1 野猪的特征与分类 1
1.1 野猪的生物学特性 1
1.1.1 野猪的体貌特征 1
1.1.2 野猪的行为 2
1.1.3 野猪的天敌 2
1.2 分布 2
1.2.1 原始分布范围 2
1.2.2 现代分布范围 3
1.3 分类 4
1.3.1 古代三种名谓“猪”的动物 4
1.3.2 世界猪的种类、分布和现状 5
1.3.3 现代野猪的生物学分类 7
1.3.4 现代野猪及其近亲资源 8
1.4 野猪遗传学研究进展 12
1.4.1 野猪的染色体研究 12
1.4.2 野猪线粒体DNA与家猪起源、进化关系的研究 12
1.4.3 野猪部分核内基因的研究 15
1.5 野猪资源的开发与利用 16
1.5.1 野猪与家猪杂交利用情况 16
1.5.2 野猪开发利用前景 19
1.6 黑龙江省野猪特征 20
1.6.1 体型外貌 20
1.6.2 繁育性能 20
1.6.3 生长性能 20
2 生物多样性 21
2.1 生物多样性的概念 21
2.1.1 生物多样性概念的提出 21
2.1.2 生物多样性的定义 22
2.1.3 生物多样性指数 22
2.2 生物多样性的四个层次 23
2.2.1 遗传多样性 23
2.2.2 物种多样性 28
2.2.3 生态系统多样性 31
2.2.4 景观多样性 42
2.3 中国生物多样性的一般特点 42
2.3.1 物种高度丰富 43
2.3.2 特有属、种繁多 43
2.3.3 区系起源古老 44
2.3.4 栽培植物、家养动物及其野生亲缘的种质资源异常丰富 44
2.3.5 生态系统丰富多彩 45
2.3.6 空间格局繁复多样性 46
2.4 生物多样性的经济价值及面临的问题 47
2.4.1 生物多样性的经济价值 47
2.4.2 生物多样性经济价值的特点 49
2.4.3 生物多样性遭受危害的原因 50
2.4.4 生物多样性的丧失与其经济价值的关系 52
2.4.5 生物多样性价值在空间上的流动 52
2.5 保护中国生物多样性的对策 53
2.5.1 正确认识生物多样性的价值，全面评价生物多样性 54
2.5.2 正确处理社会经济发展与生物多样性保护的关系，调整国家政策 54
2.5.3 协调部门机构间的关系，为总的保护目标而齐心协力 54
2.5.4 制定统一的国家生物多样性保护纲要策略 55
2.5.5 持续利用生物资源 55
2.5.6 开展多种经营，综合利用土地资源 55
2.5.7 就地保护野生物种及其栖息地和生态系统，加强保护区建设和管理 55
2.5.8 加强重要物种及其遗传资源的迁地保护 56
3 遗传多样性研究的原理与方法 57
3.1 遗传标记的定义及发展历史 57
3.1.1 遗传标记的定义 57
3.1.2 遗传标记的发展历史 58
3.2 形态标记的原理、方法与应用 59
3.2.1 原理 59
3.2.2 方法 60
3.2.3 应用 60
3.3 细胞标记的原理、方法与应用 61
3.3.1 染色体核型分析原理和方法 61
3.3.2 染色体显带技术原理和方法 62
3.3.3 应用 63
3.4 生化标记的原理、方法与应用 64
3.4.1 原理 64
3.4.2 方法 65
3.4.3 应用 65
3.5 分子标记的原理、方法及应用 66
3.5.1 原理 66
3.5.2 方法 66
3.6 基于杂交技术的分子标记技术 67
3.6.1 限制性片段长度多态性（RFLP） 67
3.6.2 原位杂交（In Situ Hybridization） 73
3.7 以PCR为基础的分子标记技术 80
3.7.1 随机扩增多态性（RAPD） 80
3.7.2 扩增片段长度多态性（AFLP） 83
3.7.3 DNA指纹技术（DAF） 90
3.7.4 单链构像多态性PCR（PCR-SSCP） 94
3.8 以重复顺序为基础的标记技术 97
3.8.1 简单序列重复标记技术 97
3.8.2 简单序列重复间区标记技术（ISSR） 101
4 核型和显带研究 104
4.1 猪的核型和显带研究情况 104
4.1.1 家猪的核型和显带研究情况 104
4.1.2 野猪染色体研究 106
4.2 材料与方法 109
4.2.1 实验动物 109
4.2.2 实验器材 109
4.2.3 实验药品 110
4.2.4 制备染色体标本的方法 110
4.2.5 C显带技术 112
4.2.6 G显带技术 112
4.2.7 摄影 113
4.2.8 统计分析 113
4.3 结果与分析 114
4.3.1 染色体标本制备的最适条件和适宜的显带方法 114
4.3.2 东北野猪的核型分析结果 116
4.3.3 东北野猪染色体C带、G带及高分辨G带核型 117
4.4 讨论 122
4.4.1 影响东北野猪及其与家猪杂种猪染色体标本制备效果的因素 122
4.4.2 制备染色体高分辨G带的方法 123
4.4.3 东北野猪的染色体数与核型 124
4.4.4 东北野猪的染色体C带、G带和高分辨G带 125
4.5 结论 128
5 线粒体控制区（D-Loop）的遗传多样性 129
5.1 线粒体基因组的结构及遗传特性 129
5.1.1 细胞内线粒体DNA的数目和大小 129
5.1.2 线粒体DNA的结构与组成 129
5.1.3 线粒体基因组的遗传特性 130
5.1.4 线粒体基因组与核基因组的关系 132
5.1.5 线粒体DNA多样性在家猪中的应用 132
5.1.6 D-Loop环的遗传多样性研究 135
5.1.7 黑龙江省野猪线粒体基因组 142
5.2 系统进化研究 144
5.2.1 系统进化树 145
5.2.2 构建系统进化树的步骤 145
5.2.3 构建系统进化树的方法 145
5.3 材料与方法 148
5.3.1 实验材料 148
5.3.2 实验方法 150
5.3.3 结果与分析 155
5.3.4 讨论 159
5.3.5 结论 164
6 黑龙江野猪的组织相容性复合体Ⅱ类基因的多态性分析 165
6.1 主要组织相容性复合体（MHC）的研究进展 165
6.1.1 MHC基因结构、功能、遗传特性 165
6.1.2 不同物种MHC基因研究进展 166
6.1.3 MHC基因在动物遗传学基础研究上的意义 178
6.1.4 基因在动物育种方面的应用 179
6.2 材料与方法 181
6.2.1 实验材料 181
6.2.2 实验方法 182
6.2.3 生物信息学分析 187
6.3 结果与分析 188
6.3.1 黑龙江野猪的SLA-Ⅱ类基因的克隆测序结果 188
6.3.2 黑龙江野猪的SLA-Ⅱ类基因的PCR-RFLP检测结果 192
6.4 讨论 194
6.4.1 SLA-Ⅱ类基因的表达研究 194
6.4.2 SLA-Ⅱ类基因的多态性分析 195
6.5 结论 197
7 黑龙江野猪10个与繁殖性状相关功能基因的多态性分析 199
7.1 研究背景及国内外研究进展 199
7.1.1 研究背景 199
7.1.2 候选基因法及QTL 200
7.1.3 10个功能基因的研究概况 205
7.2 材料与方法 213
7.2.1 实验材料 213
7.2.2 实验方法 214
7.3 结果与分析 216
7.3.1 雌激素受体基因的多态性检测结果 216
7.3.2 卵泡刺激素β亚基基因的多态性检测结果 217
7.3.3 促黄体激素基因的多态性检测结果 217
7.3.4 催乳素受体基因的多态性检测结果 217
7.3.5 Ⅰ型兰尼定受体基因的多态性检测结果 218
7.3.6 视黄醇结合蛋白基因的多态性检测结果 218
7.3.7 骨桥蛋白基因的多态性检测结果 218
7.3.8 谷胱甘肽过氧化物酶5基因的多态性检测结果 218
7.3.9 猪α1-岩藻糖转移酶基因的多态性检测结果 219
7.3.10 核受体辅激活蛋白1基因的多态性检测结果 219
7.4 讨论 219
7.4.1 关于ESR,FSHβ,PRLR和FUT1基因 219
7.4.2 关于GPX5,NCOA1,OPN和RBP4基因 220
7.4.3 PCR-SSCP检测结果 221
7.5 结论 221
参考文献 222