
参考文献 34
第二篇 技 术篇 37
第三章 基因健康信息系统的数据仓库 37
第一节 基因健康信息数据库建设的意义、原则、内容和标准 37
第二节 基因健康信息系统基础架构 40
第三节 基因健康信息系统的数据仓库的设计 47
参考文献 57
第四章 基因健康信息数据分析和挖掘技术 59
第一节 基因健康系统数据挖掘概述 59
第二节 显著性检验技术 60
第三节 决策树和决策规则 64
第四节 非线性回归技术 66
第五节 聚类技术 68
第六节 分类技术 72
第七节 多因素分析和变量选择技术 76
第八节 相关性分析技术 79
第九节Meta分析及系统评估技术 84
第十节 基因健康信息检索技术 91
第十一节 基因健康信息可视化技术 103
参考文献 106
第五章 基因和组学数据的产生、表示和分析 108
第一节 基因表达与疾病信息分析技术 108
第二节 基因转录调控与疾病信息分析技术 114
第三节 基因分子网络与疾病信息分析技术 124
第四节 表观遗传学与疾病信息分析技术及相关数据库 139
第五节SNP与健康信息分析技术 152
第六节 循证医学及相关信息资源 185
参考文献 198
第三篇 应 用篇 203
第六章 基因健康信息学系统应用体系 203
第一节 基因健康信息系统目标用户 203
第二节 基因信息健康系统整体架构和功能分析 206
参考文献 210
第七章 基因健康相关合作计划及信息资源库 211
第一节 在线人类孟德尔遗传数据库 211
第二节 国际肿瘤基因组计划及相关数据库 217
第三节 人类宏基因组计划 227
第四节 人类泛基因组计划 230
第五节 人类古老基因组计划 232
第六节 药物基因组相关数据库 235
第七节 环境及毒理基因组计划数据库 241
参考文献 246
第八章 基因健康信息管理系统实例 249
第一节 基因多态性群体遗传结构的主成分和非线性分析 249
第二节 基因微阵列数据的决策树分析 253
第三节 基于非线性回归分析的差异基因选择 256
第四节DNA序列分类的统计分析 258
第五节 基因序列聚类 264
第六节 肿瘤基因表达谱分类 273
第七节 判别分析在基因检测中的应用 277
第八节 基因多态性与内因症发病风险相关性的荟萃分析 279
参考文献 282
附录1 284
附录2 287