第一章 生态学研究概述 1
1.1 生态学研究的基本思想 2
1.1.1 层次观 2
1.1.2 整体论 2
1.1.3 系统学说 3
1.1.4 协同进化 3
1.2 现代生态学研究的热点问题 3
1.2.1 现代生态学研究的特点与内容 3
1.2.2 现代生态学研究的热点问题 4
1.3 生态学研究的基本方法 7
1.3.1 原地观测 7
1.3.2 受控实验 8
1.3.3 生态学研究的综合方法 8
第二章 试验设计与数据统计分析 10
2.1 试验设计原理 10
2.2 试验设计类型 11
2.3 生物统计的常用术语 15
2.3.1 总体与样本 15
2.3.2 参数与统计量 15
2.3.3 准确性与精确性 15
2.3.4 随机误差与系统误差 16
2.4 平均数、标准差与变异系数 16
2.4.1 平均数 16
2.4.2 标准差 19
2.4.3 变异系数 21
2.5 方差分析 21
2.5.1 方差分析的意义和作用 21
2.5.2 方差分析的基本原理及步骤 22
2.5.3 单因素试验资料的方差分析 25
2.6 方差分析的数学模型与期望均方 27
2.6.1 数学模型 27
2.6.2 期望均方 28
第三章 取样技术 29
3.1 样地制图 29
3.1.1 陆地生境制图 30
3.1.2 水塘与河流制图 32
3.2 简单随机取样 34
3.2.1 取样误差 35
3.2.2 样本平均数的置信区间 35
3.2.3 理论取样数的确定 36
3.2.4 样本抽取方法 39
3.3 分层取样 41
3.3.1 分层取样的样本平均数与样本方差 41
3.3.2 分层取样理论取样数的确定 42
3.4 标记重捕技术 45
3.4.1 标记技术 45
3.4.2 Lincoln指数法 47
3.4.3 Jolly-Seber随机法 48
3.5 种群相对数量的估计 52
3.5.1 估计方法 52
3.5.2 影响相对数量估计的因素 55
3.6 去除取样法 55
3.6.1 回归分析法 56
3.6.2 三点法 56
3.6.3 极大似然法 58
3.7 群落数量特征的调查方法 59
3.7.1 样方法与种-面积曲线 59
3.7.2 样条法 62
3.7.3 点样法 63
3.7.4 无样地法 64
3.8 样本容量的确定 64
3.8.1 连续变量 65
3.8.2 离散变量 67
3.8.3 生态学特有变量 68
3.8.4 通用方法与经验方法 70
第四章 种群结构与过程研究 71
4.1 种群的基本特征 71
4.1.1 种群的空间分布 71
4.1.2 种群的数量特征 74
4.1.3 种群的遗传特征 77
4.1.4 邻接效应 77
4.2 生命表技术 78
4.2.1 特定时间生命表 78
4.2.2 特定年龄生命表 82
4.2.3 生命表组建方法 83
4.3 数学生态模型 83
4.3.1 生态学模型的概念 84
4.3.2 建立生态模型的一般步骤 85
4.3.3 生态模型的一般成分 86
4.3.4 生态模型的类型 87
4.3.5 建立模型的一般方法 88
4.4 种群与种间关系模型 89
4.4.1 单种群模型 89
4.4.2 双种群模型 93
4.4.3 k-种群作用模型（k≥3） 98
4.4.4 矩阵模型 101
4.4.5 随机模型 106
4.4.6 生态位的测度方法 113
4.5 种群数量估计 114
4.5.1 种群的数量动态 114
4.5.2 种群的空间动态 117
4.5.3 种群数量调节 118
4.5.4 种群数量估计 119
第五章 群落结构与生物多样性研究 121
5.1 群落结构分析 121
5.1.1 生物群落的概念 121
5.1.2 地球上群落的主要类型 121
5.1.3 群落结构分析 124
5.1.4 生物群落的基本特征 128
5.1.5 生物群落的种类组成及其数量特征 129
5.2 群落动态分析 134
5.2.1 生物群落的季节动态 134
5.2.2 生物群落的年变化 134
5.2.3 经验模型 136
5.2.4 群落的演替 137
5.2.5 群落的演替模型 142
5.3 群落分类与排序 144
5.3.1 群落分类 144
5.3.2 群落的排序 148
5.4 生物多样性研究 149
5.4.1 多样性的定义 150
5.4.2 物种多样性的研究方法 150
5.4.3 物种多样性在空间上的变化规律 153
5.4.4 决定多样性梯度的因素 154
第六章 生态系统的系统分析方法 156
6.1 生态系统的基本知识 156
6.1.1 生态系统的概念 156
6.1.2 生态系统的组成 157
6.1.3 生态系统的基本特征 157
6.1.4 生态系统的完整性 159
6.1.5 生态循环 159
6.1.6 生态系统稳定性 160
6.2 生态系统模型 161
6.2.1 模型的组成 161
6.2.2 建模过程 162
6.2.3 模型验证 166
6.2.4 灵敏度分析 166
6.3 生态系统的能量流动 167
6.3.1 能量流动遵循的规律 167
6.3.2 生态系统中能量的主要来源 167
6.3.3 能量流动遵循的基本热力学定律 168
6.3.4 生态系统中的辅助能 169
6.3.5 生态系统的能量分析 170
6.3.6 农业生态系统能流关系的调整方向 177
6.4 生态系统的物质循环 179
6.4.1 生态系统物流的一般特点 179
6.4.2 物质循环的基本类型 181
6.4.3 水循环 183
6.4.4 碳循环 185
6.4.5 氮循环 187
6.4.6 磷循环 190
6.4.7 钾循环 191
6.4.8 硫循环 192
6.4.9 农业生态系统中的养分循环 194
6.5 生态系统分析 205
6.5.1 分室模型：方法和实例 205
6.5.2 湖泊富营养化模型 208
6.6 生态系统生产力的测定 215
6.6.1 初级生产中的能流分析 215
6.6.2 次级生产中的能量流动 222
第七章 景观研究方法 225
7.1 景观要素 225
7.1.1 斑块 225
7.1.2 廊道 228
7.1.3 基质 230
7.1.4 景观异质性 231
7.1.5 景观空间格局 231
7.1.6 网络 233
7.2 景观生态分类与评价 235
7.2.1 景观生态分类 235
7.2.2 生态系统健康评价 237
7.2.3 生态系统综合评价 239
7.3 景观生态学研究方法 242
7.3.1 3S技术 242
7.3.2 景观模型 243
7.4 景观规划与设计方法 246
7.4.1 景观生态规划的概念与内涵 246
7.4.2 景观生态规划的原则 246
7.4.3 景观生态规划的步骤 247
7.4.4 景观生态规划的类型 250
7.5 RS和GIS在景观研究中的应用 254
7.5.1 RS及其在景观研究中的应用 254
7.5.2 GIS及其在景观研究中的应用 258
7.6 地统计学方法在景观研究的应用 260
第八章 微生物生态学研究方法 268
8.1 微生物生态学研究的传统方法 268
8.1.1 样品的采集、富集培养和微生物纯培养的分离 268
8.1.2 最大或然值法 269
8.1.3 活菌计数法 269
8.2 微生物生态学研究的分子生物学方法 269
8.2.1 核酸探针杂交技术 269
8.2.2 PCR特异性扩增技术 270
8.2.3 rRNA基因同源性分析方法 271
8.2.4 变性梯度凝胶电泳技术 271
8.3 微生物生态模型 272
8.3.1 实验模型 272
8.3.2 数学模型 274
8.3.3 竞争方程式 275
8.3.4 共生方程式 276
8.3.5 捕食方程式 277
8.3.6 生物群落的数学模型 278
8.3.7 组建数学模型常用的方法 280
第九章 生态环境影响评价方法 281
9.1 生态环境影响调查与监测 281
9.1.1 生态环境现状调查 281
9.1.2 生态环境现状调查项目 282
9.2 生态环境现状估计与评价 283
9.2.1 物种评价 283
9.2.2 群落评价 283
9.2.3 栖息地评价 283
9.2.4 生态系统完整性评价 284
9.2.5 生态环境保护目标及其界定 284
9.3 生态环境影响预测与评价 285