第一篇：早期台湾历史 3
《禹贡》岛夷“卉服”、“织贝”新解 3
不容青史尽成灰——对台湾国民中学教科书《认识台湾》（历史篇）、（社会篇）“去中国化”倾向的批判 9
陈第、沈有容与《东番记》 28
周婴《东番记》研究 43
从荷兰史料看明天启年间中国军民的抗荷斗争 73
第二篇：清代台湾历史 91
施琅在清初对台湾的经营和治理 91
论清代移民台湾之政策——兼评《中国移民史》之“台湾的移民垦殖” 100
施琅与清初的大陆移民渡台政策 121
大陆移民渡台的原因与类型分析 138
清代巡台御史制度研究 159
清代台湾边疆移垦社会之特点与妈祖信仰 174
论尹士俍《台湾志略》的史料价值——以社会经济史为例 204
城隍信仰与台湾历史 231
清代前期台湾的田园赋则 241
清代台湾官庄研究 262
清代台湾的开发与岛上对外交通 286
论清政府对台湾原住民的政策 307
第三篇：近代台湾历史 327
论近代台湾对外贸易对地方社会经济之影响 327
论沈葆桢与清政府治台政策的转变——以大陆移民渡台及理“番”政策为中心 358
晚清台湾社会的转型及其特征 371
论丘逢甲的生平思想与时代潮流 386
论丘逢甲乙未抗日保台之若干问题 408
主要参考文献 423