第一章 测序技术发展概述 1
第一节 第一代基因测序方法简介 1
第二节 新一代测序技术概述 4
参考文献 21
第二章 Illumina测序建库 25
第一节 DNA测序建库 25
第二节 转录组测序（RNA-seq）建库 80
第三节 小RNA测序建库 163
第四节 简化基因组测序建库 184
第五节 目标序列捕获测序建库 204
第六节 单细胞测序建库 227
参考文献 244
第三章 Illumina仪器操作 246
第一节 簇生成操作流程 246
第二节 测序仪HiSeq操作流程 254
第三节 测序仪MiSeq操作流程 268
第四节 测序仪NextSeq500操作流程 276
参考文献 283
第四章 Illumina测序数据分析方法简介 284
第一节 下机数据的初步处理 284
第二节 DNA测序数据分析简介 291
第三节 转录组测序标准信息分析 304
第四节 建造中等高性能计算机群系统 316
参考文献 323
第五章 PacBio RS测序技术 326
第一节 PacBio RS测序原理 326
第二节 PacBio RS测序DNA样品准备及文库构建流程 328
第三节 SMRT Potal二级分析软件的安装 333
第四节 SMRT Potal数据分析流程 334
第五节 PacBio RS测序应用简介 348
第六节 PacBio测序案例 349
参考文献 350
常用英文简写列表 351